中国历年H_3N_2亚型人流行性感冒病毒血凝素基因的序列测定及分析

测定了 2 7株中国 196 8～ 2 0 0 0年的人H3 N2 亚型流行性感冒 (流感 )病毒分离株HA1基因的核苷酸全序列 ,其中包括 7株流行代表株 :A3/Beijing/ 1/ 6 8、A3/Guangdong/ 2 4 3/ 72、A3/Beijing/ 39/ 75、A3/Guangdong/ 38/ 77、A3/Beijing/ 2 6 6 / 85、A3/Beijing/ 30 / 95、A3/Shanghai/ 1/ 98。阐明了这些流感病毒分离株的基因结构、变异本质、进化发展过程以及这些毒株与其它分离株之间的遗传进化亲缘关系 ,为应用生物信息学研究流感病毒基因组变异规律等打下了基础。初步的进化分析表明 ,历年来的人流感病毒H3 N2 亚型的起源和进化分为两个分支谱系 ,并在 1984 /1985年进行了交替转换 ;且有一部分人的H3 N2

逆转录环介导等温核酸扩增技术(RT-LAMP)在H5N1禽流感病毒基因检测中的应用

建立一种便捷、灵敏的检测方法,即逆转录环介导等温核酸扩增技术(RT-LAMP)用于H5N1亚型禽流感病毒基因检测。该技术使用特异对应于靶序列中8个基因区段的6条特异引物,在等温条件下进行核酸扩增反应。对51份实验感染动物及病毒培养标本的H5N1亚型禽流感病毒的HA、NA基因区进行了RT-LAMP检测,并以SYBR Green I为反应指示剂进行了逆转录环介导等温核酸扩增技术,对该反应进行实时监控,经对扩增产物做内切酶验证和测序分析,证明RT-LAMP技术的特异性;同时,用10倍系列稀释的RNA样品对该检测方法的灵敏度进行了测试。结果显示:利用RT-LAMP技术成功检测到H5N1禽流感病毒的HA、NA基因区,且RT-LAMP与Real-time PCR结果呈现很好的一致性。此方法的灵敏度可达到能检测10个拷贝RNA分子水平。因此,RT-LAMP技术应用于H5N1亚型禽流感病毒的快速检测是一种可行的方法。

中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株感染性全基因组cDNA克隆的构建与分析

报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个连续的A,通过DNA重组技术组装成病毒基因组全长cDNA克隆.该克隆可在大肠杆菌DH5a中稳定扩增.经体外转录,RNA转录体转染BHK-21细胞,细胞发生病变,恢复病毒滴度达到107～108pFU/ml.全基因组cDNA克隆构建过程中引入的沉默突变(8 453位核苷酸由C变为T)产生Xba Ⅰ酶切位点作为遗传标记,在子代恢复病毒的基因组中稳定存在.从细胞病变的特征、BHK-21细胞的空斑形态、病毒的抗原性、病毒在细胞中的生长动力学特征以及对乳鼠的致病性等方面比较,恢复病毒和亲本病毒XJ-160没有显著区别,提示获得了具有感染性的XJ-160病毒全长cDNA克隆.该病毒感染性全基因组cDNA克隆可以作为反向遗传学系统,为进一步研究病毒复制和致病机制,以及开发相应的载体表达系统提供分子生物学工具.

滚环复制技术的建立及在RNA病毒基因检测中的初步应用

滚环复制是噬菌体繁殖所采取的一种基因复制方式,这种方式可使单链的环形分子在聚合酶和引物的作用下进行体外自我扩增。本文中用可特异性连接环化的寡核苷酸链作为探针,分别进行了1份细胞培养的禽流感病毒H5N1亚型样品、1份细胞培养的SARS病毒样品和4份丙型肝炎病毒阳性血清样品的检测。检测原理是探针与靶序列杂交后便可在T4DNA连接酶的作用下形成滚环复制中的环化单链分子,该分子在同温下可被特异性引物滚动复制和支链扩增。本文还利用按禽流感病毒NA1基因区序列合成的模拟DNA分子对该检测方法的灵敏度进行了测试。结果显示:利用固相RCA技术成功检测到三种RNA病毒的基因,该方法的灵敏度可达到能检测103拷贝模式DNA分子的水平。与传统的PCR方法敏感性的比较尚待进一步研究。

嵌合中国分离株基因的丙型肝炎病毒(1b/2a)细胞培养模型的建立

目的:建立嵌合中国分离株基因的丙型肝炎病毒(HCV)细胞培养模型。方法:利用3片段融合PCR的方法将中国HCV河北分离株(1b)的全长包膜蛋白基因引入JFH1(2a)株基因骨架,构建包膜蛋白基因区相互置换的嵌合HCV(1b/2a)全长基因组,经线性化后体外转录获得全长RNA,转染Huh7.5.1细胞系,用免疫荧光及蛋白印迹实验检测。结果:该RNA可以产生具有体外感染活性的嵌合HCV,且感染性可在共同培养的细胞间传播。结论:首次在国内建立了嵌合中国HCV分离株基因的HCV细胞培养体系。

病毒基因组的转录调节

基因表达调节是分子生物学中一个核心问题,也是分子病毒学的一个中心环节。在有严格节奏的病毒繁殖周期中,何时与如何进行早期转录,如何起始基因组复制,何时与如何起始晚期转录,早期转录与晚期转录又是如何协调的,病毒复制与宿主细胞的代谢又是如何互相作用的,为什么有些病毒在这些细胞内可以繁殖,在另一些细胞中则不能繁殖,为什么有些病毒会有致癌性,等等,无一不涉及病毒基因组的转录调节这一根本机理。

人乳头瘤病毒预防性疫苗的成本效益分析

宫颈癌是妇科常见恶性肿瘤,在我国女性恶性肿瘤中排名第二,仅次于乳腺癌,且近年来年轻化的趋势特别明显,人乳头瘤病毒是宫颈癌发生的必需因子,目前宫颈癌的预防性疫苗已经上市,但是疫苗的成本较高,发展中国家要实行全民注射疫苗仍有困难。本文就宫颈癌的预防性疫苗成本效益做一阐述。

中国流行性乙型脑炎病毒分子生物学特性研究

为了从分子水平了解中国流行性乙型脑炎(乙脑)病毒与国外分离株的差异,对1949年以来在中国乙脑主要流行地区分离的19株乙脑病毒的PrM C区及E蛋白基因区的核苷酸序列进行了对比研究,以期了解不同时间不同地区在中国流行的乙脑病毒的分子差异。结果显示:病毒生物学初步鉴定显示,病毒感染BHK细胞后56h所有细胞均发生病变,约50%以上细胞脱落(CPE );3日龄乳鼠接种病毒72h之内死亡;所有病毒均与乙脑病毒(A2株)抗血清发生阳性反应,但反应强度不同,提示所有病毒均为乙脑病毒。病毒PrM C(456～695)区核苷酸序列与各个国家及地区、各个基因型以及各个年代的73株乙脑病毒相应序列,用Woan RuChen建立的方法进行基因分型分析,结果显示,所有19株中国分离的病毒均属于基因型Ⅲ型,与国外相关文献所报道的乙型脑炎病毒中国分离株的基因型相符。以乙型脑炎病毒疫苗株P3株为标准,对各病毒E蛋白500个氨基酸序列进行分析。各毒株核苷酸差异在0和4 2%之间,氨基酸差异在0和4 0%之间。所有核苷酸差异均为碱基的替换,无论核苷酸或氨基酸均无插入或丢失。大多数核苷酸变异在氨基酸编码的第三位,属于沉默突变,不引起氨基酸变化。18株病毒E蛋白活性结构域与疫苗株P3株相比共有247个氨基酸的差异,平均每株病毒有12 35个氨基酸的差异,?

表达流行性感冒病毒HA基因非复制型重组腺病毒的构建及免疫效果的研究

通过RT PCR扩增流行性感冒(流感)病毒HA基因,克隆至腺病毒穿梭载体pAdTrack CMV,该重组质粒与腺病毒DNA共转化E.coliBJ5183,通过细菌内同源重组获得重组腺病毒DNA,将其转染293细胞获得重组腺病毒。PCR证实HA基因已整合至腺病毒基因组中,Westernblot结果检测到重组病毒感染293细胞中HA的表达。重组病毒经滴鼻和灌胃两种途径免疫小鼠,结果2次免疫后滴鼻组和灌胃组均产生明显的免疫应答,血清IgG抗体滴度分别为1∶10000和1∶1000。除血清IgG外,还在肺灌洗液中检测到分泌型IgA。滴鼻组的免疫效果强于灌胃组。经小剂量攻毒实验显示,重组腺病毒保护率为100%。该文成功构建了表达流感病毒HA基因的非复制型重组腺病毒,重组病毒免疫小鼠可产生较好的免疫效果。

甲型H1N1流感病毒HA基因RT-LAMP检测方法的建立与初步应用

目的:建立反转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)检测甲型H1N1流感病毒HA基因的方法,并用于检测临床样本。方法:通过在线软件Primer Explorer V4设计H1N1 HA基因的RT-LAMP引物,建立RT-LAMP检测方法,并评价其灵敏度和特异度。结果:与传统RT-PCR方法相比,RT-LAMP检测方法具备更高的灵敏度,达到10个拷贝,并且具有良好的特异性;在76份呼吸道感染儿童的咽拭子标本中检测到2份阳性,与RT-PCR方法检测结果相同。结论:建立的H1N1 RT-LAMP检测方法灵敏特异,简单快速,具备H1N1现场检测应用前景。

表达流感病毒神经氨酸酶基因的重组腺病毒的构建

通过RT-PCR方法扩增流感病毒神经氨酸酶基因,将其克隆到腺病毒穿梭载体pTrackCMV,此重组质粒与腺病毒DNA共转化大肠杆菌BJ5183,通过细菌内同源重组获得重组腺病毒DNA,将其转染293细胞获得重组腺病毒。经PCR证实目的基因已整合至腺病毒基因组中,western blot检测到神经氨酸酶的表达。重组病毒经滴鼻和灌胃两种途径免疫小鼠,结果表明2次免疫后滴鼻组和灌胃组均产生明显的免疫应答反应,滴鼻组的免疫效果优于灌胃组。

我国单纯疱疹病毒Ⅰ型168株糖蛋白D基因的克隆及序列分析

依据HSV-1 Patton株糖蛋白D全基因序列,设计、合成一对引物,利用多聚酶链反应(PCR),从我国HSV-1 168株基因组DNA中扩增、克隆出糖蛋白D全基因序列,共1185bp,编码395个氨基酸,并将其推测的氨基酸序列同国外HSV-1 HFEM、SCl6、17和Patton株的糖蛋白D的氨基酸序列进行了详细比较,发现最保守的区域主要是除信号肽以外的胞外编码区。氨基酸的变异主要分布在信号肽区、跨膜区及胞浆内编码区。本工作对研究HSV-1糖蛋白D的结构和功能以及研制我国HSV-1基因工程疫苗都具重要意义。

携带人血管抑制因子K1-5基因的腺相关病毒载体的构建及其对血管内皮细胞的抑制作用

目的构建含人血管抑制因子K15基因的重组腺相关病毒载体rAAVK5,研究其在体外表达及对血管内皮细胞的抑制作用。方法将K15基因插入通用型AAV载体质粒pSNAV中,构建重组质粒pSNAVK5。用pSNAVK5转染BHK21细胞,经G418选择培养基培养载体细胞株BHKK5。用辅助病毒感染BHKK5细胞包装出重组病毒rAAVK5。研究rAAVK5感染BHK细胞获得的培养上清对血管内皮细胞的抑制作用。结果已获得了重组病毒rAAVK5,滴度达0.5×1012v.g.ml。免疫斑点印迹实验表明,rAAVK5可介导人血管抑制因子K15的体外表达,表达产物对血管内皮细胞增殖具有抑制作用。结论重组病毒rAAVK5在体外对血管内皮细胞的增殖具有抑制作用。为进一步用rAAV病毒载体进行抗血管生成基因治疗的动物实验及临床应用打下了基础。

人乳头瘤病毒6b型H增强子样序列在大肠杆菌中增强基因转录和β-干扰素表达

将人乳头瘤病毒６ｂ型（ＨＰＶ６ｂ）基因组上游调控区（ＵＲＲ）５４０ｂｐ的Ｓａｕ３Ａ－ＮａｒＩ片段（Ｈ序列），正反向插入β－干扰素表达载体Ｔｒｐ启动子上游，使β－ＩＦＮ表达明显增强，可使基因表达水平提高３．６倍（正向）和２．１倍（反向）。Ｈ序列正反向插入增强子检测载体不仅使β－半乳糖苷酶表达活性增加５－１０倍，还能使半乳糖苷酶ｍＲＮＡ量明显增高，证明Ｈ序列对被调控基因的增强作用是发生在转录水平。

乙型肝炎病毒表面抗原preS2+S基因在Pichia Pastoris酵母系统的分泌表达

拟获得adw2亚型乙型肝炎(乙肝)病毒表面抗原preS2+S基因在PichiaPastoris酵母分泌型表达系统(pPIC9K)的高效表达。实验首先将adw2亚型乙肝病毒表面抗原preS2+S基因重组到分泌型酵母表达载体(pPIC9K)形成表达质粒,电转化酵母细胞KM71,G418筛选多拷贝整合克隆,经甲醇诱导表达并用SDS-PAGE电泳及酶免疫法检测表达产物。经100个克隆筛选获得了表达量较高的表达菌株WC4。该菌株甲醇诱导后细胞上清10倍浓缩SDS-PAGE电泳检测显示,细胞上清中有特异蛋白条带,且第6天表达量最高,表达产物单体分子量为31kD左右。用美国雅培公司AUZYMEMONOCLONAL试剂盒估算表达量为2μg/100OD600细胞。上述结果表明,乙肝病毒表面抗原preS2+S基因在本系统中获得了分泌表达。同时检测了酵母细胞裂解液中特异蛋白质的表达,结果发现,自甲醇诱导后第一天即可检测到表达产物,而且除了第6天细胞外表达量高于细胞内外,其余各天的表达水平均表现为细胞内高于细胞外。以上结果提示,利用分泌型酵母表达系统表达乙肝病毒表面抗原在技术上可行,但表达产量偏低,一些蛋白滞留在细胞内未能分泌到培养基中。

鸡减蛋综合征病毒(EDSV-76)基因组E1区结构特点分析

ＥＤＳＶ－７６病毒中国株ＡＡ－２经常规方法提取其病毒ＤＮＡ后，建立了限制性内切酶ＰｓｔＩ水解片段的全基因文库。对其中ＰｓｔＩ－Ｇ片段和ＰｓｔＩ－Ａ片段的正反链进行序列测定，获得ＥＤＳＶＥ１区（０－８．８ｍ．ｕ）的核苷酸序列。经分析，ＥＤＳＶＥ１区具有与其他腺病毒Ｅ１区类似的结构。以大于６０个氨基酸残基为标准，ＥＤＳＶＥ１区共有７个开放读码框架（ＯＲＦ），其中Ｒ１、Ｒ２、ＥｌｂｓＴ和Ｅ１ｂ１Ｔ由ｒ链编码，其余分布在Ｌ链上，而且一些与腺病毒复制、转录有关的基序在ＥＤＳＶＥ１区中也较为保守。

EBV-LMP1基因杆状病毒表达载体的构建及其在昆虫细胞中的表达

目的 构建EBV LMP1基因的杆状病毒重组供体质粒 ,包装重组LMP1的杆状病毒 ,感染昆虫细胞进行表达。方法 先将已克隆的LMP1cDNA与线性化的pFASTBACHTb进行连接 ,使pFASTBACHTb LMP1与DH1 0BAC感受菌进行转座重组 ,利用抗性及蓝白斑筛选重组Bacmid/LMP1克隆 ,提取Bacmid/LMP1转染昆虫细胞Sf9包装杆状病毒 ,利用病毒感染Sf9细胞进行蛋白表达 ,通过免疫荧光、SDS PAGE和Western blot检测表达情况。结果 获得了重组LMP1的杆状病毒 ,细胞能表达出与LMP1单抗结合的蛋白 ,分子量为 6 3kDa左右 ,细胞可直接分泌LMP1蛋白至上清。结论 LMP1能在昆虫细胞中获得良好表达 。

表达人GM-CSF重组痘苗病毒抗肿瘤作用的实验研究

将ｈＧＭ－ＣＳＦｃＤＮＡ插入含有Ｐ１１ｋ及Ｐ２５ｋ双向启动子的痘苗病毒载体ｐＪ１２０的Ｐ１１ｋ启动子下游，而Ｐ２５ｋ下游则为ＬａｃＺ基因，构建成表达质粒ｐＪ１２０／ＧＭ－ＣＳＦ。以此质粒与痘苗病毒天坛株共转染ＴＫ－１４３细胞，在ＢＵｄＲ存在下，利用蓝斑筛选及纯化获得重组病毒ＲＶＪ１２０／ＧＭ－ＣＳＦ，Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ和ＰＣＲ－Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ结果均证实，重组病毒ＤＮＡ中ＧＭ－ＣＳＦ基因整合，ＴＦ１测活显示重组病毒可表达有活性的ＧＭ－ＣＳＦ，且分泌到上清中。将表达ＧＭ－ＣＳＦ的重组痘苗病毒体外感染肿瘤细胞制备的裂解物，接种于荷瘤大鼠，能明显地抑制大鼠Ｗａｌｋｅｒ实体瘤的生长。