利用TCGA数据库探讨BRCA基因突变与卵巢高级别浆液性癌临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗预后的预测

目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素。方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁)的临床信息及BRCA基因测序数据,根据是否发生BRCA基因突变分为突变组(176例)和野生组(344例),分析BRCA基因突变与临床病理特征的相关性,比较突变组和野生组总生存期和无进展生存期,利用单因素和多因素COX回归分析探究卵巢高级别浆液性癌预后的独立预测因素。结果突变组和野生组HBOC家族史、恶性肿瘤家族史和铂类药物敏感性差异有统计学意义(P<0.05),年龄、国际妇产科联盟(FIGO)分期、术后残存肿瘤直径、血清糖类抗原(CA)125、血清CA199、血清人附睾蛋白(HE)4、淋巴结转移、分化程度差异无统计学意义(P>0.05);经相关性分析,BRCA基因突变与HGSCO家族史、恶性肿瘤家族史、铂类药物敏感性存在显著相关性(P<0.05)。经Kaplan Meier生存分析,BRCA基因突变组总生存期和无进展生存曲线与BRCA野生组差异有统计学意义(P<0.05),BRCA基因突变组5年总生存率和无进展生存率显著高于野生组(P<0.05)。单因素和多因素COX回归分析表明,FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、术后残存肿瘤直径≥2 cm、血清CA125≥1000 U/ml、淋巴结转移是HGSOC不良预后独立风险因素(P<0.05),铂类药物敏感和BRCA基因突变是HGSOC预后的保护因素(P<0.05)。结论BRCA基因突变的HGSOC患者对铂类药物具有较好的敏感性,同时具有较好的生存期,BRCA基因突变是影响患者预后的独立预测因素。

不同分子亚型乳腺癌中骨形态发生蛋白9及胰岛素样生长因子-1的表达及其与临床特征的相关性

目的探讨骨形态发生蛋白9(BMP-9)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)在不同分子亚型乳腺癌中表达及其与临床特征的相关性。方法根据不同乳腺癌分子亚型,将98例乳腺癌患者分为Luminal A型组(n=23)、Luminal B型组(n=26)、HER-2过表达型组(n=24)和Basal-like型组(n=25)。比较4组患者BMP-9、IGF-1表达水平,并分析BMP-9、IGF-1表达水平与临床体征的关系。结果在98例乳腺癌中,BMP-9阴性表达36例,阳性表达62例。HER-2过表达型组和Basal-like型组BMP-9 mRNA水平和BMP-9蛋白阳性率低于Luminal A型组和Luminal B型组,且Luminal B型组低于Luminal A型组,差异有统计学意义(P <0.05)。在98例乳腺癌中,IGF-1阴性表达36例,阳性表达62例;HER-2过表达型组和Basal-like型组IGF-1mRNA水平和IGF-1蛋白阳性率高于Luminal A型组和Luminal B型组,且Luminal B型组高于Luminal A型组,差异有统计学意义(P <0.05)。BMP-9表达与患者肿瘤直径、淋巴结转移数目和TNM分期呈负相关;IGF-1表达与患者肿瘤直径、淋巴结转移数目和TNM分期呈正相关。结论 BMP-9、IGF-1的表达与乳腺癌患者临床分子亚型有关。在临床工作中,BMP-9、IGF-1可作为乳腺癌检测指标,以预测患者临床治疗效果。

儿童脊髓性肌萎缩症2型患者血浆中环状RNA的表达谱分析

目的分析儿童脊髓性肌萎缩症(SMA)2型患者血浆中环状RNA(circRNA)的表达谱变化。方法选取2021年9月—2022年3月安徽省儿童医院神经内科住院治疗的儿童SMA2型患者5例为SMA组,同期健康对照者5例为对照组。采用高通量测序技术检测并筛选出血浆中差异表达的circRNA,应用生物信息学进行基因本体论(GO)注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和Reactome通路富集分析。利用在线数据库预测circRNA可能靶向的微小RNA(miRNA)。结果与对照组相比,SMA组患者血浆中共有136个circRNA呈显著差异性表达(P<0.05,差异倍数≥1.5),包括55个表达上调和81个表达下调的circRNA。生物信息学分析发现,同源重组修复、DNA复制等通路在SMA的发生发展中具有重要作用。应用TargetScan和miRanda软件预测了差异表达circRNA与miRNA的关系,绘制了circRNA-miRNA调控网络图。结论SMA组与对照组存在差异表达的circRNA。这些circRNA可能参与SMA的发生、发展,或可成为SMA的新型诊断和治疗的潜在分子标志物。