二代测序技术在脓毒症病原学诊断中的应用价值

目的探讨二代测序技术(NGS)在脓毒症病原体检测中的运用价值。方法采用回顾性分析研究,收集2018年1月至2022年1月某三级甲等教学医院收治的82例疑似脓毒症患者的临床资料,采集血标本进行血培养、NGS和聚合酶链反应(PCR)检测,比较3种方法的临床应用价值。结果血培养、NGS和PCR所需检测时间分别为(5.61±1.22)、(1.32±0.26)和(1.52±0.31)d。82例患者中,诊断为脓毒症62例,非脓毒症患者20例;脓毒症组中有35例未治愈,明显高于非脓毒症组4例(P<0.05)。61例NGS阳性标本中,检测出病原体主要包括鲍曼不动杆菌10例、肺炎克雷伯杆菌14例、金黄色葡萄球菌4例、巨细胞病毒(CMV)22例、人类疱疹病毒(EBV)13例、单纯疱疹病毒1型(HSV-1)13例、耶氏肺孢子菌8例和烟曲霉5例。12例患者血培养阳性,共计检出13种病原体,包括肺炎克雷伯杆菌3例、铜绿假单胞菌杆菌2例,大肠杆菌2例、鲍曼不动杆菌、伯克霍尔德菌、金黄色葡萄球菌、屎肠球菌、溶血葡萄球菌和白色念珠菌各1例。NGS检测阳性率为74.39%,明显高于血培养的14.63%,差异有统计学意义(P<0.05)。NGS和血培养ROC曲线下面积、敏感性和特异性分别为0.628、80.6%、45.0%和0.597、19.4%、100%。32例患者行PCR检测,9例阳性患者中发现2种病毒感染(CMV 4例,EBV 5例),检测阳性率为28.13%。结论NGS检测方法优于传统检测方法,可检测出未知病原体且检测周期较短。