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宁乡猪宰后pH和肉色性状的全基因组关联分析
被引量:
9
1
作者
廖印长
高虎
+3 位作者
张跃博
殷诗舒
徐康
何俊
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第S01期174-181,共8页
本研究屠宰测定了323头宁乡猪背最长肌和头半棘肌pH值(包括pH_(24h)、pH_(45min)值)及肉色性状(包括红度a、黄度b、亮度L),分析了各性状间的相关性。之后利用全基因组关联分析(GWAS)方法对宁乡猪肉质性状相关的候选基因及分子标记进行...
本研究屠宰测定了323头宁乡猪背最长肌和头半棘肌pH值(包括pH_(24h)、pH_(45min)值)及肉色性状(包括红度a、黄度b、亮度L),分析了各性状间的相关性。之后利用全基因组关联分析(GWAS)方法对宁乡猪肉质性状相关的候选基因及分子标记进行初步筛选,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,相同性状间存在正相关,不同性状间存在负相关,肉色和pH之间存在负相关关系,且均达到强相关水平(|r|>0.18)。群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差,也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有56个SNP位点达到染色体显著水平,其中12个SNP达到基因组显著水平,分布于猪基因组上的33个区域内(≤1Mb),与pH显著关联的SNP有41个,与肉色显著关联的SNP有15个。根据基因注释和文献检索结果,鉴定出与pH相关的候选基因为IGF2R、GRIK1、PIK3R4基因,与肉色相关的候选基因为FGF10基因和GRM4基因,所筛选出的候选基因主要通过调控肌肉发育和脂肪沉积等途径影响肉色和pH。
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关键词
全基因组关联分析
肉质性状
PH
肉色
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职称材料
宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因多态性及其与IMF含量的关联分析
被引量:
2
2
作者
李艺阳
殷诗舒
+3 位作者
廖印长
徐康
张跃博
何俊
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期3737-3747,共11页
旨在研究宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性及其与肌内脂肪(IMF)含量的关联性。本试验采用PCR-RFLP和Sanger测序的方法对172头宁乡阉公猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性进行检测,并探究多态性与宁乡猪IMF含量的关联性。结果...
旨在研究宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性及其与肌内脂肪(IMF)含量的关联性。本试验采用PCR-RFLP和Sanger测序的方法对172头宁乡阉公猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性进行检测,并探究多态性与宁乡猪IMF含量的关联性。结果表明,宁乡猪H-FABP-HinfⅠ酶切位点存在多态性,其中Hh基因型个体的IMF含量最高,与HH、hh基因型个体的IMF含量差异极显著(P<0.01);H-FABP-HaeⅢ酶切只检测到DD和Dd两种基因型,Dd基因型个体的IMF含量极显著高于DD基因型个体(P<0.01);H-FABP基因的HinfⅠ和HaeⅢ多态性位点共形成3种单倍型和5种单倍型组合,其中单倍型组合HD/hd个体具有最佳的IMF含量。H-FABP的Msp I酶切结果及A-FABP基因测序结果显示,宁乡猪不存在多态现象;SLC13A5基因多态性位点g.50705299T/C和NR1H4基因多态性位点g.83607915G/A处不同基因型间IMF含量的差异均不显著(P>0.05)。综上所述,H-FABP基因HinfⅠ和HaeⅢ酶切位点多态性与宁乡猪IMF含量显著关联,其形成的单倍型组合HD/hd的IMF含量最高。以上结果可为宁乡猪IMF含量性状的早期分子选育提供参考。
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关键词
宁乡猪
FABPs
SLC13A5
NR1H4
肌内脂肪
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职称材料
浅述乳酸菌在畜禽生产中的应用
被引量:
2
3
作者
董亚超
刘启航
+3 位作者
彭译苇
王乐莅
尹佳
印遇龙
《激光生物学报》
CAS
2020年第1期26-33,共8页
在病原菌、病毒、应激等因素的影响下,畜禽肠道功能容易紊乱失调。抗生素可以预防或治疗由病原菌引起的感染,但抗生素的滥用会给畜牧产品、生态环境带来一系列危害,对人类的健康造成巨大威胁,因此无抗养殖的趋势已成必然。益生菌在畜禽...
在病原菌、病毒、应激等因素的影响下,畜禽肠道功能容易紊乱失调。抗生素可以预防或治疗由病原菌引起的感染,但抗生素的滥用会给畜牧产品、生态环境带来一系列危害,对人类的健康造成巨大威胁,因此无抗养殖的趋势已成必然。益生菌在畜禽养殖中具有很重要的作用,乳酸菌作为益生菌的重要组成部分,它具有促进机体生长、改善胃肠道功能、提高机体免疫力、维持动物肠道菌群平衡等作用,故乳酸菌可以作为抗生素替代品引入畜禽养殖。本文主要概述乳酸菌在畜禽养殖中发挥益生功效的作用机制和应用范围,着重讲述乳酸菌相较于其他主要畜禽养殖益生菌的优势与劣势,阐述乳酸菌在种养结合的运用,对乳酸菌的未来发展和应用前景提出展望。
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关键词
乳酸菌
畜禽养殖
种养结合
营养调控
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职称材料
题名
宁乡猪宰后pH和肉色性状的全基因组关联分析
被引量:
9
1
作者
廖印长
高虎
张跃博
殷诗舒
徐康
何俊
机构
湖南
农业
大学
动物
科技
学院
中国科学院
亚热带
农业
生态
研究所
动物
营养
生理与
代谢
过程
实验室
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第S01期174-181,共8页
基金
中国科学院战略性先导科技专项(A类)资助(XDA24030204)
文摘
本研究屠宰测定了323头宁乡猪背最长肌和头半棘肌pH值(包括pH_(24h)、pH_(45min)值)及肉色性状(包括红度a、黄度b、亮度L),分析了各性状间的相关性。之后利用全基因组关联分析(GWAS)方法对宁乡猪肉质性状相关的候选基因及分子标记进行初步筛选,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,相同性状间存在正相关,不同性状间存在负相关,肉色和pH之间存在负相关关系,且均达到强相关水平(|r|>0.18)。群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差,也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有56个SNP位点达到染色体显著水平,其中12个SNP达到基因组显著水平,分布于猪基因组上的33个区域内(≤1Mb),与pH显著关联的SNP有41个,与肉色显著关联的SNP有15个。根据基因注释和文献检索结果,鉴定出与pH相关的候选基因为IGF2R、GRIK1、PIK3R4基因,与肉色相关的候选基因为FGF10基因和GRM4基因,所筛选出的候选基因主要通过调控肌肉发育和脂肪沉积等途径影响肉色和pH。
关键词
全基因组关联分析
肉质性状
PH
肉色
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因多态性及其与IMF含量的关联分析
被引量:
2
2
作者
李艺阳
殷诗舒
廖印长
徐康
张跃博
何俊
机构
湖南
农业
大学
动物
科学
技术
学院
中国科学院
亚热带
农业
生态
研究所
动物
营养
生理与
代谢
过程
实验室
岭南现代
农业
科学
与技术广东省
实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期3737-3747,共11页
基金
湖南省创新平台与人才计划-种业创新项目(2021NK1009)
岭南现代农业实验室科研项目(NT2021005)。
文摘
旨在研究宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性及其与肌内脂肪(IMF)含量的关联性。本试验采用PCR-RFLP和Sanger测序的方法对172头宁乡阉公猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因的多态性进行检测,并探究多态性与宁乡猪IMF含量的关联性。结果表明,宁乡猪H-FABP-HinfⅠ酶切位点存在多态性,其中Hh基因型个体的IMF含量最高,与HH、hh基因型个体的IMF含量差异极显著(P<0.01);H-FABP-HaeⅢ酶切只检测到DD和Dd两种基因型,Dd基因型个体的IMF含量极显著高于DD基因型个体(P<0.01);H-FABP基因的HinfⅠ和HaeⅢ多态性位点共形成3种单倍型和5种单倍型组合,其中单倍型组合HD/hd个体具有最佳的IMF含量。H-FABP的Msp I酶切结果及A-FABP基因测序结果显示,宁乡猪不存在多态现象;SLC13A5基因多态性位点g.50705299T/C和NR1H4基因多态性位点g.83607915G/A处不同基因型间IMF含量的差异均不显著(P>0.05)。综上所述,H-FABP基因HinfⅠ和HaeⅢ酶切位点多态性与宁乡猪IMF含量显著关联,其形成的单倍型组合HD/hd的IMF含量最高。以上结果可为宁乡猪IMF含量性状的早期分子选育提供参考。
关键词
宁乡猪
FABPs
SLC13A5
NR1H4
肌内脂肪
Keywords
Ningxiang pigs
FABPs
SLC13A5
NR1H4
IMF
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
浅述乳酸菌在畜禽生产中的应用
被引量:
2
3
作者
董亚超
刘启航
彭译苇
王乐莅
尹佳
印遇龙
机构
湖南师范大学生命
科学
学院
中国科学院亚热带农业研究所动物营养生理与代谢过程实验室
出处
《激光生物学报》
CAS
2020年第1期26-33,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31700004)
文摘
在病原菌、病毒、应激等因素的影响下,畜禽肠道功能容易紊乱失调。抗生素可以预防或治疗由病原菌引起的感染,但抗生素的滥用会给畜牧产品、生态环境带来一系列危害,对人类的健康造成巨大威胁,因此无抗养殖的趋势已成必然。益生菌在畜禽养殖中具有很重要的作用,乳酸菌作为益生菌的重要组成部分,它具有促进机体生长、改善胃肠道功能、提高机体免疫力、维持动物肠道菌群平衡等作用,故乳酸菌可以作为抗生素替代品引入畜禽养殖。本文主要概述乳酸菌在畜禽养殖中发挥益生功效的作用机制和应用范围,着重讲述乳酸菌相较于其他主要畜禽养殖益生菌的优势与劣势,阐述乳酸菌在种养结合的运用,对乳酸菌的未来发展和应用前景提出展望。
关键词
乳酸菌
畜禽养殖
种养结合
营养调控
Keywords
lactic acid bacteria(LAB)
livestock and poultry breeding(LPB)
plantingand cultivation
nutritional regulation
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宁乡猪宰后pH和肉色性状的全基因组关联分析
廖印长
高虎
张跃博
殷诗舒
徐康
何俊
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021
9
下载PDF
职称材料
2
宁乡猪FABPs、SLC13A5和NR1H4基因多态性及其与IMF含量的关联分析
李艺阳
殷诗舒
廖印长
徐康
张跃博
何俊
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
3
浅述乳酸菌在畜禽生产中的应用
董亚超
刘启航
彭译苇
王乐莅
尹佳
印遇龙
《激光生物学报》
CAS
2020
2
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职称材料
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