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海南省琼中地区寄生蜱携带伯氏疏螺旋体的检测及基因分型研究
被引量:
2
1
作者
张琳
文书
+7 位作者
侯学霞
李沙
杨小娜
陈婷
苗广青
符晓莹
郝琴
朱雄
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
2020年第4期426-429,464,共5页
目的了解海南省琼中地区媒介蜱伯氏疏螺旋体的感染状况,为当地莱姆病的防控提供科学依据。方法在海南省琼中地区收集牛寄生蜱120只,应用普通PCR法扩增16S rRNA基因并测序分析,鉴定蜱种。应用巢式PCR方法,检测蜱的伯氏疏螺旋体带菌率,并...
目的了解海南省琼中地区媒介蜱伯氏疏螺旋体的感染状况,为当地莱姆病的防控提供科学依据。方法在海南省琼中地区收集牛寄生蜱120只,应用普通PCR法扩增16S rRNA基因并测序分析,鉴定蜱种。应用巢式PCR方法,检测蜱的伯氏疏螺旋体带菌率,并对测序结果进行同源性比较以确定基因型。结果本次海南省琼中地区牛寄生蜱经鉴定均为微小牛蜱。在120只蜱标本中,有44只蜱伯氏疏螺旋体检测阳性,阳性率为36.67%。同源性分析表明,琼中地区的微小牛蜱可感染多种基因型的伯氏疏螺旋体,包括Borrelia afzelii(56.82%)、B. yangze(25.00%)和B. garinii(18.18%)基因型。结论琼中地区微小牛蜱中携带多种基因型的伯氏疏螺旋体,并且带菌率较高,有传播莱姆病的风险,应进一步加强当地人群和宿主的莱姆病调查和评估。
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关键词
蜱
伯氏疏螺旋体
生物信息分析
琼中地区
原文传递
可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
被引量:
1
2
作者
周鑫
侯学霞
+3 位作者
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013年第2期98-102,共5页
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个...
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个基因型,其中21个独立基因型,成簇率达24/31,MLVA的分辨率达到0.969;MLSA可将31株伯氏疏螺旋体分成4簇,每株都可独立分析,但有3个节点步长值(Bootstrap value)<50%。结论 MLVA和MLSA两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究,对于部分分型有异议的菌株,将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺旋体的分型鉴定。
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关键词
多位点序列分析
多位点可变数目串联重复序列分析
伯氏疏螺旋体
基因分型
原文传递
题名
海南省琼中地区寄生蜱携带伯氏疏螺旋体的检测及基因分型研究
被引量:
2
1
作者
张琳
文书
侯学霞
李沙
杨小娜
陈婷
苗广青
符晓莹
郝琴
朱雄
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所莱姆病室
海南省琼中黎族苗族自治县人民医院
海南省三亚人民医院
出处
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
2020年第4期426-429,464,共5页
基金
“十三五”国家科技重大专项(2017ZX10303404-006-003,2018ZX10101002)
海南省重点研发计划项目课题基金(ZDYF2017163)
海南省卫计行业科研项目(16A200051,19A200039)。
文摘
目的了解海南省琼中地区媒介蜱伯氏疏螺旋体的感染状况,为当地莱姆病的防控提供科学依据。方法在海南省琼中地区收集牛寄生蜱120只,应用普通PCR法扩增16S rRNA基因并测序分析,鉴定蜱种。应用巢式PCR方法,检测蜱的伯氏疏螺旋体带菌率,并对测序结果进行同源性比较以确定基因型。结果本次海南省琼中地区牛寄生蜱经鉴定均为微小牛蜱。在120只蜱标本中,有44只蜱伯氏疏螺旋体检测阳性,阳性率为36.67%。同源性分析表明,琼中地区的微小牛蜱可感染多种基因型的伯氏疏螺旋体,包括Borrelia afzelii(56.82%)、B. yangze(25.00%)和B. garinii(18.18%)基因型。结论琼中地区微小牛蜱中携带多种基因型的伯氏疏螺旋体,并且带菌率较高,有传播莱姆病的风险,应进一步加强当地人群和宿主的莱姆病调查和评估。
关键词
蜱
伯氏疏螺旋体
生物信息分析
琼中地区
Keywords
Tick
Borrelia burgdorferi
Bioinformatic analysis
Qiongzhong area
分类号
R377 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
被引量:
1
2
作者
周鑫
侯学霞
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
机构
山西医科大学微生物与免疫教研
室
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所莱姆病室
出处
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013年第2期98-102,共5页
基金
国家自然科学基金(31100105)
国家科技重大专项课题(2013ZX10004-001)~~
文摘
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个基因型,其中21个独立基因型,成簇率达24/31,MLVA的分辨率达到0.969;MLSA可将31株伯氏疏螺旋体分成4簇,每株都可独立分析,但有3个节点步长值(Bootstrap value)<50%。结论 MLVA和MLSA两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究,对于部分分型有异议的菌株,将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺旋体的分型鉴定。
关键词
多位点序列分析
多位点可变数目串联重复序列分析
伯氏疏螺旋体
基因分型
Keywords
Multi-locus sequence analysis
Multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis
Borrelia burgdorferi sensulato
Genotyping
分类号
R377 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南省琼中地区寄生蜱携带伯氏疏螺旋体的检测及基因分型研究
张琳
文书
侯学霞
李沙
杨小娜
陈婷
苗广青
符晓莹
郝琴
朱雄
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
2020
2
原文传递
2
可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
周鑫
侯学霞
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013
1
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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