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解读生命密码的基本手段——DNA测序技术的前世今生
被引量:
2
1
作者
任鲁风
于军
《生命科学》
CSCD
2012年第12期1357-1362,共6页
DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质,其序列的组成和变化造就了形形色色的生命世界。这两种承担了生命体遗传信息载体功能的物质,一方面在生命的不断繁衍中保持了各个物种的独特面目,另一方面又通,
关键词
DNA测序技术
生命体
脱氧核糖核酸
密码
解读
生命世界
遗传信息
RNA
原文传递
类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析
2
作者
李德志
楚亚男
+9 位作者
任鲁风
李欣刚
袁丽娜
康禹
张伟
杨宇
王绪敏
Baillie J.Kenneth
于军
高占成
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013年第3期247-253,275-279,共7页
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus),作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体,介导金黄...
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus),作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体,介导金黄色葡萄球菌产生耐药性.本研究报道了一株新甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的全基因组序列信息,即类SCC样MSSA463菌株,经多重PCR方法,该菌株被误鉴定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,结果与药敏结果相冲突.为此,运用焦磷酸测序方法完成了该菌株的全基因组测序,并与已知金黄色葡萄球菌的基因组序列信息不同,发现可读框(CZ049;AB037671)存在于attL,attR反向重复序列的临近下游.这些结果提示,在金黄色葡萄球菌与其他微生物之间可能存在一种水平基因转移,并改变了金黄色葡萄球菌对药物的敏感性,推测attL,attR反向重复序列可能作为外源性基因的插入部位而存在.
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关键词
金黄色葡萄球菌
金黄色葡萄球菌盒式染色体mec(SCC
mec)
基因组学
焦磷酸测序
原文传递
零模波导原理、制备及其在单分子荧光检测中的应用
被引量:
4
3
作者
魏清泉
李运涛
+2 位作者
任鲁风
周晓光
俞育德
《生物技术进展》
2015年第1期10-21,F0003,共13页
单分子荧光检测作为一种能够表征分子个体性质及行为的分析方法,有助于揭示利用传统荧光检测方法无法得到的信息,在近年来受到人们的广泛关注。利用传统光学检测设备进行单分子荧光检测时,由于受到衍射极限的限制,同时为了保证在观测体...
单分子荧光检测作为一种能够表征分子个体性质及行为的分析方法,有助于揭示利用传统荧光检测方法无法得到的信息,在近年来受到人们的广泛关注。利用传统光学检测设备进行单分子荧光检测时,由于受到衍射极限的限制,同时为了保证在观测体积内只有单个荧光分子,仅能采用无限稀释溶液的方法实现单分子荧光检测。虽然这种方法可以满足单分子检测的要求,但是由于大部分酶分子正常工作时底物的生理浓度都非常高,底物浓度的大幅度降低会对酶分子的反应机制等方面造成影响。零模波导作为一种新型的单分子检测器件,通过纳米微孔结构突破了光学衍射极限的限制将观测体积降至仄升量级(10-21L),使得在生理浓度范围内检测单分子荧光成为可能,在单分子荧光检测领域得到了广泛应用。因此,就零模波导的原理、制备工艺及其在单分子DNA测序、生物膜、生物大分子之间的相互作用及单分子反应动力学方面的具体应用进行综述。
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关键词
零模波导
单分子
纳米微结构器件
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职称材料
题名
解读生命密码的基本手段——DNA测序技术的前世今生
被引量:
2
1
作者
任鲁风
于军
机构
中国科学院北京基因组研究所dna序列测定技术研究开发中心
出处
《生命科学》
CSCD
2012年第12期1357-1362,共6页
基金
中国科学院重大科研装备研制项目(YZ200823)
文摘
DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质,其序列的组成和变化造就了形形色色的生命世界。这两种承担了生命体遗传信息载体功能的物质,一方面在生命的不断繁衍中保持了各个物种的独特面目,另一方面又通,
关键词
DNA测序技术
生命体
脱氧核糖核酸
密码
解读
生命世界
遗传信息
RNA
分类号
Q523.8 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析
2
作者
李德志
楚亚男
任鲁风
李欣刚
袁丽娜
康禹
张伟
杨宇
王绪敏
Baillie J.Kenneth
于军
高占成
机构
北京
大学人民医院呼吸与危重症医学科
山东大学附属省立医院呼吸科
中国科学院
北京
基因组
研究所
基因组
科学
及信息重点实验室
中国科学院北京基因组研究所dna序列测定技术研究开发中心
南昌大学第一附属医院呼吸科
中国
检验检疫
科学
研究
院
Division of Genetics and Genomics
Department of Critical Care Medicine
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013年第3期247-253,275-279,共7页
基金
国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA02Z4A9)
国家科技部重大专项(批准号:2009ZX10004
+3 种基金
2012ZX10004206)
国家自然科学基金(批准号:30971610
30900053)
中国科学院青年创新促进会基金资助项目
文摘
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus),作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体,介导金黄色葡萄球菌产生耐药性.本研究报道了一株新甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的全基因组序列信息,即类SCC样MSSA463菌株,经多重PCR方法,该菌株被误鉴定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,结果与药敏结果相冲突.为此,运用焦磷酸测序方法完成了该菌株的全基因组测序,并与已知金黄色葡萄球菌的基因组序列信息不同,发现可读框(CZ049;AB037671)存在于attL,attR反向重复序列的临近下游.这些结果提示,在金黄色葡萄球菌与其他微生物之间可能存在一种水平基因转移,并改变了金黄色葡萄球菌对药物的敏感性,推测attL,attR反向重复序列可能作为外源性基因的插入部位而存在.
关键词
金黄色葡萄球菌
金黄色葡萄球菌盒式染色体mec(SCC
mec)
基因组学
焦磷酸测序
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
零模波导原理、制备及其在单分子荧光检测中的应用
被引量:
4
3
作者
魏清泉
李运涛
任鲁风
周晓光
俞育德
机构
中国科学院
半导体
研究所
中国科学院
半导体
研究所
/
中国科学院
北京
基因组
研究所
-生物信息获取与传感
技术
联合实验室
中国科学院
北京
基因组
研究所
出处
《生物技术进展》
2015年第1期10-21,F0003,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31200643
61275064)资助
文摘
单分子荧光检测作为一种能够表征分子个体性质及行为的分析方法,有助于揭示利用传统荧光检测方法无法得到的信息,在近年来受到人们的广泛关注。利用传统光学检测设备进行单分子荧光检测时,由于受到衍射极限的限制,同时为了保证在观测体积内只有单个荧光分子,仅能采用无限稀释溶液的方法实现单分子荧光检测。虽然这种方法可以满足单分子检测的要求,但是由于大部分酶分子正常工作时底物的生理浓度都非常高,底物浓度的大幅度降低会对酶分子的反应机制等方面造成影响。零模波导作为一种新型的单分子检测器件,通过纳米微孔结构突破了光学衍射极限的限制将观测体积降至仄升量级(10-21L),使得在生理浓度范围内检测单分子荧光成为可能,在单分子荧光检测领域得到了广泛应用。因此,就零模波导的原理、制备工艺及其在单分子DNA测序、生物膜、生物大分子之间的相互作用及单分子反应动力学方面的具体应用进行综述。
关键词
零模波导
单分子
纳米微结构器件
Keywords
zero-mode waveguides
single molecule
nano microstructure devices
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
解读生命密码的基本手段——DNA测序技术的前世今生
任鲁风
于军
《生命科学》
CSCD
2012
2
原文传递
2
类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析
李德志
楚亚男
任鲁风
李欣刚
袁丽娜
康禹
张伟
杨宇
王绪敏
Baillie J.Kenneth
于军
高占成
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2013
0
原文传递
3
零模波导原理、制备及其在单分子荧光检测中的应用
魏清泉
李运涛
任鲁风
周晓光
俞育德
《生物技术进展》
2015
4
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职称材料
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