中国嗜吞噬细胞无形体分离株多间隔序列分型分析

目的：对我国嗜吞噬细胞无形体分离株进行多间隔序列分型（MST）分型。方法根据GenBank收录的4株无形体全基因组序列，利用Mauve 2.3.1软件行种内基因组比对，选择具有变异间隔区进行引物设计，通过引物特异性及扩增效率等预实验筛选引物，并对实验菌株进行PCR扩增，分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株菌间隔序列拼接后进行分型分析并构建进化树，分析不同地区、不同动物种类来源菌株遗传变异关系。结果共筛选出22对引物，用于我国11株无形体分离株MST分型，SNPs分析显示，碱基转换发生率最高（60.2%，251/417），其中A-G转换居首（18.9%，79/417），颠换占23.0%（96/417），插入及缺失发生率占16.7%（70/417）。11株菌22条间隔序列拼接后（约11047 bp）均为独立变异型。进化分析发现山东省莱州地区重症患者分离株（LZ-H1、H2、H3、H4、H5）及当地长角血蜱分离株LZ-T1与美国Webster株及HZ株聚为一簇，而北京分离株BJ-H1与新疆分离株XJ-H1和XJ-H3聚为一类。莱州地区另一蜱分离株LZ-T2与新疆另外一人源分离株聚为一类，与莱州重症患者分离株遗传关系密切。结论我国无形体分离株间隔序列存在明显的遗传多态性，MST分型技术可用于无形体疫情暴发时的快速诊断和疫情追踪。

山西省宁武县森林革蜱无形体分子流行病学调查

人粒细胞无形体病是由嗜吞噬无形体引起的新发蜱传人兽共患病，在我国一些地区广泛存在。该病传播媒介主要为硬蜱。宁武县是山西省重点林业县，生态环境适宜蜱的生长和繁殖，农林作业及家畜养殖人员多数有蜱暴露史或叮咬史。为此，山西省疾病预防控制中心与中国疾病预防控制中心无形体研究室合作对该地区进行无形体病原体分子流行病学调查。

天津市农牧地区2007-2009年莫氏立克次体、横赛巴尔通体、恙虫病东方体血清流行病学调查

目的 分析天津市农牧地区高危人群蚤传及螨传立克次体病流行趋势.方法 2007-2009年,利用现场流行病学调查方法,以农户为单位随机调查天津地区直属的8个区（县）从事农牧业的人群,并现场采集886份血液标本,采用微量间接免疫荧光检测人群莫氏立克次体、横赛巴尔通体及恙虫病东方体特异IgG抗体,并分析比较不同年份、地区、性别及年龄组人群抗体阳性率变化趋势.结果 3种立克次体抗体阳性率均呈上升趋势.其中莫氏立克次体阳性率变化范围为5.0%～58.2%;横赛巴尔通体为2.6%～14.5%;恙虫病东方体为1.8%～39.8%.3种病原体阳性率较高的地区主要集中在天津市东南部及中部近海低海拔地区.结论 天津地区农牧人群普遍存在蚤传及螨传立克次体感染,并且有逐年上升趋势.

海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株多间隔序列分型

目的采用多间隔序列分型(MST)对从海南省澄迈县发热患者及野鼠分离的62株斑点热群立克次体进行分型研究。方法根据文献检索,应用9对成功用于斑点热群立克次体MST分型引物,对实验62株菌进行PCR扩增及测序。校正后序列进行Blast分析。同时,对序列进行Megalign比对分析单核苷酸多态性(SNPs)。将每株细菌成功测序的6段间隔序列按一定顺序拼接并构建进化树。结果使用6对间隔序列引物扩增实验菌株,结果显示每对引物扩增序列均显示较大的变异性,共获得48个变异型,以h3为代表的主要变异型占21.7%(13/60),剩余的47个变异型为独立型,分别占1.6%。进化树分析结果显示48个变异型均归为一簇。同其他参考菌株比较发现,黑龙江立克次体与上述菌株关系密切。SNPs分析发现位点变异主要以T-C转换及A-G转换为主。结论海南地区斑点热群立克次体分离株非编码间隔序列呈高度变异性。MST分型较传统的血清表型分型以及MLST分型更具有鉴别能力,对未来立克次体暴发流行可提供快速有效的流行株追踪。