兰州地区腹泻患儿中人博卡病毒1~4型流行病学研究

了解兰州地区病毒性腹泻患儿中人博卡病毒1~4型（HBoV1~4型）的流行情况及临床特点,并探讨HBoV与急性胃肠炎的疾病相关性。收集兰州大学第一医院2012年7月至2013年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本331份,采用PCR方法检测人博卡病毒,同时检测常见的肠道病毒。331份标本中共检出博卡阳性标本49例（14.80%）,其中HBoV1~4型分别检测出26例、15例、7例和1例。分析其流行规律发现HBoV相关的腹泻全年散发,无明显季节分布。HBoV感染的患儿年龄为11.04±6.92月龄,高发年龄是7~12月龄。2岁以下患儿占HBoV阳性患儿总数的93.88%。HBoV与其他病毒混合感染率为71.3%,以混合轮状病毒为主。HBoV感染对腹泻患儿的发热和呕吐发生率无明显影响。检测出一例罕见的HBoV4病毒LZFB086,与泰国（序列号JQ267789）参考株的同源性为99.0%。未检测出HBoV2B型。从研究结果得出我国兰州地区人博卡病毒以HBoVl为主,在我国首次发现HBoV4病毒。HBoV1~4与其他病毒的混合感染率高,主要是混合轮状病毒。HBoV可能不是导致急性胃肠炎的致病病原。

从兰州急性腹泻儿童中检出人博卡病毒4型

为了解兰州地区病毒性腹泻患儿中人博卡病毒4(HBoV4)的流行情况,收集兰州大学第一医院2012年7月至2013年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本331份,采用巢式PCR方法检测HBoV。将HBoV阳性序列与GenBank中相关序列进行比较分析,发现1例罕见HBoV4。该株与泰国株(GenBank登录号:JQ267789)核苷酸和氨基酸的同源性为98.9%、98.7%,与美国株(GenBank登录号:GQ506568)核苷酸和氨基酸的同源性为97.6%、97.4%,为典型的HBoV4,是我国首次在腹泻患儿粪便中发现。由进化树及同源性推测HBoV4可能存在两种不同的亚型。上述结果表明,我国首次在腹泻患儿粪便中检出HBoV4,且属于HBoV4两种可能亚型中的一种亚型。

河北卢龙县猪与人G3型A组轮状病毒进化关系研究

对存于中国疾病控制预防控制中心病毒病预防控制所病毒性腹泻室的一例卢龙G3型仔猪GARV LLZ212的主要基因片段VP7、VP4、VP6、VP2和NSP2-5进行扩增,确定其基因型,并探讨其与当地人G3型GARV的进化关系。采用逆转录-聚合酶链式反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR),对LLZ212标本及6例当地儿童G3型GARV阳性标本的VP7、VP4、VP6、VP2和NSP2-5进行扩增,并进行序列测定。应用A组轮状病毒自动分型工具(RotaC v2.0)对各个片段进行分型。应用DNAStar和MEGA5.0软件包与GenBank上的参考株进行同源性和系统进化分析。卢龙猪LLZ212基因型为G3-P[8]-I5-C1-N1-T1-E1-H1,6株人GARV基因型均为G3-P[8]-I1-C1-N1-T1-E1-H1。LLZ212基因片段VP7、VP4、NSP4和NSP5分别与人GARV E885、CMH014/07、Wa和RMC321株同源性最高,且进化树在同一亚枝内;LLZ212基因片段VP6、NSP2和NSP3均与猪GARV PRG921株同源性最高,基因片段VP2与猪GARV OSU株同源性最高,且进化树在同一亚枝内。确定一株罕见G3-P[8]-I5-C1-N1-T1-E1-H1型猪GARV,可能为人-猪重配株,LLZ212基因片段VP7、VP4、NSP4和NSP5与人GARV同源性最高,LLZ212基因片段VP6、VP2、NSP2和NSP3猪GARV同源性最高。

A组轮状病毒实时定量PCR检测方法的研究进展

A组轮状病毒是引起婴幼儿急性肠胃炎的最主要病原之一。目前已建立的轮状病毒检测方法有电镜检测、酶免疫法、反转录PCR法、实时定量PCR法。实时定量PCR法与其他方法相比具有特异性强、敏感度高、可以分型、定量准确等优势。本文就实时定量(Real-time)PCR技术应用于A组RV检测的研究进展进行简单概述。