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AFM单分子力谱技术及其在活体细胞和菌体表面生物大分子研究中的最新进展
被引量:
3
1
作者
于小婷
杨忠波
+3 位作者
王鑫艳
汤明杰
王占忠
王化斌
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期28-43,共16页
生命活动过程与生物分子内或生物分子间机械力的作用密不可分.原子力显微镜具有极高的力学分辨率,可以在近生理条件下对生物样品进行力学测量,是研究生物体系力学相互作用的理想工具.基于原子力显微镜的单分子力谱(AFM-SMFS)技术可以在...
生命活动过程与生物分子内或生物分子间机械力的作用密不可分.原子力显微镜具有极高的力学分辨率,可以在近生理条件下对生物样品进行力学测量,是研究生物体系力学相互作用的理想工具.基于原子力显微镜的单分子力谱(AFM-SMFS)技术可以在单分子、单细胞水平测量生物分子内或生物分子间的相互作用.本文首先扼要介绍了AFM-SMFS技术,包括AFM-SMFS的基本原理、力谱测量及分析方法(蠕虫链模型、自由连接链模型和自由旋转链模型)以及探针的化学修饰方法(硅/氮化硅探针和镀金探针的修饰);重点介绍了利用AFM-SMFS技术对活体细胞表面蛋白(转化生长因子β1、CD20、热休克蛋白以及蛋白酪氨酸激酶)和糖类分子(葡萄糖和甘露糖)的近期研究进展;随后介绍了利用AFM-SMFS技术对活菌体表面蛋白(肝素结合血凝黏附素和Als5p黏附蛋白)和糖类分子(半乳糖、甘露糖、B族碳水化合物、荚膜多糖、α-甘露聚糖、β-甘露聚糖、β-葡聚糖以及几丁质)的近期研究进展;最后对AFM-SMFS技术的缺点和发展前景进行了总结和展望.
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关键词
原子力显微镜
单分子力谱
生物大分子
细胞
细菌
真菌
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职称材料
雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制及其相关机制研究
被引量:
3
2
作者
王莹
陈浩杰
+3 位作者
曹帆帆
彭彬
张雪
张登海
《中国现代医生》
2016年第32期33-36,共4页
目的研究雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制作用及相关机制。方法以不同浓度雷公藤红素(0.1、0.25、0.5、1.0、2.0μmol/L)分别作用于H1975细胞12 h或24 h,CCK-8法检测细胞增殖活性;小室侵袭法检测细胞的侵袭能力;Western ...
目的研究雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制作用及相关机制。方法以不同浓度雷公藤红素(0.1、0.25、0.5、1.0、2.0μmol/L)分别作用于H1975细胞12 h或24 h,CCK-8法检测细胞增殖活性;小室侵袭法检测细胞的侵袭能力;Western blot法检测雷公藤红素对H1975细胞EGFR信号通路蛋白及其下游基因表达水平的调控作用;裸鼠成瘤体内验证雷公藤红素对H1975细胞增殖的抑制作用。结果雷公藤红素对H1975细胞增殖有较明显的抑制作用,且这种抑制作用呈浓度和时间依赖性;雷公藤红素能够显著抑制H1975细胞的侵袭能力;雷公藤红素对EGFR通路蛋白及其下游基因表达水平均有不同程度的抑制作用。结论雷公藤红素通过同时抑制EGFR及其下游信号通路蛋白的表达抑制H1975细胞的增殖与侵袭能力。
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关键词
雷公藤红素
非小细胞肺癌
T790突变
EGFR通路
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职称材料
超高分辨率显微镜推进纳米生物学研究
被引量:
3
3
作者
任煜轩
于洋
王艳
《生命科学》
CSCD
2014年第12期1255-1265,共11页
超高分辨率显微镜是近年来生命科学领域重要的研究手段之一。2014年诺贝尔化学奖颁发给超高分辨率显微技术领域的三位科学家,以表彰他们在该领域所作出的杰出贡献。超高分辨率技术的典型代表有受激损耗、结构光照明以及单分子定位等。...
超高分辨率显微镜是近年来生命科学领域重要的研究手段之一。2014年诺贝尔化学奖颁发给超高分辨率显微技术领域的三位科学家,以表彰他们在该领域所作出的杰出贡献。超高分辨率技术的典型代表有受激损耗、结构光照明以及单分子定位等。这些技术的出现使得传统光学显微镜难以分辨的细胞器、分子等细节信息可以被观察到,帮助科学家从纳米尺度认识细胞内分子结构、定位以及相互作用。
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关键词
超高分辨率
受激损耗
结构光照明
光敏定位
随机光学重构
原文传递
顺磁弛豫增强效应在蛋白质结构及动力学上的应用
被引量:
1
4
作者
郭俊
李华
许琛琦
《生命的化学》
CAS
CSCD
2014年第5期621-626,共6页
未成对电子与观测核之间的偶极—偶极相互作用所引起的顺磁弛豫增强效应能够提供丰富的长程结构信息。近年来,人们在生物大分子中引入顺磁性物质,将这一独特的长程结构信息应用到蛋白质研究的方方面面,这使得顺磁NMR成为结构生物学中颇...
未成对电子与观测核之间的偶极—偶极相互作用所引起的顺磁弛豫增强效应能够提供丰富的长程结构信息。近年来,人们在生物大分子中引入顺磁性物质,将这一独特的长程结构信息应用到蛋白质研究的方方面面,这使得顺磁NMR成为结构生物学中颇有潜力的"新"工具。本文综述了顺磁弛豫增强效应在蛋白质三维结构解析、蛋白质相互作用以及蛋白质动力学研究等方面的最新应用。
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关键词
顺磁弛豫增强
蛋白质结构
蛋白质动态性
原文传递
脂立方相技术体系在膜蛋白结构与功能研究中的应用进展
被引量:
1
5
作者
姚贺帮
蔡洪敏
李典范
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2015年第7期925-935,共11页
脂立方相是包含连续脂双层和水通道的材料。其作为跨膜蛋白质结晶的有效介质,是一些重要和高难度膜蛋白结构解析的关键。因此,脂立方相技术体系越来越受到结构生物学家的重视。该文就脂立方相的特性及其结晶相关技术的最新进展作一简要...
脂立方相是包含连续脂双层和水通道的材料。其作为跨膜蛋白质结晶的有效介质,是一些重要和高难度膜蛋白结构解析的关键。因此,脂立方相技术体系越来越受到结构生物学家的重视。该文就脂立方相的特性及其结晶相关技术的最新进展作一简要阐述,并介绍该技术体系在膜蛋白生化分析与体外复性研究中的应用现状。
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关键词
膜蛋白
脂立方相
结晶
酶学分析
体外复性
原文传递
RNA的质谱分析研究进展
6
作者
彭超
黄超兰
《生命科学》
CSCD
2014年第3期261-269,共9页
核糖核酸(RNA)是一类重要的遗传物质,在生物体内起着至关重要的作用。传统的RNA测序鉴定技术既费时又费力,而且会丢失大量的RNA转录后修饰等方面的信息。随着近年来仪器的更新和技术的飞速发展,质谱技术在生物大分子研究方向得到了很好...
核糖核酸(RNA)是一类重要的遗传物质,在生物体内起着至关重要的作用。传统的RNA测序鉴定技术既费时又费力,而且会丢失大量的RNA转录后修饰等方面的信息。随着近年来仪器的更新和技术的飞速发展,质谱技术在生物大分子研究方向得到了很好的应用,特别是基于质谱技术的蛋白质组学。相比蛋白质组学的研究来说,基于质谱技术的RNA鉴定分析更为困难,发展相对缓慢。但是,硬件方面的革新和软件方面的开发也为其发展带来了很好的契机。重点通过对质谱技术在RNA分析鉴定的介绍,从样品制备、离子化方式、碎裂方式、分析方法、数据后处理软件等几个方面展现了基于质谱技术的RNA研究进展。
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关键词
电喷雾电离
基质辅助激光解吸电离
静电场轨道阱
核糖核酸
数据库检索
原文传递
题名
AFM单分子力谱技术及其在活体细胞和菌体表面生物大分子研究中的最新进展
被引量:
3
1
作者
于小婷
杨忠波
王鑫艳
汤明杰
王占忠
王化斌
机构
天津大学化工
学院
中国科学院
重庆绿色智能技术
研究院
跨尺度制造技术重庆重点实验室
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期28-43,共16页
基金
重庆市基础前沿项目(cstc2013jcyj C00001)
中国科学院仪器装备项目(生物大分子太赫兹成像光谱仪研制)
+3 种基金
国家青年科学基金项目(21407145)
重庆市应用开发项目(cstc2013yykf C00007)
国家973项目(2015CB755401)
中国科学院重庆绿色智能技术研究院创新基金(用于癌细胞检测的多功能近场太赫兹显微镜研制)资助~~
文摘
生命活动过程与生物分子内或生物分子间机械力的作用密不可分.原子力显微镜具有极高的力学分辨率,可以在近生理条件下对生物样品进行力学测量,是研究生物体系力学相互作用的理想工具.基于原子力显微镜的单分子力谱(AFM-SMFS)技术可以在单分子、单细胞水平测量生物分子内或生物分子间的相互作用.本文首先扼要介绍了AFM-SMFS技术,包括AFM-SMFS的基本原理、力谱测量及分析方法(蠕虫链模型、自由连接链模型和自由旋转链模型)以及探针的化学修饰方法(硅/氮化硅探针和镀金探针的修饰);重点介绍了利用AFM-SMFS技术对活体细胞表面蛋白(转化生长因子β1、CD20、热休克蛋白以及蛋白酪氨酸激酶)和糖类分子(葡萄糖和甘露糖)的近期研究进展;随后介绍了利用AFM-SMFS技术对活菌体表面蛋白(肝素结合血凝黏附素和Als5p黏附蛋白)和糖类分子(半乳糖、甘露糖、B族碳水化合物、荚膜多糖、α-甘露聚糖、β-甘露聚糖、β-葡聚糖以及几丁质)的近期研究进展;最后对AFM-SMFS技术的缺点和发展前景进行了总结和展望.
关键词
原子力显微镜
单分子力谱
生物大分子
细胞
细菌
真菌
Keywords
atomic force microscope, single molecule force spectroscopy, biomacromolecule, cell, bacteria,fungus
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
Q2 [生物学—细胞生物学]
下载PDF
职称材料
题名
雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制及其相关机制研究
被引量:
3
2
作者
王莹
陈浩杰
曹帆帆
彭彬
张雪
张登海
机构
第二军医大学附属
上海
市浦东新区公利医院中法合作
中心
实验室
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心
出处
《中国现代医生》
2016年第32期33-36,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81400793)
上海市浦东新区科技创新项目(PKJ2013-Y03)
上海市卫计委科研项目(201540395)
文摘
目的研究雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制作用及相关机制。方法以不同浓度雷公藤红素(0.1、0.25、0.5、1.0、2.0μmol/L)分别作用于H1975细胞12 h或24 h,CCK-8法检测细胞增殖活性;小室侵袭法检测细胞的侵袭能力;Western blot法检测雷公藤红素对H1975细胞EGFR信号通路蛋白及其下游基因表达水平的调控作用;裸鼠成瘤体内验证雷公藤红素对H1975细胞增殖的抑制作用。结果雷公藤红素对H1975细胞增殖有较明显的抑制作用,且这种抑制作用呈浓度和时间依赖性;雷公藤红素能够显著抑制H1975细胞的侵袭能力;雷公藤红素对EGFR通路蛋白及其下游基因表达水平均有不同程度的抑制作用。结论雷公藤红素通过同时抑制EGFR及其下游信号通路蛋白的表达抑制H1975细胞的增殖与侵袭能力。
关键词
雷公藤红素
非小细胞肺癌
T790突变
EGFR通路
Keywords
Celastrol
Non-small-cell lung cancer
T790 mutation
EGFR pathway
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
超高分辨率显微镜推进纳米生物学研究
被引量:
3
3
作者
任煜轩
于洋
王艳
机构
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心
.
上海
(筹)
出处
《生命科学》
CSCD
2014年第12期1255-1265,共11页
文摘
超高分辨率显微镜是近年来生命科学领域重要的研究手段之一。2014年诺贝尔化学奖颁发给超高分辨率显微技术领域的三位科学家,以表彰他们在该领域所作出的杰出贡献。超高分辨率技术的典型代表有受激损耗、结构光照明以及单分子定位等。这些技术的出现使得传统光学显微镜难以分辨的细胞器、分子等细节信息可以被观察到,帮助科学家从纳米尺度认识细胞内分子结构、定位以及相互作用。
关键词
超高分辨率
受激损耗
结构光照明
光敏定位
随机光学重构
Keywords
super-resolution
stimulated emission depletion
structured illumination
photo-activation localization
stochastic optical reconstruction
分类号
Q336 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
顺磁弛豫增强效应在蛋白质结构及动力学上的应用
被引量:
1
4
作者
郭俊
李华
许琛琦
机构
中国科学院
上海
生命科学
研究院
生物
化学与
细胞
生物学
细胞
研究所
国家
蛋白质
科学
中心
出处
《生命的化学》
CAS
CSCD
2014年第5期621-626,共6页
基金
上海市自然科学基金面上项目(12ZR1435800)
国家重点基础研究发展计划("973"计划)(2012CB910804
2014CB541903)
文摘
未成对电子与观测核之间的偶极—偶极相互作用所引起的顺磁弛豫增强效应能够提供丰富的长程结构信息。近年来,人们在生物大分子中引入顺磁性物质,将这一独特的长程结构信息应用到蛋白质研究的方方面面,这使得顺磁NMR成为结构生物学中颇有潜力的"新"工具。本文综述了顺磁弛豫增强效应在蛋白质三维结构解析、蛋白质相互作用以及蛋白质动力学研究等方面的最新应用。
关键词
顺磁弛豫增强
蛋白质结构
蛋白质动态性
Keywords
paramagnetic relaxation enhancement
protein structure
protein dynamics
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
脂立方相技术体系在膜蛋白结构与功能研究中的应用进展
被引量:
1
5
作者
姚贺帮
蔡洪敏
李典范
机构
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心
分子
生物学
国家
重点实验室
出处
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2015年第7期925-935,共11页
文摘
脂立方相是包含连续脂双层和水通道的材料。其作为跨膜蛋白质结晶的有效介质,是一些重要和高难度膜蛋白结构解析的关键。因此,脂立方相技术体系越来越受到结构生物学家的重视。该文就脂立方相的特性及其结晶相关技术的最新进展作一简要阐述,并介绍该技术体系在膜蛋白生化分析与体外复性研究中的应用现状。
关键词
膜蛋白
脂立方相
结晶
酶学分析
体外复性
Keywords
membrane protein
lipid cubic phase
crystallization
enzymatic assay
refolding in vitro
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
RNA的质谱分析研究进展
6
作者
彭超
黄超兰
机构
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心
出处
《生命科学》
CSCD
2014年第3期261-269,共9页
文摘
核糖核酸(RNA)是一类重要的遗传物质,在生物体内起着至关重要的作用。传统的RNA测序鉴定技术既费时又费力,而且会丢失大量的RNA转录后修饰等方面的信息。随着近年来仪器的更新和技术的飞速发展,质谱技术在生物大分子研究方向得到了很好的应用,特别是基于质谱技术的蛋白质组学。相比蛋白质组学的研究来说,基于质谱技术的RNA鉴定分析更为困难,发展相对缓慢。但是,硬件方面的革新和软件方面的开发也为其发展带来了很好的契机。重点通过对质谱技术在RNA分析鉴定的介绍,从样品制备、离子化方式、碎裂方式、分析方法、数据后处理软件等几个方面展现了基于质谱技术的RNA研究进展。
关键词
电喷雾电离
基质辅助激光解吸电离
静电场轨道阱
核糖核酸
数据库检索
Keywords
ESI
MALDI
Orbitrap
RNA
mass mapping
分类号
Q524 [生物学—生物化学]
Q-33 [生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
AFM单分子力谱技术及其在活体细胞和菌体表面生物大分子研究中的最新进展
于小婷
杨忠波
王鑫艳
汤明杰
王占忠
王化斌
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
下载PDF
职称材料
2
雷公藤红素对非小细胞肺癌细胞株H1975的增殖抑制及其相关机制研究
王莹
陈浩杰
曹帆帆
彭彬
张雪
张登海
《中国现代医生》
2016
3
下载PDF
职称材料
3
超高分辨率显微镜推进纳米生物学研究
任煜轩
于洋
王艳
《生命科学》
CSCD
2014
3
原文传递
4
顺磁弛豫增强效应在蛋白质结构及动力学上的应用
郭俊
李华
许琛琦
《生命的化学》
CAS
CSCD
2014
1
原文传递
5
脂立方相技术体系在膜蛋白结构与功能研究中的应用进展
姚贺帮
蔡洪敏
李典范
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2015
1
原文传递
6
RNA的质谱分析研究进展
彭超
黄超兰
《生命科学》
CSCD
2014
0
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