结合科研需求自建专业特色电子资源数据库——以中国科学院植物研究所图书馆自建电子资源数据库为例

植物系统分类学是中国科学院植物研究所的传统优势学科,其对传统文献的依赖性非常强。为有效保障中国植物学家们方便快捷地获取历史文献资源,中国科学院植物研究所图书馆依托本所特色馆藏资源,自建一批与植物系统分类学密切相关的电子数据库,包括东亚植物文献库、中国植物名称数据库、《中国高等植物图鉴》电子版、《中国植物志》电子版、《植物拉丁文》电子版以及生物多样性历史文献图书馆-中国节点等6个数据库,并搭建检索平台。

麻黄属种子表面纹饰的多样性及其系统学意义(英文)

麻黄属(Ephedra)的分子系统学研究结果明显不同于基于雌球果成熟苞片质地的传统分类,指出麻黄属的形态特征和分子特征存在冲突。对麻黄属53种植物的种子表面微形态特征进行了研究,结果表明麻黄属的种子表面纹饰包括3种主要类型,即横向片层型(T型)、乳突型(P型)和扁平型(S型)。麻黄属的种子表面纹饰特征既与宏观形态特征不相关,也与分子系统学的研究结果不相关,表明该属微形态特征、宏观形态特征和分子特征之间的更多冲突。在欧洲和东亚发现的与买麻藤类有关的几个大化石带有T型种子表面纹饰,暗示具有T型纹饰的麻黄类植物在早白垩纪就十分多样。

植物信息系统的设计与应用

本文将分布式数据库技术与网络技术相结合,并将分布式技术引入植物标本数据库网络查询系统,采用WebSer-vice技术及异步调用方法实现分布式数据检索,不仅能方便internet网络用户查询植物标本数据,而且可提高标本数据的利用率,有利于实现资源共享;运用Internet网络技术、ASP技术以及数据库技术将植物标本馆进行数字化,使标本及其各种属性得到永久性保存;为了弥补集中式数据库系统在覆盖率、更新率、访问权限控制、专业性及网络负载等方面存在的缺陷,本文设计并实现了一个可扩展性强的分布式植物标本信息系统。

中国生物多样性e-Science平台建设构想

本文结合国际生物多样性信息学发展趋势和生物多样性e-Science相关平台,在分析我国前期工作成果和相关问题的基础上,提出了基于服务架构(Service-Oriented Architecture,简称SOA)和国际空间标准服务ISO19119的中国生物多样性e-Science平台的三层结构(资源层、服务层和应用层),并对e-Science平台建设的几个重要方向进行阐述:组建强有力的协调组织、数据规范化和扩展、海量数据存储和计算、本体构建和语义分析、专题分析和领域建模、服务标准和服务内容以及科学社区的建设,为我国进行生物多样性e-Science平台建设提供理论依据。

基于SOA的中国生物多样性e-Science平台设想和建设

中国有着非常丰富的生物多样性资源,但是目前的破坏程度也越来越严重。政府决策和科研工作都迫切需要快速便捷地获取相关数据,包括标本、图片、科学文献、野外观测数据、实验室数据和空间数据等。近年来,随着科技部"标本资源平台"项目的启动和Web 2.0思想的逐步影响,数据共享工作取得了很大的进步,通过与国际项目的合作,也极大地促进了生物多样性信息学相关技术在国内的发展和应用。但是,在此过程中也伴随着数据不符合规范、质量低、没有进行标准化整理等问题,影响了数据的集成应用和深度挖掘。本文结合国际生物多样性信息学发展趋势,在分析前期工作的基础上,提出了基于服务架构(SOA)和国际空间标准服务ISO 19119的中国生物多样性e-Science平台的体系结构,并对服务内容进行了说明。这些相对通用的IT技术也能为其他行业的e-Science建设积累经验,为我国e-Science平台的整体发展和提高起到一定的借鉴意义。

油果樟属和近缘属的网脉结构式样(英文)

对油果樟属(Syndiclis Hook.f.)及其近缘属琼楠属(Beilschmiedia Nees)、孔药楠属(Sinopora J.Li et al.)、国产土楠属(Endiandra R.Br.)和Potameia的网脉结构进行了观察。结果表明,它们的网脉结构可分为3种类型:A型网格小且小脉无游离末端;B型网格小但有不分枝或简单分枝的游离末端;C型网格粗且网脉末端多分枝。琼楠属网脉结构多样,具有全部3种类型,其余4属均仅有1种类型,油果樟属、孔药楠属以及土楠属均为A型,明显不同于Potameia的C型网脉结构。

麻黄属的起源时间讨论

利用分子钟对麻黄属起源时间的估测和基于带有生殖特征的大化石标定的最小起源时间有很大的差距,分子钟估测麻黄属起源于古近纪的渐新世,而大化石则标定麻黄属起源不晚于早白垩世巴列姆期。麻黄属化石和分子钟结果之间的冲突至少有三种不同的解释:即古近纪瓶颈、古老支系缓慢绝灭和频繁的基因交流减缓了分子进化速率。本文的分析表明古老支系缓慢绝灭、频繁的基因交流以及rbcL基因不稳定的进化速率一起可以解释分子钟和化石证据之间的冲突。麻黄属现代类型不足以重建该属的系统发育和生物地理过程。