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常染色体显性多囊肾病患者与正常成人尿液的定量比较蛋白质组学分析
被引量:
4
1
作者
张岩
梅长林
+9 位作者
喻峰
沈学飞
黄音
刘亚伟
赵海丹
戴兵
周玉坤
戎殳
许涛
华振浩
《中华肾脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期345-350,共6页
目的搜索常染色体显性多囊肾病(ADPKD)患者与正常成人尿液蛋白质组中有丰度差异的蛋白质成分。方法制备ADPKD患者(PKD1突变)及正常成人尿液蛋白组样品,同位素编码的亲和力标签法标记蛋白质、筛选被标记肽段,二维液相色谱-串联质谱法分...
目的搜索常染色体显性多囊肾病(ADPKD)患者与正常成人尿液蛋白质组中有丰度差异的蛋白质成分。方法制备ADPKD患者(PKD1突变)及正常成人尿液蛋白组样品,同位素编码的亲和力标签法标记蛋白质、筛选被标记肽段,二维液相色谱-串联质谱法分离鉴定被标记肽段,从而鉴定蛋白质。通过计算两同位素试剂标记的相同肽段指纹峰面积比,寻找有丰度差异的蛋白质。根据被鉴定肽段的可信度,从鉴定出的蛋白质中选出6种,免疫印迹法验证其在两尿液蛋白组样品中的丰度差异。结果两尿液蛋白质组共鉴定出尿蛋白质106种, ADPKD患者尿液中水平较正常上调者48种,下调者45种。其中多囊蛋白1、肝细胞生长因子、单核细胞趋化蛋白3及孕激素受体等5种蛋白丰度差异为免疫印迹所证实。结论包括多囊蛋白1在内的多种蛋白质成分在ADPKD患者尿液中丰度发生改变,差异蛋白包括生长因子、凋亡调节蛋白、细胞外基质成分、受体、参与胞浆运输的蛋白质、酶类、细胞信号蛋白、转录因子及转录调节因子等,这些蛋白质信息可能为寻找与ADPKD发病相关的蛋白提供部分实验依据。
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关键词
比较蛋白质组
人尿液
肾病患者
常染色体显性多囊肾病
ADPKD
单核细胞趋化蛋白
肝细胞生长因子
细胞外基质成分
多囊蛋白1
学分
定量
凋亡调节蛋白
转录调节因子
标记蛋白质
串联质谱法
免疫印迹法
孕激素受体
分离鉴定
原文传递
N端焦谷氨酸环化封闭类单克隆抗体药物的N端测序方法
被引量:
3
2
作者
李明珠
韩伟东
+5 位作者
邢光慧
滕珍林
薛国梅
侯辰瑞
阮宏强
陈薇
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期73-80,共8页
目的:对于直接用N端测序仪无法进行测序的N端焦谷氨酸环化封闭的抗体类药物,去除焦谷氨酸后实现对其N端序列的从头测序。方法:对抗体的重轻链分别进行N端测序无果,再通过LC-MSMS对其重轻链N端的焦谷氨酸进行确认,证明其为焦谷氨酸封闭...
目的:对于直接用N端测序仪无法进行测序的N端焦谷氨酸环化封闭的抗体类药物,去除焦谷氨酸后实现对其N端序列的从头测序。方法:对抗体的重轻链分别进行N端测序无果,再通过LC-MSMS对其重轻链N端的焦谷氨酸进行确认,证明其为焦谷氨酸封闭。对抗体蛋白进行焦谷氨酸氨肽酶酶解后,再通过N端测序仪进行Edman降解法N端测序,获得抗体药物重轻链的N端氨基酸序列。结论:抗体药物的重轻链N端经过N端测序仪测序和LC-MSMS分析,确定均为焦谷氨酸封闭。再经过焦谷氨酸氨肽酶处理后进行N端测序仪从头测序证实抗体药物的N端序列与理论序列一致。
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关键词
单克隆抗体
焦谷氨酸环化
Edman降解
N端测序
LC-MSMS
原文传递
题名
常染色体显性多囊肾病患者与正常成人尿液的定量比较蛋白质组学分析
被引量:
4
1
作者
张岩
梅长林
喻峰
沈学飞
黄音
刘亚伟
赵海丹
戴兵
周玉坤
戎殳
许涛
华振浩
机构
[
中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组学研究中心
中国科学院
上海
生命科学
研究院
生物信息
学
中心
海军总医院肾内科
出处
《中华肾脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期345-350,共6页
文摘
目的搜索常染色体显性多囊肾病(ADPKD)患者与正常成人尿液蛋白质组中有丰度差异的蛋白质成分。方法制备ADPKD患者(PKD1突变)及正常成人尿液蛋白组样品,同位素编码的亲和力标签法标记蛋白质、筛选被标记肽段,二维液相色谱-串联质谱法分离鉴定被标记肽段,从而鉴定蛋白质。通过计算两同位素试剂标记的相同肽段指纹峰面积比,寻找有丰度差异的蛋白质。根据被鉴定肽段的可信度,从鉴定出的蛋白质中选出6种,免疫印迹法验证其在两尿液蛋白组样品中的丰度差异。结果两尿液蛋白质组共鉴定出尿蛋白质106种, ADPKD患者尿液中水平较正常上调者48种,下调者45种。其中多囊蛋白1、肝细胞生长因子、单核细胞趋化蛋白3及孕激素受体等5种蛋白丰度差异为免疫印迹所证实。结论包括多囊蛋白1在内的多种蛋白质成分在ADPKD患者尿液中丰度发生改变,差异蛋白包括生长因子、凋亡调节蛋白、细胞外基质成分、受体、参与胞浆运输的蛋白质、酶类、细胞信号蛋白、转录因子及转录调节因子等,这些蛋白质信息可能为寻找与ADPKD发病相关的蛋白提供部分实验依据。
关键词
比较蛋白质组
人尿液
肾病患者
常染色体显性多囊肾病
ADPKD
单核细胞趋化蛋白
肝细胞生长因子
细胞外基质成分
多囊蛋白1
学分
定量
凋亡调节蛋白
转录调节因子
标记蛋白质
串联质谱法
免疫印迹法
孕激素受体
分离鉴定
Keywords
Proteome
Proteomics
Urine
Autosomal dominant polycystic kidney disease
分类号
R692.1 [医药卫生—泌尿科学]
原文传递
题名
N端焦谷氨酸环化封闭类单克隆抗体药物的N端测序方法
被引量:
3
2
作者
李明珠
韩伟东
邢光慧
滕珍林
薛国梅
侯辰瑞
阮宏强
陈薇
机构
中国科学院
上海
生命科学
研究院
蛋白质
组
学
分析
研究
中心
上海
中科新
生命
生物科技有限公司
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期73-80,共8页
基金
国家科技部科技型中小企业技术创新基金(12C26243102092)资助项目
文摘
目的:对于直接用N端测序仪无法进行测序的N端焦谷氨酸环化封闭的抗体类药物,去除焦谷氨酸后实现对其N端序列的从头测序。方法:对抗体的重轻链分别进行N端测序无果,再通过LC-MSMS对其重轻链N端的焦谷氨酸进行确认,证明其为焦谷氨酸封闭。对抗体蛋白进行焦谷氨酸氨肽酶酶解后,再通过N端测序仪进行Edman降解法N端测序,获得抗体药物重轻链的N端氨基酸序列。结论:抗体药物的重轻链N端经过N端测序仪测序和LC-MSMS分析,确定均为焦谷氨酸封闭。再经过焦谷氨酸氨肽酶处理后进行N端测序仪从头测序证实抗体药物的N端序列与理论序列一致。
关键词
单克隆抗体
焦谷氨酸环化
Edman降解
N端测序
LC-MSMS
Keywords
Monoclonal antibody Pyroglumatic acid blocking Edman degradation N terminalsequencing LC-MSMS
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
常染色体显性多囊肾病患者与正常成人尿液的定量比较蛋白质组学分析
张岩
梅长林
喻峰
沈学飞
黄音
刘亚伟
赵海丹
戴兵
周玉坤
戎殳
许涛
华振浩
《中华肾脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
4
原文传递
2
N端焦谷氨酸环化封闭类单克隆抗体药物的N端测序方法
李明珠
韩伟东
邢光慧
滕珍林
薛国梅
侯辰瑞
阮宏强
陈薇
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
原文传递
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