2009—2019年北京市朝阳区甲型H1N1流感病毒HA基因特征分析

目的分析北京市朝阳区2009—2019年甲型H1N1流感病毒(H1N1)血凝素(hemagglutinin,HA)基因特征,了解朝阳区H1N1变异情况,为评估流感疫苗有效性提供依据。方法从GenBank数据库和GISAID平台下载2009—2019年流感疫苗推荐株以及各分支主要流行株和代表株序列,与北京市朝阳区46株H1N1北京分离株的HA基因序列进行系统进化分析和氨基酸变异分析。利用MEGA 5.0软件邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统进化树并查看氨基酸变异位点,同时采用NetNGlyc 1.0在线软件分析HA基因潜在的糖基化位点。结果北京市朝阳区46株H1N1分离株HA基因分别属于Clade 7、Clade 8、6B、6B.1、6B.2及6C等分支。除2009年以外,2012—2019年H1N1北京市朝阳区分离株与对应年度疫苗株比较接近,同源性为90%以上。各年份H1N1北京市朝阳区分离株在4个抗原决定簇区均有氨基酸变异发生,近年H1N1北京市朝阳区分离株所在的6B.1分支序列均有S74R(Cb区)、S164T(Sa区)共同氨基酸变异;除了6B.1A2分支,其余6B.1分支序列均增加1个糖基化位点162 NQTY,其中6B.1新分支同时在162位点(Sa区)上发生氨基酸共同变异导致其糖基化位点162 NQTY转变为162 NQSY;其中,A/Beijing-Chaoyang/SWL465/2019北京市朝阳区分离株的受体结合部位发现氨基酸共同变异位点,分别位于190螺旋的D/V187A位和220环的R223Q位。结论2009—2019年北京市朝阳区H1N1分离株的HA基因不断发生变异,总体与对应年度疫苗株比较接近,但仍有抗原决定簇和受体结合部位发生氨基酸变异、糖基化位点增加,提示持续监测H1N1的HA基因的必要性,并可为流感疫苗筛选和疫情防控提供参考。