rRNA二级结构序列用于真菌系统学研究的方法初探(英文)

本文首次利用核酸二级结构特征代替核酸碱基作为探讨类群之间亲缘关系的信号,构建了基于结构特征的子囊菌部分类群的系统进化树。该方法以S(规范的碱基对),Q(不规范的碱基对),I(单链),B(侧环),M(多分枝环)和H(发卡结构)为代码将二级结构特征区分为6种不同的亚结构类型,然后将二级结构特征转换为结构序列,并进行结构序列分析。该方法使rRNA不只局限于碱基比较,拓展了其应用范围,为揭示分子的功能与进化的关系提供了线索。结果表明,结构序列分析可用于子囊菌的系统学研究;相对于核酸序列分析,结构分析的结果似乎更加清晰地体现子囊果的演化过程。

内生真菌VII.中国地衣内生真菌三个新记录种(英文)

内生真菌Nodulisporium hyalosporum,Phialophora bubakii,Sporormiella muskokensis是从北京百花山地衣组织中分离到的我国3个新记录种。对它们进行了重新描述与图解。这3个种的培养物干标本存放在中国科学院微生物研究所菌物标本馆(HMAS)。

中国肉疣衣属地衣的初步研究

肉疣衣属地衣为世界广布属之一,该属为壳状地衣,地衣体通常龟裂具疣,子囊果盘状一般无柄贴生,盘缘明显,侧丝分枝结网状,孢子大型。本文对中国肉疣衣属地衣进行了初步研究,并报道了该属地衣共16种,其中中国新记录5种,即寒生肉疣衣、柱芽肉疣衣、粉末肉疣衣、亚裂芽肉疣衣、亚绿肉疣衣。

火丝菌科(盘菌目)部分属的系统学研究(英文)

本文以核糖体小亚基(SSUrDNA)为分子标记,对28个属60个种的71个序列片段进行序列分析,探讨火丝菌科的属间亲缘关系。研究结果支持广义的火丝菌科概念,表明该科是单起源的,显示5个主要分支。腐生或与植物共生形成菌根、囊盘被表面具有毛状物的15个属构成A分支,该分支中仅部分属之间的关系比较明确;与苔藓植物生长在一起的4个属构成B分支;C分支包括Otidea和Otideopsis两属,后者与Otidea的成员混杂在一起;D分支仅包括Acervus的成员;E分支由Geopyxis,Tarzetta,Paurocotylis等5个属组成。分子系统学的研究结果与形态学分类系统之间存在一定差异,依据形态特征和超微结构建立的亚科和族均未获得支持。

粒毛盘菌属及其相关属的分子系统学研究

晶杯菌科的分类目前主要基于子囊盘外囊盘被表面毛状物的形态学特征,在系统演化关系上十分不清楚。本研究利用18SrRNA基因核苷酸序列分析方法探讨该科粒毛盘菌属及其相关属间的系统发育关系。以Saccharomycescerevisiae为外群的严格合意树和最简约树表明,粒毛盘菌属与其相关的属形成三个分支。Lachnumhyalopus,L.nudipes和L.virgineum代表一个分支。L.brasiliense,L.sclerotii,L.singerianum,Albotrichaguangxiensis,Calycellinapopulina.,Cistellagrevillei,Hyaloscyphaaureliella,Lachnellulacalyciformis,Parachnopezizaguangxiensis和Trichopezizasulphurea聚在一起(支持率为57%),为另一个分支。上述两个姊妹分支的支持强度为76%。与Lachnum在形态上有些相似的Cistella和Lachnum聚在一起的支持强度为51%。传统上纳入Arachnopezizoideae的Parachnopeziza与该亚科的模式属Arachnopeziza的关系较远。Arachnopezizaaurata是供试的14个种中距离最远的一个,位于系统发育树的最外侧,与上述两个分支的亲缘关系较远,这对Arachnopezizoideae在晶杯菌科中的地位提出了质疑。

中国西北地区树花属地衣研究(英文)

本文从形态学、解剖学、化学等方面对采自中国西北地区的树花属Ramalina地衣进行了研究,鉴定出该属地衣18种,其中簇树花R.chihuahuana和平树花R.complanata为中国新记录种,西北地区新记录种有12个。

中国果疣衣属地衣的研究(英文)

果疣衣属地衣系子囊菌门Ascomycota,子囊菌纲Ascomycetes, 茶渍衣亚纲Lecanoromycetidae, 鸡皮衣目Pertusariales,鸡皮衣科Pertusariaceae 的成员.由于粉色果疣衣 Varicellaria rhodocarpa 在中国的首次发现,使中国地衣区系中新增添了一个属:果疣衣属 Varicellaria.该属迄今已知仅含三种,即粉芽果疣衣V. kemensis, 八孢果疣衣V. carneonivea 及粉色果疣衣V. rhodocarpa.果疣衣属为壳状地衣,地衣体微薄,膜质;子囊盘茶渍型,单个或数个聚生于瘤状果疣中;类侧丝多分枝并呈网状缠绕;子囊内含单孢或八孢;子囊孢子大型(长度为200～400(m),双胞,无色透明,椭圆形;孢子壁厚达27(m;与鸡皮衣属不同之处在于前者子囊内含双胞孢子,后者子囊内含单胞孢子.由于该属在中国是首次被发现,为了进一步的研究,文中还提供了该属迄今已知的全部三种的分种检索表.粉色果疣衣以其地衣体基本无粉芽和遇Pd呈负反应而区别于粉芽果疣衣,以子囊内含单孢而区别于八孢果疣衣.通过薄板层析法首次从该种髓部检测出茶渍衣酸.其地理成分为北极高山种,主要分布于欧洲的挪威、瑞典、芬兰、阿尔卑斯山脉,喀尔巴阡山脉、苏格兰以及北美洲;在亚洲迄今只见于日本与中国.

内生真菌V．中国树木和地衣内生真菌三个新记录属种(英文)

内生真菌Disculina vulgaris、Geniculosporium serpens和Myxocycluspolycystis是从阔叶树和地衣组织中分离的中国3个新记录属、种。对它们进行了重新描述与图解。这3个菌种的干培养物标本存放在中国科学院微生物研究所菌物标本馆(HAMS)。

药用植物内生真菌及活性物质多样性研究进展

药用植物具有丰富的物种多样性,是人类生存与发展的重要自然资源。内生真菌广泛存在于健康植物组织内部,是植物微生态系统的重要组成部分,各种药用植物中蕴藏着非常丰富的内生真菌。通过与药用植物的“协同进化”,某些内生真菌具有了产生与宿主植物相同或相似的生物活性物质的能力。内生真菌产生的各种活性物质,在生物制药、农业生产、工业发酵等方面都表现出美好的应用前景,受到世界各国专家的广泛关注。利用内生真菌发酵实现生物活性物质的工业化生产,可以提高产量、降低产品成本,满足人们日益增长的需求;同时有利于珍稀、濒危药用植物资源的保护,对减少野生药用植物多样性的破坏具有重要意义。本文从药用植物内生真菌物种多样性与产生生物活性物质多样性等方面总结近年最新的研究进展,提出了内生真菌及活性物质研究的未来发展方向。

冬虫夏草及其相关类群的分子系统学分析

为了探明冬虫夏草及其相关类群的亲缘关系,以冬虫夏草、中国被毛孢及中华束丝孢(=冬虫夏草头孢=蝙蝠蛾多毛孢)共6株菌种作为内群和一株蛹草拟青霉作为外群进行了DNA随机多态型(RAPD)分析。此外,基于上述供试材料又在内群中增加了一株蝙蝠蛾拟青霉,并对内群和外群样品的nrDNA间隔区(ITS)碱基序列进行了测定;对于测定的8条序列连同来自GenBank中的4条相关序列进行了分子系统学分析。结果表明:中华束丝孢和中国被毛孢均系冬虫夏草菌的无性型。按照国际植物命名法规,中国被毛孢应为冬虫夏草菌无性型的正确名称。而蝙蝠蛾拟青霉为不同于冬虫夏草菌的另一种真菌;该名称由于不合格发表而不被国际植物命名法规所承认。

根据形态学和分子系统学特征界定拟盘多毛孢属的种

以拟盘多毛孢属108个ITS(内转录间区)序列建立了分子系统树,探讨拟盘多毛孢属的形态特征与分子系统树的相互关系。结果表明,拟盘多毛孢属首先按照分生孢子有色胞的颜色区分为暗色和淡色(同色)2个分支,暗色组再分成2个亚分支——同色亚分支和异色亚分支,淡色分支内进一步根据顶端附属丝特征和基部附属丝的有无区分为7个亚分支。寄主植物的某个分类单元在拟盘多毛孢属的分子系统树上并未形成特定的分支。通过对形态特征与分子系统树结合分析,重新界定小孢拟盘多毛孢(P esta lotiop sism icrosp ora)、异色拟盘多毛孢(P.versicolor)和茶拟盘多毛孢(P.theae)。

都江堰地区丛枝菌根真菌多样性与生态研究

调查了都江堰地区3个不同生境样地(般若寺、馒头山、龙池)中85种优势及常见植物的丛枝菌根真菌侵染率,其中78种植物(91.8％)被丛枝菌根真菌侵染。同时对其中58种植物根围土壤中丛枝菌根真菌的多样性进行分析,共分离到5属47种丛枝菌根真菌,其中球囊霉属(Glomus)35种,无梗囊霉属(Acaulospora)7种,原囊霉属(Archaeospora)1种,内养囊霉属(Entrophospora)2种,巨孢囊霉属(Gigaspora)2种。无梗囊霉属和球囊霉属是3个样地共有的优势属。光壁无梗囊霉(Acaulospora laevis)是龙池的优势种,而地表球囊霉(Glomus versiforme)是般若寺和馒头山的优势种。丛枝菌根真菌的孢子密度和种的丰度显著受到海拔相关因子影响,同时丛枝菌根真菌的种类组成也受较大影响。乔木砍伐没有显著影响丛枝菌根真菌的孢子密度和种的丰度,同时对种类组成影响也较小。根围土壤中丛枝菌根真菌的孢子密度与根系侵染率之间没有显著相关性(R^2=0.0248)。

从分子系统学角度分析拟盘多毛孢属及其近缘属的界限

拟盘多毛孢属和截盘多毛孢属的划分界限长期以来因分类学家的观点不一致而处于模糊状态,以核糖体DNA的内转录间区序列建立分子系统树的结果支持五细胞分生孢子类型应归入拟盘多毛孢属,四细胞分生孢子类型应归入截盘多毛孢属,分子系统树同时可以反映无性阶段和有性阶段之间的联系,显示出分子系统学对形态分类学的客观性的评判作用。

梅根际丛枝菌根真菌五个中国新记录种(英文)

5种丛枝菌根真菌微刺球囊霉Glomus spinuliferum、大型无梗囊霉Acaulospora colossica、单氏内生囊霉Intraspora schenckii、巴西类球囊霉Paraglomus brasilianum和双疣盾巨孢囊霉Scutellospora dipapillosa是从梅Prunus mumeSieb.etZucc.的根围土壤中分离的中国新记录种。本文对他们的形态特征进行重新描述和图解。这5个种的标本贮藏在中国科学院微生物研究所菌物标本馆(HMAS)中。

中国丛枝菌根真菌七个新记录种(英文)

报道中国七种丛枝菌根真菌新记录种,空洞无梗囊霉Acaulospora cavernata,脆无梗囊霉A．delicata,尼氏无梗囊霉A．nicolsonii,沾屑多孢囊霉Diversispora spurca,褐色球囊霉Glomus badium,副冠球囊霉Gcoronatum,层状球囊霉Glamellosum。标本保藏于中国科学院微生物研究所真菌标本馆(HMAS)。

中国梅丛枝菌根侵染的调查研究

从中国主要梅园和野梅分布区采集梅(Prunus mume Sieb.et Zucc.)根系样品,研究不同地点、不同季节及不同粗度的根系丛枝菌根(AM)侵染状况。结果表明:梅根系内的AM结构可见到形态多样的菌丝、泡囊、侵入点和Arum-type丛枝;直径小于0.5mm的细根AM侵染指标明显高于较粗的根;不同地点的梅根系AM侵染率不同;不同季节中,以春季的梅根系AM侵染指标最高。

外阴阴道念珠菌病白念珠菌基因型和抗真菌药物敏感性研究

目的探讨外阴阴道念珠菌病(VVC)白念珠菌基因多样性与抗真菌药物敏感性的关系。方法采用最近开展的CAI微卫星法聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术鉴定VVC患者白念珠菌的基因型,采用E-test法对检出的念珠菌进行体外药敏试验。结果从VVC患者分离出89株白念珠菌,鉴定出26种基因型。白念珠菌对两性霉素B、氟胞嘧啶、酮康唑和氟康唑敏感。主要基因型(A、B、C、D)占69.7%(62/89),白念珠菌B基因型菌株及非B基因型菌株对伊曲康唑(ITR)的耐药率分别为66.7%(14/21)和4.4%(3/68),差异有统计学意义(P<0.05)。结论 PCP-SSCP技术有利于研究白念珠菌对抗真菌药物的耐药机制。白念珠菌B基因型菌株对ITR有更高的耐药性。

中国热带粒毛盘菌属的物种多样性研究

本文在对我国盘菌资源调查的基础上 ,分析研究了热带地区粒毛盘菌属真菌的物种多样性。本研究共分析45 1份标本 ,属于 35个分类单位 ,其中Lachnumabnormevar.abnorme ,L .brasiliense,L .flavidulum ,L .pteri dophyllum ,L .sclerotii和L .virgineum 6个种的个体数量均在总数的 6 %以上 ,占已观察标本总数的 73 .4% ,是我国热带地区的常见种。物种多样性分析表明 ,海南的物种丰富度 (S =2 2 )和多样性指数 (H′ =2 .6 6 96 )最高 ,云南与广西的物种丰富度相似。采用群落系数 (coefficientofcommunity ,cc)比较了不同地区的物种分布相似性。本文还试图探讨物种分布与海拔高度、生境、基物间的关系。粒毛盘菌属真菌在海拔 6 0～ 2 70 0m的地带均有分布 ,由于调查和取样的局限性 ,物种随海拔高度变化的规律不明显 ;地理分布上大致可分为世界性分布、间断性分布和地方特有三种分布型。