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我国羊种3型布鲁氏菌的多位点序列分型研究 被引量:47
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作者 周晓艳 陈燕芬 +6 位作者 崔步云 陈泽良 姜海 赵鸿雁 朴东日 李兰玉 王金桃 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期371-375,共5页
目的对2004-2009年从病人标本中分离的羊种3型布鲁氏菌进行遗传多态性分析,了解菌株的遗传特征及遗传进化关系。方法采用多位点序列分型(Multiple locus sequence typing,MLST)技术,对47株布鲁氏菌菌株的7个管家基因、1个外膜蛋白基因及... 目的对2004-2009年从病人标本中分离的羊种3型布鲁氏菌进行遗传多态性分析,了解菌株的遗传特征及遗传进化关系。方法采用多位点序列分型(Multiple locus sequence typing,MLST)技术,对47株布鲁氏菌菌株的7个管家基因、1个外膜蛋白基因及1个基因间区的序列进行测定,将各个基因的序列与标准菌株的等位基因型进行比对,确定其等位基因谱型及菌株序列型(STS),分析与其它ST型间的遗传关系。结果 47株布鲁氏菌中,19株omp25基因与目前已有的等位基因型不同,被定义为1个新的等位基因型,即ST28。其余28株与已知的ST8型的各等位基因型一致。结论我国流行的羊种布鲁氏菌主要是羊3型菌株,国内的菌株与国外菌株遗传背景上有差异。MLST分型可以作为研究布鲁氏菌进化关系的重要手段之一。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 羊种3型 MLST
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16SrDNA序列分析在鉴定布鲁氏菌中的应用 被引量:12
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作者 汤旭 姜海 +5 位作者 赵鸿雁 朴冬日 田国忠 张秋香 崔步云 王桂琴 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1290-1296,共7页
【目的】建立布鲁氏菌的16S rDNA序列分析方法,评价该方法鉴定布鲁氏菌的特异性和实用性。【方法】用PCR扩增布鲁氏菌的16S rDNA片段,将扩增的产物纯化后测序,从GenBank下载与布鲁氏菌易发生血清学交叉反应的细菌的16S rDNA序列。使用DN... 【目的】建立布鲁氏菌的16S rDNA序列分析方法,评价该方法鉴定布鲁氏菌的特异性和实用性。【方法】用PCR扩增布鲁氏菌的16S rDNA片段,将扩增的产物纯化后测序,从GenBank下载与布鲁氏菌易发生血清学交叉反应的细菌的16S rDNA序列。使用DNAMAN软件进16S rDNA序列相似性分析。【结果】在布鲁氏菌中16S rDNA核苷酸序列相似性达到了99.74%,而与其他有血清型交叉反应的菌株相比较,16S rDNA序列间有显著差异。【结论】16S rDNA序列分析是一种快速、简便、特异的鉴定布鲁氏菌的方法之一。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 16S RDNA 鉴定
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多位点可变数目串联重复序列分型方法检测布鲁氏菌分型标准化操作方法的建立和应用 被引量:16
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作者 杨杰 赵素莲 +3 位作者 崔步云 姜海 赵鸿雁 朴冬日 《疾病监测》 CAS 2012年第2期137-140,共4页
目的建立常用布鲁氏菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)的标准化方法及应用研究。方法选取16个位点,通过核酸提取、聚合酶链反应(PCR)、琼脂糖凝胶电泳、毛细管电泳等技术,结合BioNumerics(Version 5.0)软件,对16株布鲁氏菌标准菌... 目的建立常用布鲁氏菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)的标准化方法及应用研究。方法选取16个位点,通过核酸提取、聚合酶链反应(PCR)、琼脂糖凝胶电泳、毛细管电泳等技术,结合BioNumerics(Version 5.0)软件,对16株布鲁氏菌标准菌株和不同地区分离的32株菌株进行分型。结果利用所建立的MLVA方法可以区分16株布鲁氏菌标准菌株,并可以将32株地方株区分为牛种和羊种两大类。结论初步建立了MLVA标准化方法,可以在种的水平鉴定布鲁氏菌,还可以追溯传染源,确定流行趋势。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 多位点可变数目串联重复序列分析 分型 标准化操作程序
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内蒙古自治区乌兰察布市羊种布鲁氏菌HOOF基因分型特征 被引量:9
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作者 刘志国 王妙 +2 位作者 刘日宏 尚修建 崔步云 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期954-958,共5页
目的调查2012—2015年内蒙古自治区乌兰察布市83株布鲁氏菌HOOF分型特征。方法对临床分离的83株布鲁氏菌采用常规方法和AMOS.PCR进行鉴定;利用8个数目可变串联重复序列位点的HOOF分型方法对菌株进行基因分型,并用Hunter—Gaston分辨... 目的调查2012—2015年内蒙古自治区乌兰察布市83株布鲁氏菌HOOF分型特征。方法对临床分离的83株布鲁氏菌采用常规方法和AMOS.PCR进行鉴定;利用8个数目可变串联重复序列位点的HOOF分型方法对菌株进行基因分型,并用Hunter—Gaston分辨指数评估各VNTR位点的多态性和对菌株的综合辨别能力,采用BioNumerics5.0软件聚类分析和构建聚类图。结果83株试验菌全部为羊种布鲁氏菌,全部8个分型位点具有极高的多态性,多态性指数为0.998;其中6个位点(1、2、4~7)的多态性指数≥0.678,其分辨力主要来自多态性指数较高的位点。83株羊种布鲁氏菌聚为8大类76个基因型。6个共享基因型包括13株布鲁氏菌,提示感染患者具有流行病学相关性;另70株菌呈现独特的基因型,提示病原分离自无流行病学相关的散发患者。结论乌兰察布市人布鲁氏菌病流行以散发和局部暴发共存,且散发为主,而交叉感染患者与传染源转移有关。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 羊种布鲁氏菌 HOOF基因分型
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布鲁菌多位点可变数目串联重复序列分析的分型研究 被引量:6
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作者 杨红霞 张秋香 +5 位作者 郝瑞娥 姚素霞 张凡非 李虹 崔步云 姜海 《中华地方病学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期247-250,共4页
目的采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对山西省分离的布鲁菌进行基因型分析。方法2012、2013年,在山西省布鲁菌病(简称布病)监测点,采集已确诊的布病患者血液,进行血培养,对培养出的布鲁菌进行传统的生物分型鉴定... 目的采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对山西省分离的布鲁菌进行基因型分析。方法2012、2013年,在山西省布鲁菌病(简称布病)监测点,采集已确诊的布病患者血液,进行血培养,对培养出的布鲁菌进行传统的生物分型鉴定。选取MLVA的16个位点[分为2组:panel 1、panel 2(包括panel 2A、panel 2B)].对分离的布鲁菌进行MLVA分型,并对分型结果进行聚类分析。结果2012、2013年,共分离47株羊种3型布鲁菌;MLVA分型后进行聚类分析,发现分离的菌株高度同源,均为东地中海型;菌株可分为A群和B群。A群为优势基因群;panel 2B的Bruce04、Bruce16及Bruce30位点的变异度较高。结论在同一年份,相邻地区的布鲁菌菌株MLVA分型结果一致或相近,对追溯传染源、分析布病的流行和爆发有重要意义。Danel 2B的Bmce04、Bruce16及Bruce30位点的变异度高,提示这3个位点对分析研究同一生物型菌株的变异情况有价值。 展开更多
关键词 布鲁菌 多位点可变数量串联重复序列分析 基因 聚类分析
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导读
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作者 姜海 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1247-1247,共1页
布鲁氏菌病是一种人兽共患病,是《中华人民共和国传染病防治法》规定报告的乙类传染病,也是世界发展中国家面临的重要公共卫生问题。布鲁氏菌病曾在我国20世纪50年代广泛流行,严重影响我国人民健康和畜牧业发展。在党和政府的领导下,经... 布鲁氏菌病是一种人兽共患病,是《中华人民共和国传染病防治法》规定报告的乙类传染病,也是世界发展中国家面临的重要公共卫生问题。布鲁氏菌病曾在我国20世纪50年代广泛流行,严重影响我国人民健康和畜牧业发展。在党和政府的领导下,经过多部门和专业机构大力配合,加大防控力度,采取一系列综合防治措施,在70年代布鲁氏菌病疫情得到了有效控制。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 人兽共患病 畜牧业发展 综合防治措施 《中华人民共和国传染病防治法》 疫情 发展中国家
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