云南省麻疹野病毒不同基因型的流行分布状况

目的了解云南省麻疹野病毒不同基因型的流行分布状况。方法用B95a细胞[Epstein-Barr(EB) Virus-Transformed,Marmoset B Lymphoblastoid Cell Line;埃泼斯坦-巴尔病毒转化的绒猴淋巴母细胞]和Vero/SLAM细胞[Vero Cell Transfected to Express the Human Signaling Lymphocyte Activation Molecule(SLAM),淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞]从麻疹爆发和散发患者的标本中分离麻疹野病毒,用逆转录-聚合酶链反应扩增核蛋白(Nucleoprotein,N)基因羧基末端的676个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定。并以N基因羧基末端450个核苷酸序列构建基因亲缘性关系树,进行核苷酸变异分析。结果云南省2004～2011年共分离和检测到46株麻疹病毒及2株病毒核酸,43株为H1基因型,分布于14个县(区)及四川省普格县;4株为d11基因型,分布于边境孟连县及缅甸的班康市;1株为A基因型,来自龙陵县。结论麻疹病毒H1基因型是云南省优势本土基因型,d11基因型是从缅甸输入后连续两年于缅甸接壤的地区发现的麻疹野病毒,A基因型为中国沪191疫苗株相似株。

2008-2015年内蒙古自治区风疹病毒分子流行病学分析

目的对2008-2015年在内蒙古地区分离的风疹病毒进行分子流行病学研究,为该地区风疹防控策略的制定提供病毒学数据。方法使用Vero细胞、Vero/SLAM细胞对2008-2015年在内蒙古6个市/盟风疹暴发和散发病例中采集的125份咽拭子和尿液标本进行病毒分离,鉴定后使用RT-PCR方法扩增阳性风疹病毒分离株E1基因的1 107个核苷酸序列,并对该PCR产物进行序列测定和分析,并基于世界卫生组织(WHO)基因定型靶序列739个核苷酸序列构建基因亲缘关系树。结果 2008-2015年在内蒙古地区共分离获得14株风疹病毒株,分属1E-Cluster A基因型(13株,2008-2014年)和2B-Lineage 3基因型(1株,2015年)。1E基因型风疹病毒于2008年首次分离到,为内蒙古地区风疹病毒流行的优势基因型,并呈现了多个不同的病毒传播链。2B基因型风疹病毒在2015年首次分离到,并与2011年安徽淮南代表株形成一个进化分支。序列分析结果显示,2008-2015年内蒙古地区流行的14株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2015年1株代表株在E1蛋白中和抗原决定簇的257位由Leu变为Phe,其余毒株在重要功能位点均未发生变异。结论 2008-2015年内蒙古地区流行的风疹病毒是以1E(Cluster A)和2B(Lineage 3)基因型流行引起的多个传播链所致,与我国其他省份流行情况一致。本研究为内蒙古地区风疹的防控提供了一定的风疹病毒分子流行病学基线数据。

人鼻病毒的研究进展

1概述 急、慢性呼吸道感染是最常见的人类疾病。据统计,平均每人每年发生呼吸道感染的几率大于30%,在儿童中的发病率和病死率更高。除细菌外,病毒是引起呼吸道感染的重要的病原微生物之一。

上海市2002年柯萨奇病毒A组16型基因特征分析

目的分析上海市2002年引起手足口病(Hand-foot-mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus A16,CVA16)的基因特征。方法对从上海市2002年HFMD患者标本中分离到的CVA16,采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)扩增VP1基因片段全长,并对扩增产物进行测序。根据VP1基因核苷酸序列与其它CVA16毒株序列(来源于基因库)构建亲缘性关系树,并且进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果从上海市2002年HFMD患者标本中共分离到7株CVA16,核苷酸和氨基酸的同源性分别为88.8%～99.7%和99.3%～100.0%,7株CVA16同属于B基因型,但分属不同分支。除了SH-18-CHN02毒株属于分支1外,其余6株CVA16毒株皆属于分支2。结论引起2002年上海市HFMD流行的CVA16毒株均为B基因型,但与中国大陆以往分离到的CVA16毒株存在差异,提示CVA16毒株在中国大陆已传播了较长时间,B基因型有多个不同分支的CVA16毒株传播链曾在中国大陆流行。因此应加强对2008年HFMD爆发中分离到的CVA16的分子流行病学监测,以阐明现阶段流行的CVA16基因型别和基因特征。

一起水痘爆发的病毒分离鉴定及血清学分析

目的对上海市闸北区2007年一起水痘爆发进行病原学鉴定和血清学分析。方法对采集的双份血清用酶联免疫吸附试验进行水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster Virus,VZV)IgM和IgG抗体检测,采用疫苗生产用的VZV敏感细胞--人胚肺成纤维细胞(MRC-5),对采集的疱疹液进行病毒分离以及标准血清中和鉴定,并通过特异性的引物对病毒分离株进行聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增。结果采集到的5例病人的双份血清中,急性期血清IgM阳性2份,IgG阳性1份,灰区2份;恢复期血清IgG均为阳性,其中4份标本IgG抗体滴度≥4倍升高。从采集的5份疱疹液标本中均分离到致细胞病变的病毒,经VZV标准血清中和鉴定,证实为VZV。PCR扩增产物电泳结果显示,在目的条带处均有单一的特异性条带。结论该次爆发是由VZV引起的,水痘减毒活疫苗(Varicella Virus Attenuated Live Vaccine,VarV)的作用已被证实,但该次水痘爆发中,47.4%的患者在出生后3年内曾接种过国产或者进口VarV,应深入研究VarV的免疫策略。

吉林省两起风疹爆发分离的风疹野病毒的基因型分析

目的了解致吉林省2008年两起风疹爆发的风疹病毒的基因特征,以确定风疹病毒基因型。方法对采集的患者咽拭子标本进行病毒分离,通过逆转录-聚合酶链反应及序列分析方法,利用生物信息学软件确定基因型。结果 7株风疹病毒核酸鉴定呈现阳性,基因型鉴定均为1E基因型,与世界卫生组织风疹病毒1E基因型参考株(T14-CH-02-1E)核苷酸同源性为98.6%～99.0%,氨基酸同源性100%。结论吉林省2008年两起风疹爆发均由1E基因型的风疹病毒引起,为吉林省风疹病毒分子流行病学研究提供了基础资料。

鼻病毒在婴幼儿下呼吸道感染中作用的研究

目的探讨鼻病毒在婴幼儿下呼吸道感染中的作用。方法收集2008年5月到2009年4月北京儿童医院下呼吸道感染住院儿童鼻咽分泌物标本240份，使用Real-timeRT-PCR方法筛选鼻病毒阳性标本，并进行统计分析。结果在240例住院儿童中，入院诊断为肺炎的208例，占86．67％（208／240），支气管炎21例（8．14％），毛细支气管炎11例，无死亡病例，男女病例比例为1．93：1，且2009年2月采集标本数达到最多。采用Real-timeRT-PCR方法检测为鼻病毒阳性的标本71份，阳性率为29．58％（71／240），且主要的临床诊断症状是肺炎。发病年龄以2岁以下婴幼儿为主，占81．69％（58／71），其中以13～18月、324月年龄组发病率最高，发病率为33．33％。结论鼻病毒感染季节为春季和冬季，尤以2岁以下婴幼儿感染为主，主要症状表现为肺炎、支气管炎及毛细支气管炎等下呼吸道感染。鼻病毒流行具有季节性，且传染性强，传播速度快，应做好医院内防护措施，避免交叉感染。