高通量测序技术在植物病毒分类中的应用

植物病毒寄生可引起植物病毒病,甚至对植物造成毁灭性伤害.高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)提供了一种快速、低成本、深度测序的解决方案,在病毒鉴定、新病毒检测和病毒基因组多样性等研究中具有优势,促进了植物病毒分类的研究.本文概述了HTS技术检测病毒的进展、在植物病毒学领域应用案例和该方法检测病毒的优缺点,旨在说明HTS技术对病毒鉴定、新病毒发现和病毒分类的重要贡献,提出新病毒检测和鉴定是亟待解决的问题,为植物病毒病的预防提供参考.

植物基因组重复序列研究进展

重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段,在植物基因组中占有很大比重。重复序列分为2种类型:一种是串联重复序列,主要分布在染色体着丝粒周缘区域、臂间区域和近端粒区域,某些短的串联重复序列均匀分布在基因组中;另一种是散在重复序列,主要是反转录转座子和DNA转座子,通常散布在染色体或多倍体物种某些(个)亚基因组染色体上。目前重复序列的发现和识别技术已成为基因组学的研究热点,归纳这方面的研究进展,概括相关工具的分析特点,总结重复序列功能研究及其在遗传分析中的应用案例,可为发掘重复序列存在的生物学意义及其在物种亲缘关系分析和种质资源鉴定中的应用奠定基础。