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m6A调节因子在肺腺癌和肺鳞癌中的生物学差异
1
作者
莘华
刘智
张洁莉
《武警医学》
CAS
2023年第6期494-500,共7页
目的探讨m6A调节因子在肺腺癌(LUAD)和肺鳞癌(LUSC)中的生物学差异。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取LUAD和LUSC相关表达谱数据,并利用R分析26个m6A调节因子的潜在靶基因在LUAD和LUSC的肿瘤组织与正常组织之间的表达差异;利用...
目的探讨m6A调节因子在肺腺癌(LUAD)和肺鳞癌(LUSC)中的生物学差异。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取LUAD和LUSC相关表达谱数据,并利用R分析26个m6A调节因子的潜在靶基因在LUAD和LUSC的肿瘤组织与正常组织之间的表达差异;利用癌症蛋白质组图谱(TCPA)的反相蛋白微阵列(RPPA)数据计算26个m6A调节因子在10个肿瘤相关通路的通路活性评分(PAS)与差异;利用TCGA数据库采用单因素Cox回归分析(Univariate COX analysis)和Kaplan-Meier生存分析方法分析m6A调节因子的潜在靶基因对LUAD和LUSC患者预后的影响及差异。结果在26个m6A调节因子中,ZCCHC4、ALKBH1和YTHDF2仅在LUAD的肿瘤组织和正常组织中表达水平差异具有统计学意义,IGF2BP2和YTHDC2仅在LUSC的肿瘤组织和正常组织中表达水平差异具有统计学意义。m6A调节因子在LUAD和LUSC中,参与调控的通路活性存在明显的差异,METTL3、METTL5、METTL14、ZC3H13、RBMX和FTO仅在LUAD中的Apoptosis、Cell cycle、EMT和RAS/MAPK等肿瘤相关通路中发挥激活或抑制功能,EIF3A、YTHDC2和RBM15B仅在LUSC中的PI3K/AKT和TSC/mTOR信号通路中发挥抑制或激活作用。IGF2BP3和IGF2BP3调节因子的表达与LUAD预后生存呈负相关,与LUSC预后生存呈正相关。结论相同的m6A调节因子可能在LUAD和LUSC的生物学过程中发挥着不同的调控功能。
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关键词
肺腺癌
肺鳞癌
m6A
差异表达
通路活性
预后
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职称材料
题名
m6A调节因子在肺腺癌和肺鳞癌中的生物学差异
1
作者
莘华
刘智
张洁莉
机构
中国消防救援学院医院内科
应急总
医院
神经外科
应急总
医院
呼吸与危重症医学科
出处
《武警医学》
CAS
2023年第6期494-500,共7页
文摘
目的探讨m6A调节因子在肺腺癌(LUAD)和肺鳞癌(LUSC)中的生物学差异。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取LUAD和LUSC相关表达谱数据,并利用R分析26个m6A调节因子的潜在靶基因在LUAD和LUSC的肿瘤组织与正常组织之间的表达差异;利用癌症蛋白质组图谱(TCPA)的反相蛋白微阵列(RPPA)数据计算26个m6A调节因子在10个肿瘤相关通路的通路活性评分(PAS)与差异;利用TCGA数据库采用单因素Cox回归分析(Univariate COX analysis)和Kaplan-Meier生存分析方法分析m6A调节因子的潜在靶基因对LUAD和LUSC患者预后的影响及差异。结果在26个m6A调节因子中,ZCCHC4、ALKBH1和YTHDF2仅在LUAD的肿瘤组织和正常组织中表达水平差异具有统计学意义,IGF2BP2和YTHDC2仅在LUSC的肿瘤组织和正常组织中表达水平差异具有统计学意义。m6A调节因子在LUAD和LUSC中,参与调控的通路活性存在明显的差异,METTL3、METTL5、METTL14、ZC3H13、RBMX和FTO仅在LUAD中的Apoptosis、Cell cycle、EMT和RAS/MAPK等肿瘤相关通路中发挥激活或抑制功能,EIF3A、YTHDC2和RBM15B仅在LUSC中的PI3K/AKT和TSC/mTOR信号通路中发挥抑制或激活作用。IGF2BP3和IGF2BP3调节因子的表达与LUAD预后生存呈负相关,与LUSC预后生存呈正相关。结论相同的m6A调节因子可能在LUAD和LUSC的生物学过程中发挥着不同的调控功能。
关键词
肺腺癌
肺鳞癌
m6A
差异表达
通路活性
预后
Keywords
lung adenocarcinoma
lung squamous carcinoma
m6A
differential expression
pathway activity
prognosis
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
m6A调节因子在肺腺癌和肺鳞癌中的生物学差异
莘华
刘智
张洁莉
《武警医学》
CAS
2023
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