东港市2014年甲型肝炎病毒流行株基因分型研究

目的了解辽宁省东港市2014年甲型肝炎（甲肝）病毒（Hepatitis A Virus,HAV）流行株基因型特征,为HAV溯源研究奠定基础。方法收集东港市部分甲肝病人血清标本,HAV结构-非结构区基因VP1-2A引物,经核酸提取,逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）,序列测定,对HAV基因进行序列同源性及亲缘关系分析。结果本次检测到的东港市HAV都属于1A亚型,核苷酸序列同源性为98.1%-100%,与中国河北省、日本及韩国的流行株VP1-2A编码区基因有相同序列或同源性较高。结论东港市有多株HAV存在,流行可能有多个传染链,在人群免疫水平较低时,引起甲肝流行。