家猪基因组含有大量保守非编码区(英文)

用 190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组 ,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区 ,得到大量含有保守非编码区的家猪序列。 11 0 5 %的家猪读序含有“猪 人”保守的非编码区序列 ,3 13%的家猪读序含有“猪 鼠”保守的非编码区片段 ,1 86 %的家猪读序包含“猪 人 鼠”三者保守的非编码区区域。三者保守的非编码区序列跟人的相似性明显高于跟小鼠的相似性。另外 ,很多人、小鼠的非编码RNA基因跟上述含有保守非编码片段的家猪序列至少比对上一次。

水稻基因组中的小RNA

水稻是一种很重要的模式植物,其基因组框架图的完成将对植物生物学和遗传进化学等学科的研究做出巨大贡献.目前,水稻科研工作者们在绘制水稻完成图谱的同时,也正在对水稻中基因和非编码区序列进行着深入的研究.非编码RNA在生物系统中有着很重要的作用.小RNA是非编码RNA的一种,我们在水稻基因组中寻找已知小RNA序列,并且在拟南芥、玉米、酵母、线虫、老鼠和猪这6个物种中一一进行比对,结果在552个小RNA的数据库中找到160个小RNA,它们存在于水稻的108个Scaffold中,其中绝大部分(99.41％)都位于基因预测的内含子区.19个小RNA只存在于水稻基因组中.发现了两段U14小RNA保守片段,一段是位于同系列的5个小RNAZMU14SNR9(s)中,它们只出现在3个植物物种上,其中86％序列都是和水稻、拟南芥、玉米重复的序列;另一段保守的小RNA是XLHS7CU14,它出现在除猪以外的其他6个物种中.所有这些结果显示小RNA在植物和动物之间并没有明显的界限.

微量镓的分析方法评述及展望

由于镓是稀散金属 ,且分布分散 ,因此对于微量镓的分析测定就极为重要 .文章主要介绍了近几年微量镓的分析测定方法的进展 ,叙述了多种微量镓的分析测定方法 ,包括可见光分光光度法、荧光光度法、原子吸收光谱法、极谱法及其它等分析方法 ,对这些方法的优缺点分别归纳总结并进行了评述 .

籼稻细胞色素P450超基因家族成员及其EST证据

将预测的籼稻基因同289个已知的拟南芥细胞色素P450基因进行蛋白质序列比对,在籼稻(Oryza sativa L.ssp.indica)工作框架草图中找到了528个可能的细胞色素P450基因,初步认定上述籼稻P450基因来自于已在拟南芥中确定的40个P450基因家族.比较拟南芥和籼稻的细胞色素P450s在基因家族中的分布,发现这两种植物P450基因的家族分布规律总体相似,但也有不同,例如:CYP71,CYP72,CYP76,CYP89,CYP94,CYP709等家族的成员在籼稻中远远多于拟南芥的;CYP705家族的成员在籼稻中没有,但在拟南芥中却多达33个.另外,发现籼稻CYP71和CYP81家族的成员在基因组中成串联重复排列,它们可能是进化过程中基因复制的结果.进一步将这些籼稻P450基因的DNA序列同籼稻表达序列标签(expression sequence tags,ESTs)进行核酸序列比对,为263个可能的籼稻P450s找到了ESTs的证据,说明这些基因在转录水平上确实有所表达.