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赤水河两种荷马条鳅属鱼类的遗传多样性及谱系生物地理学过程分析 被引量:11
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作者 王雪 唐琼英 +1 位作者 刘飞 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期356-362,共7页
研究以线粒体Cyt b基因为分子标记,对赤水河两种荷马条鳅属(Homatula)鱼类(红尾荷马条鳅和短体荷马条鳅)的遗传多样性及种群结构进行了分析;同时,结合了对在长江上游其他几个水系分布的同种鱼类进行比较,分析其生物地理学过程。遗传多... 研究以线粒体Cyt b基因为分子标记,对赤水河两种荷马条鳅属(Homatula)鱼类(红尾荷马条鳅和短体荷马条鳅)的遗传多样性及种群结构进行了分析;同时,结合了对在长江上游其他几个水系分布的同种鱼类进行比较,分析其生物地理学过程。遗传多样性分析结果表明,5个水系135尾红尾荷马条鳅Cyt b基因序列共检测出42个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.936和0.00493;其中,赤水河种群的分别为0.891和0.00208。3个水系52尾短体荷马条鳅Cyt b基因序列共检测出12个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别0.821和0.01105;赤水河种群的分别为0.646和0.00390。基于ML和BI法构建的单倍型分子系统发育树结果表明,两物种各自构成单系,且得到较强支持。红尾荷马条鳅各种群地理格局分布明显,赤水河种群为并系类群位于分支基部。在短体荷马条鳅支系中,岷江与沱江两个水系的个体相互聚类在一起,而赤水河群体聚成一个分支。赤水河与其他水系不存在共享单倍型,表现了明显的隔离和差异性的地理分布格局。由于这些水系之间地理位置相距较远,推测这种格局的形成不是地质运动造成的水系隔离,而是历史时期水位的高低变化造成鱼类种群的扩散和隔离。错配分析支持赤水河两物种种群扩张的推断,但中性检验却并非全部支持,显示种群历史相对复杂。 展开更多
关键词 赤水河 荷马条鳅属 CYT b 遗传多样性 谱系生物地理学 种群历史
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江湖阻隔对长江中下游湖泊鱼类群落分类多样性的影响 被引量:5
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作者 尚坤钰 姜明 +1 位作者 林鹏程 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期133-146,I0001-I0004,共18页
基于1950s以来的长江中下游湖泊鱼类调查数据,分析通江湖泊与阻隔湖泊的鱼类分类多样性差异,以及通江和阻隔湖泊鱼类分类多样性的时间序列变化,探讨江湖阻隔对鱼类多样性的影响。结果显示,阻隔湖泊鱼类物种数、平均分类差异指数(Δ^(+)... 基于1950s以来的长江中下游湖泊鱼类调查数据,分析通江湖泊与阻隔湖泊的鱼类分类多样性差异,以及通江和阻隔湖泊鱼类分类多样性的时间序列变化,探讨江湖阻隔对鱼类多样性的影响。结果显示,阻隔湖泊鱼类物种数、平均分类差异指数(Δ^(+))和分类差异变异指数(Λ^(+))平均值分别为48.47±14.64、74.02±3.09和736.89±33.80;通江湖泊为76.22±14.40、78.31±0.98和697.31±25.53。阻隔湖泊物种数和Δ~+值显著低于通江湖泊(P<0.001),而阻隔湖泊Λ~+值显著高于通江湖泊(P=0.002),表明阻隔湖泊物种间亲缘关系更近,均匀度下降,即物种分类单元减少,且集中分布于某几个分类阶元,稳定性变差。典型通江与阻隔湖泊鱼类群落分类多样性的时间变化分析发现,两种类型湖泊的鱼类物种数和Δ^(+)值均随时间推移整体呈现下降趋势,Λ^(+)值整体呈现升高趋势;并且阻隔湖泊的Λ^(+)值随阻隔时间增加而大幅上升,Δ^(+)和Λ^(+)值随时间变化多在95%置信区间之外。这表明通江湖泊也受到各种扰动影响,导致鱼类资源整体衰退,分类多样性下降;但阻隔湖泊影响更显著,稳定性更差。基于上述结果,建议恢复阻隔湖泊与长江的连通性;通过水环境治理改善鱼类栖息地质量;科学调整阻隔湖泊鱼类群落结构,放流江湖洄游型鱼类,增加物种多样性。 展开更多
关键词 分类多样性 通江湖泊 阻隔湖泊 时间变化 鱼类群落
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祁连山国家公园青海片区河流和湿地原生生物多样性研究
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作者 王浩骅 张鹏 +6 位作者 罗帅 谷思雨 熊雄 于瑶 李仑 缪炜 熊杰 《水生态学杂志》 2024年第5期9-19,共11页
探索祁连山国家公园河流与湿地的原生生物群落结构特征及其对环境的响应,为片区生物多样性保护与利用提供依据。2020年7-8月对祁连山国家公园青海片区河流和湿地的21个水环境样点进行了水样采集和DNA分离,共获得DNA样品58份,利用宏基因... 探索祁连山国家公园河流与湿地的原生生物群落结构特征及其对环境的响应,为片区生物多样性保护与利用提供依据。2020年7-8月对祁连山国家公园青海片区河流和湿地的21个水环境样点进行了水样采集和DNA分离,共获得DNA样品58份,利用宏基因组测序探究祁连山国家公园青海片区的原生生物种类组成和群落结构,并分析了其与环境因子之间的关系。结果显示:(1)共鉴定和注释到393个原生生物分类单元(operational taxonomic units,OTUs),分属于24门40纲95目126科162属,其中裸藻门、纤毛门种类最多,硅藻门、纤毛门丰度最高;(2)片区不同河流或湿地的原生生物群落结构存在显著差异,河流原生生物多样性显著高于湿地;(3)RDA分析显示原生生物群落主要受水体总磷、水温、pH、总有机碳、溶解氧、盐度、总氮、硝酸盐氮、氨氮和水流速度等环境因子的显著影响;(4)物种共现网络分析显示湿地原生生物群落共现网络较河流更稳定。 展开更多
关键词 原生生物 多样性 宏基因组 河流 湿地 祁连山国家公园
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赤水河半的遗传多样性和种群历史动态分析 被引量:15
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作者 李文静 王环珊 +4 位作者 刘焕章 曹文宣 王小明 于江 朱昕 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期106-113,共8页
在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b(Cyt b)基因序列分析了半种群遗传多样性和种群历史动态。获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单... 在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b(Cyt b)基因序列分析了半种群遗传多样性和种群历史动态。获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单突变位点,29个简约信息位点。168条序列共检测到38种单倍型,单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(P_i)分别为0.895±0.012和0.00487±0.00695。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)显示:遗传变异主要来源于种群内部(80.95%)。F_(st)值统计表明,赤水市种群与茅台、二合、水潦种群之间存在高度分化,与太平镇种群之间存在中度分化,其他种群之间无显著差异,这表明分布在赤水市和其他4个地理种群的半应作为不同的管理单元(MU)进行保护。Mega 6.0软件计算5个种群之间的平均净遗传距离范围为0.004—0.006。中性检验结果为水潦、太平和赤水市的F_s值为负值,表明这3个地理种群的半曾发生过种群扩张。采用1%per Myr的突变速率推算出半水潦种群扩张时间大约在0.43百万年前,太平镇种群大约在0.40百万年前,赤水市种群大约在0.37百万年前。 展开更多
关键词 赤水河 半 遗传多样性 种群历史动态 遗传分化
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基于Cyt b基因的雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河墨脱裂腹鱼的遗传多样性及种群历史动态分析 被引量:9
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作者 俞丹 张智 +4 位作者 张健 林鹏程 熊淑蓉 唐芬莲 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期923-930,共8页
以线粒体Cyt b基因为分子标记,对雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河的墨脱裂腹鱼进行遗传多样性及种群历史动态分析。结果显示,167尾墨脱裂腹鱼样本共检测到21个单倍型,呈现较高的单倍型多样性(h=0.768)和较低的核苷酸多样性(π=0.00167)... 以线粒体Cyt b基因为分子标记,对雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河的墨脱裂腹鱼进行遗传多样性及种群历史动态分析。结果显示,167尾墨脱裂腹鱼样本共检测到21个单倍型,呈现较高的单倍型多样性(h=0.768)和较低的核苷酸多样性(π=0.00167)。基于单倍型构建的分子系统发育树及Network网络关系图表明,所有来自墨脱江段及察隅河的单倍型不能按照地理分布各自聚类,而是相互混杂聚在一起。不同地理种群间的遗传分化指数(FS T)为–0.014—0.771,其中金珠藏布(JZZB)与其他种群呈现出高度分化(FS T:0.372—0.771)。分子方差分析(AMOVA)显示当JZZB种群为一组,剩余6个种群为一组时,组间遗传差异最大,表明JZZB种群与其他种群具有显著分化。相反,虽然察隅河与墨脱江段的地理距离较远,但是察隅河与墨脱江段其他种群之间(除了JZZB)的FST为0.093—0.169,仅显示中等分化水平,表明察隅河种群与雅鲁藏布江种群尚有少量的基因交流。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析显示,雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河的墨脱裂腹鱼种群在末次间冰期(0—0.137 Ma)发生过种群扩张现象。 展开更多
关键词 雅鲁藏布江 墨脱裂腹鱼 遗传多样性 种群历史动态
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水生所与三峡和葛洲坝水利工程中的鱼类保护 被引量:4
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作者 刘焕章 黎明政 常涛 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1040-1044,共5页
葛洲坝和三峡水利枢纽是世界上著名的大型水电工程,对长江中下游防洪、发电、航运、水资源利用等产生了巨大的综合效益。如何减轻葛洲坝-三峡工程对长江流域生态环境及水生生物的影响经历了漫长而激烈的论证过程。中国科学院水生生物研... 葛洲坝和三峡水利枢纽是世界上著名的大型水电工程,对长江中下游防洪、发电、航运、水资源利用等产生了巨大的综合效益。如何减轻葛洲坝-三峡工程对长江流域生态环境及水生生物的影响经历了漫长而激烈的论证过程。中国科学院水生生物研究所(以下简称"水生所")自始至终参加了这两个工程的水域生态环境影响评价和鱼类保护工作,并且做出了重要的贡献。在葛洲坝工程的救鱼对象讨论中,水生所指出救鱼的主要对象是中华鲟;在救鱼的措施方面,水生所科学论证了葛洲坝工程不必修建过鱼设施,中华鲟在葛洲坝下能够自然繁殖,中华鲟的救护措施以人工繁殖放流和产卵场的保护为主。在葛洲坝工程建设后,水生所进一步预测了三峡工程对长江珍稀特有鱼类、重要经济鱼类以及渔业的影响,并且建议在赤水河建立自然保护区,作为长江上游珍稀特有鱼类的庇护所;提出最早的生态调度想法,通过三峡水库的调度形成人造洪峰,刺激"四大家鱼"产卵等等。实践证明,水生所做出的工程影响评价和鱼类保护建议是科学的、符合客观实际的,对国家的决策起到了重要作用。 展开更多
关键词 葛洲坝 三峡 水生所 救鱼 保护措施
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草鱼肠道微生物抗生素抗性基因研究 被引量:12
7
作者 赵帝 徐在言 +2 位作者 吴山功 熊凡 郝耀彤 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第6期111-116,共6页
水产养殖过程中抗生素的过度使用导致耐药菌株不断出现,细菌耐药性成了威胁公共安全的一个全球性问题。抗性基因是细菌产生耐药性的根本原因,动物肠道微生物是抗性基因的储存库,目前我国对水产养殖动物消化道微生物抗生素抗性基因的研... 水产养殖过程中抗生素的过度使用导致耐药菌株不断出现,细菌耐药性成了威胁公共安全的一个全球性问题。抗性基因是细菌产生耐药性的根本原因,动物肠道微生物是抗性基因的储存库,目前我国对水产养殖动物消化道微生物抗生素抗性基因的研究匮乏。为探究草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道微生物中抗性基因的类型和丰度,通过提取草鱼肠道内容物的基因组DNA,采用shotgun宏基因组技术进行测序和序列注释,分析草鱼肠道内容物微生物数据,对比抗性基因数据库ARDB筛选出微生物序列中的抗性基因。结果表明,草鱼肠道内容物共有61554个可注释微生物的基因序列,包括409个真核生物序列、88个古细菌序列和61057个真细菌序列;共得到1011个抗性基因,归为123种基因型,包括78种单抗性基因型(679个单抗性基因),45种多抗性基因型(304个多抗性基因),多抗性基因数量占抗性基因总数的30.1%,说明草鱼肠道中可能存在大量的多重耐药性微生物;检出草鱼肠道中数量最多的抗性基因是抗大环内酯类抗生素基因MacB,产生抗性基因数量最多的是大环内酯类抗生素。研究结果可为水产养殖中抗生素的使用监管提供基础数据,验证了宏基因组测序技术检测抗性基因的可行性。 展开更多
关键词 草鱼 抗性基因 宏基因组测序 微生物
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长江中下游三个湖泊中鳜消化道寄生蠕虫群落的组成与多样性 被引量:4
8
作者 卢明淼 李文祥 +4 位作者 王微微 马幸荣 吴山功 邹红 王桂堂 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期301-306,共6页
鱼类在食物网中的营养位置对其消化道寄生蠕虫的群落结构有重要作用。本研究调查了梁子湖、洞庭湖、鄱阳湖中鳜(Siniperca chuatsi)消化道寄生蠕虫群落的组成和多样性。在3个湖泊中共发现11种寄生蠕虫,优势种均为范尼道佛吸虫(Dollfustr... 鱼类在食物网中的营养位置对其消化道寄生蠕虫的群落结构有重要作用。本研究调查了梁子湖、洞庭湖、鄱阳湖中鳜(Siniperca chuatsi)消化道寄生蠕虫群落的组成和多样性。在3个湖泊中共发现11种寄生蠕虫,优势种均为范尼道佛吸虫(Dollfustrema vaneyi),频率分布中感染有1—2种寄生虫的样本占65%,单个样本中最大物种数为6。3个湖泊中平均物种丰富度为1.53—2.13,Brillouin多样性指数为0.12—0.33,其中鄱阳湖中的多样性最高。梁子湖和洞庭湖之间的Jaccard相似度和百分比相似指数最高。通过比较食物网中不同营养位置鱼类的消化道寄生蠕虫群落结构,发现鳜的消化道寄生虫群落的物种丰富度与多样性水平都高于植食性和杂食性鱼类。研究还讨论了宿主食物组成对消化道寄生蠕虫群落结构的影响。 展开更多
关键词 寄生虫 群落 多样性
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西昌华吸鳅的微卫星引物筛选及赤水河四个地理种群的遗传多样性分析 被引量:5
9
作者 张智 俞丹 +1 位作者 刘飞 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1224-1230,共7页
采用高通量测序法对西昌华吸鳅(Sinogastromyzon sichangensis)基因组进行随机测序并筛选出符合条件的微卫星位点,设计可用于PCR扩增的引物,筛选出29对具有多态性的引物,平均等位基因数为14.5,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.62... 采用高通量测序法对西昌华吸鳅(Sinogastromyzon sichangensis)基因组进行随机测序并筛选出符合条件的微卫星位点,设计可用于PCR扩增的引物,筛选出29对具有多态性的引物,平均等位基因数为14.5,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.620和0.882,多态信息含量(PIC)为0.859。选取其中多态性较高的20对引物在赤水河及其支流的4个地理种群中进行扩增,分析不同地理种群的遗传多样性和种群分化情况。结果表明,赤水镇种群观测杂合度最高(0.669),茅台镇种群观测杂合度最低(0.520);习水河多态信息含量最高(0.868),茅台镇种群多态信息含量最低(0.841)。赤水河干流的几个种群未出现显著分化,而习水河种群与其他3个种群的遗传分化程度较高。AMOVA分析显示遗传变异主要发生在群体内,群体间遗传变异仅占3.33%,群体内遗传变异占96.67%。种群遗传结构分析表明,赤水河干流整体遗传背景趋于一致,而习水河种群则单独聚为一个亚类群。研究为西昌华吸鳅的资源保护和种群遗传学研究提供了基础资料。 展开更多
关键词 西昌华吸鳅 微卫星 引物筛选 遗传多样性 遗传分化
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长江流域■种群遗传多样性和遗传结构分析 被引量:23
10
作者 范启 何舜平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期627-635,共9页
鱼类群体遗传学研究主要集中在经济鱼类或濒危物种,然而一些经济价值较低的物种的遗传结构却甚少关注。因此,研究选择了经济价值较低的■(Hemiculter leucisculus),共计323尾个体分别来自13个长江流域及其附属湖泊的自然群体。通过扩增... 鱼类群体遗传学研究主要集中在经济鱼类或濒危物种,然而一些经济价值较低的物种的遗传结构却甚少关注。因此,研究选择了经济价值较低的■(Hemiculter leucisculus),共计323尾个体分别来自13个长江流域及其附属湖泊的自然群体。通过扩增线粒体DNA Cytb基因序列片段(1100 bp),以探讨■种群遗传结构和遗传多样性。遗传多样性分析呈现出高单倍型多样性和高核苷酸多样性的模式,表明该种群在长江流域较为稳定。另外,基于线粒体细胞色素b基因的系统发育分析,显示■有5个线粒体谱系(谱系A-F)组成。中性检验和核苷酸错配分布分析均显示谱系A、B、E、F曾经历过种群扩张,并且呈现从上游向中游扩张的规律。谱系间较高且显著的遗传分化指数和显著的系统进化关系,均表明谱系A-F之间存在明显的遗传分化,暗示长江流域可能至少存在4个不同线粒体DNA水平上的种。■种群的遗传结构和多样性可能受到了长江流域特定格局的影响。 展开更多
关键词 遗传结构 细胞色素B基因 遗传多样性 长江流域
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甘肃省3种裂腹鱼遗传多样性与地理种群分化 被引量:4
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作者 娄晋铭 张智 +1 位作者 王太 高坚 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期77-84,共8页
于甘肃省境内长江水系、黄河水系和内陆河水系共8个采样点,采集3种裂腹鱼亚科鱼类——黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)、祁连裸鲤(Gymnocypris chilianensis)和嘉陵裸裂尻鱼(Schizopygopsis kialingensis)样本294尾,以线粒体Cytb... 于甘肃省境内长江水系、黄河水系和内陆河水系共8个采样点,采集3种裂腹鱼亚科鱼类——黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)、祁连裸鲤(Gymnocypris chilianensis)和嘉陵裸裂尻鱼(Schizopygopsis kialingensis)样本294尾,以线粒体Cytb基因为分子标记,对3种裂腹鱼的系统发育关系进行分析,并对其不同地理种群的遗传多样性现状与遗传分化情况进行研究。基于NJ和BI法构建的单倍型分子系统发育树结果发现,黄河裸裂尻鱼构成单系,且具有较高支持率;而嘉陵裸裂尻鱼位于祁连裸鲤的分支内部。遗传多样性分析结果显示,70尾黄河裸裂尻鱼的Cytb基因共检测出23个单倍型,单倍型多样性及核苷酸多样性分别为0.917和0.00310;132尾祁连裸鲤的Cytb基因共检测出28个单倍型,单倍型多样性及核苷酸多样性分别为0.819和0.00982;92尾嘉陵裸裂尻鱼的Cytb基因共检测出13个单倍型,单倍型多样性及核苷酸多样性分别为0.706和0.00233。种群遗传分化研究结果表明,这3种裂腹鱼同一物种的不同地理种群间均存在显著的遗传分化,该结果揭示了地理隔离对3种裂腹鱼有显著的阻隔影响,对整体的分化适应有重要作用,因此在资源保护管理中应当作为不同的单元分别加以对待。 展开更多
关键词 裂腹鱼 CYTB基因 遗传多样性 种群分化 甘肃省
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瘤胃纤毛虫体外培养技术研究进展
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作者 徐勤辉 何金英 +7 位作者 陆源鸿 彭成 鲁小悦 杨紫贤 熊杰 姜传奇 缪炜 冯金梅 《江汉大学学报(自然科学版)》 2024年第4期45-54,共10页
瘤胃纤毛虫是-类主要生活在反刍动物瘤胃内的单细胞真核微生物,可能在瘤胃高效降解植物纤维、调节瘤胃发酵速率和参与瘤胃温室气体甲烷产生等方面具有重要作用。深入探究瘤胃纤毛虫的功能及其对宿主的影响,实现其体外培养是-项不可或缺... 瘤胃纤毛虫是-类主要生活在反刍动物瘤胃内的单细胞真核微生物,可能在瘤胃高效降解植物纤维、调节瘤胃发酵速率和参与瘤胃温室气体甲烷产生等方面具有重要作用。深入探究瘤胃纤毛虫的功能及其对宿主的影响,实现其体外培养是-项不可或缺的技术手段。综述了瘤胃纤毛虫体外培养技术研究进展,首先介绍了瘤胃纤毛虫体外培养的国内外研究现状,然后概述了影响瘤胃纤毛虫体外培养的因素,最后指出建立的瘤胃纤毛虫体外培养体系的应用及前景,为建立稳定可控的瘤胃纤毛虫体外单种生长与增殖培养体系提供参考。 展开更多
关键词 真核微生物 瘤胃纤毛虫 体外培养 厌氧培养
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基于线粒体细胞色素b基因的黑鳍鳈(Sarcocheilichthys nigripinnis)生物地理学过程分析 被引量:9
13
作者 刘思情 唐琼英 +1 位作者 李小娟 刘焕章 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期437-445,共9页
黑鳍鲸(Sarcocheilichthys nigripinnis)为广泛分布于东亚地区的小型淡水鱼类,是生物地理学研究的良好材料。该研究以线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列为分子标记,对中国8个水系20个采样点的黑鳍鲸共142尾个体进行遗传变异及生物地... 黑鳍鲸(Sarcocheilichthys nigripinnis)为广泛分布于东亚地区的小型淡水鱼类,是生物地理学研究的良好材料。该研究以线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列为分子标记,对中国8个水系20个采样点的黑鳍鲸共142尾个体进行遗传变异及生物地理学过程分析。遗传多样性分析结果表明,142条Cytb基因序列共检测出56个单倍型,总体单倍型多样性较高(h=0.971),而核苷酸多样性较低(a=0.0212),平均遗传距离较小(2.2%)。分子系统发育树结果表明,黑鳍鲸种群分为7个谱系,以秦岭为界可分为南、北两大支系,北方支系分化时间较早(谱系I)而南方支系分化程度较高(谱系II~VII)。该研究结果进一步揭示了克氏鲸(sczerskii)的物种形成过程,估算其祖先在较晚近时期(~1.03Ma)由黄河水系的黑鳍鲸分化而来。谱系生物地理学分析显示,黑鳍鲸的各地理种群表现为由北向南逐渐演化的趋势,地理隔离可能是限制该物种扩散和基因交流的主要原因。分子钟分析显示,分化时间发生于0.95~3.92Ma。种群历史动态结果则推测黑鳍鲸经历过种群扩张,且该过程可能与更新世冰期与间冰期的更迭相关。 展开更多
关键词 系统谱系生物地理学 黑鳍鳈 细胞色素B基因 更新世冰期 地理隔离
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武汉东湖浮游生物宏基因组与环境重金属的关系 被引量:9
14
作者 颜庆云 余育和 冯伟松 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期52-56,共5页
采用针对16SrRNA和18SrRNA基因的引物,对武汉东湖不同营养水平湖区的浮游生物宏基因组进行凝胶电泳分析(PCR-DGGE)的指纹分析,并探讨宏基因组与环境重金属的关系.结果表明,PCR-DGGE分析共获得82条谱带,其多态率为82.9%,特有谱带占31.7%.... 采用针对16SrRNA和18SrRNA基因的引物,对武汉东湖不同营养水平湖区的浮游生物宏基因组进行凝胶电泳分析(PCR-DGGE)的指纹分析,并探讨宏基因组与环境重金属的关系.结果表明,PCR-DGGE分析共获得82条谱带,其多态率为82.9%,特有谱带占31.7%.I^V站点的谱带分别为36,34,44,50,56条.5个站点浮游生物群落PCR-DGGE指纹结构的聚类分析(UPGMA)分成两大类:I、II、Ⅲ站为一类,IV、V站为一类,这与重金属(铅、铬、汞、镉、砷、铜)浓度对各站点的聚类分枝关系相一致.相关分析显示,变性梯度凝胶电泳(DGGE)谱带所代表的分类单元数(OTUs)与镉、铬的浓度存在较明显的相关性,其相关系数分别为-0.942(P<0.05)和-0.928(P<0.05). 展开更多
关键词 浮游生物群落 宏基因组 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 重金属
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西藏温泉两种中国新记录纤毛虫第一双小核草履虫和明布雷斯四膜虫的形态学和系统发育学研究 被引量:1
15
作者 姜传奇 谷思雨 +2 位作者 安瑞志 巴桑 缪炜 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期197-205,共9页
研究利用活体观察、蛋白银和氨银染色技术对采自西藏温泉的寡膜纲咽膜类纤毛虫第一双小核草履虫(Paramecium primaurelia)和膜口类纤毛虫明布雷斯四膜虫(Tetrahymena mimbres)进行了形态学研究,首次描述了这两种纤毛虫细胞核器的形态和... 研究利用活体观察、蛋白银和氨银染色技术对采自西藏温泉的寡膜纲咽膜类纤毛虫第一双小核草履虫(Paramecium primaurelia)和膜口类纤毛虫明布雷斯四膜虫(Tetrahymena mimbres)进行了形态学研究,首次描述了这两种纤毛虫细胞核器的形态和位置、纤毛图式和口膜的排布模式;并且测定了SSU rDNA和COXⅠ标记基因序列,基于这两种基因的系统发育树均支持P.primaurelia聚在草履虫P.aurelia复合种中,T.mimbres聚在四膜虫T.borealis类群中。两种纤毛虫均为中国新记录种,且首次在高原温泉中发现,不仅为西藏地区温泉原生动物生物资源的发掘提供新的方法和思路,也为原生动物环境适应性研究提供基础资料。 展开更多
关键词 西藏温泉 纤毛虫 新记录种 形态学 系统发育学
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青海湖流域原生动物群落结构及影响因素研究
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作者 刘瑜 罗帅 +6 位作者 张鹏 王雪艳 熊杰 熊雄 吴辰熙 姜传奇 缪炜 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2023年第4期1-9,共9页
原生动物对环境变化反应敏锐,是水生态系统微生物食物网、物质循环和能量流动中的重要结构和功能组成部分。青海湖作为我国最大的内陆咸水湖,是维系青藏高原生态安全的重要水体,是世界高原内陆湖泊湿地类型的典型代表。为了探究青海湖... 原生动物对环境变化反应敏锐,是水生态系统微生物食物网、物质循环和能量流动中的重要结构和功能组成部分。青海湖作为我国最大的内陆咸水湖,是维系青藏高原生态安全的重要水体,是世界高原内陆湖泊湿地类型的典型代表。为了探究青海湖流域原生动物群落结构及其与环境因子之间的关系,于2020年8月对青海湖流域的入湖河流、湖滨带、主湖区及子湖共32个样点进行水环境样品采集,共获得水体样品95份,利用宏基因组测序技术和生物信息学方法从分子水平开展了该流域原生动物多样性和群落结构及其影响因素研究。主要结果如下:(1)共注释到176个原生动物分类单元(Operational Taxonomic Units,OTU),隶属于12门19纲43目61科72属;(2)青海湖流域原生动物多样性为入湖河流>湖滨带>子湖>主湖区,且4类水体环境原生动物群落结构存在显著差异;(3)原生动物群落受水体酸碱度、盐度、水温、溶解性总固体、浊度、总氮、总磷等环境因子的影响;(4)原生动物与其他浮游生物共现网络从入湖河流、湖滨带、子湖到主湖区,模块性逐渐变低,生物类群间的互作网络逐渐碎片化。青海湖流域原生动物的调查结果可为将来该流域的水生态环境健康评估提供依据。 展开更多
关键词 原生动物 宏基因组 多样性 群落结构 青海湖流域
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黑龙江省典型城市湿地龙凤湿地和呼兰河口湿地的原生生物分子多样性
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作者 刘斌 刘真诚 +4 位作者 罗帅 陈凯 熊杰 姜传奇 缪炜 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期352-362,共11页
城市湿地是城市生态环境的重要组成部分,具有多种生态及社会服务功能。单细胞真核的原生生物是湿地水生态系统物质和能量流动的关键环节,是湿地生态功能和生态健康状况的敏感指示者。本研究基于高通量测序技术,对黑龙江省两个典型城市... 城市湿地是城市生态环境的重要组成部分,具有多种生态及社会服务功能。单细胞真核的原生生物是湿地水生态系统物质和能量流动的关键环节,是湿地生态功能和生态健康状况的敏感指示者。本研究基于高通量测序技术,对黑龙江省两个典型城市湿地即沼泽型的龙凤湿地和河川型的呼兰河口湿地的真核微生物18S rRNA基因V9区进行测序,共获得5713个操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)。通过两个湿地原生生物物种分类和相对丰度、α多样性、β多样性、主坐标分析(principal coordinate analysis,PCoA),并结合环境因子的冗余分析(redundancy analysis,RDA),探讨两个湿地原生生物的多样性、群落组成及其与环境因子的关系。主要结果如下:(1)两个湿地共鉴定到原生生物有24门74纲114目135科265属;(2)两个湿地原生生物群落的空间分布差异显著;(3)溶解氧、水温、盐度是影响两个湿地原生生物群落结构的关键环境因子。本研究利用高通量测序技术进行黑龙江典型城市湿地的原生生物调查,有助于全面系统地了解高寒、高纬度城市湿地的原生生物群落,为龙凤湿地和呼兰河口湿地的水环境监测和健康评估提供基础和参考。 展开更多
关键词 城市湿地 原生生物 高通量测序 群落结构 物种多样性
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长江上游圆筒吻鮈年龄与生长的研究 被引量:13
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作者 王美荣 杨少荣 +3 位作者 刘飞 黎明政 但胜国 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期262-269,共8页
于2008—2010年在长江上游四川合江和重庆木洞江段共采集圆筒吻鮈样本511尾,研究了其年龄与生长特征,并提出了合理的鱼类资源保护对策。结果表明,所采集的圆筒吻鮈分6个年龄组,2—4龄居多,占95.7%;体长与鳞径为直线正相关,雌雄群体间无... 于2008—2010年在长江上游四川合江和重庆木洞江段共采集圆筒吻鮈样本511尾,研究了其年龄与生长特征,并提出了合理的鱼类资源保护对策。结果表明,所采集的圆筒吻鮈分6个年龄组,2—4龄居多,占95.7%;体长与鳞径为直线正相关,雌雄群体间无显著差异,表达式为L=51.28 R+37.45(r=0.85,n=397);各龄组、雌雄群体的实测体长均值和退算体长均值无明显差异(t=0.751,P>0.05);体长与体重呈幂函数关系,雌雄群体间无显著差异,表达式为W=8×10 6L3.099(r=0.97,n=397),其生长属等速增长类型;生长规律可以用von Bertalanffy方程表示,分别为:Lt=348.78[1 e 0.18(t+1.15)],Wt=603.17[1 e 0.18(t+1.15)]3.099;生长拐点处的年龄为5.12,此时的体长和体重分别为236.23 mm和180.33 g;圆筒吻鮈个体出现小型化现象;根据研究,长江上游圆筒吻鮈处于不合理的开发状态,应限制捕捞、加强保护。 展开更多
关键词 圆筒吻鮈 长江上游 年龄 生长
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三峡库区木洞江段翘嘴鲌早期生长特征研究 被引量:5
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作者 朱其广 王健 +2 位作者 杨少荣 高欣 曹文宣 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期983-988,共6页
2013年9—10月在三峡库区木洞江段采集翘嘴鲌(Culter alburnus)幼鱼,摘取微耳石进行耳石微结构分析,推算了翘嘴鲌幼鱼的日龄及孵化日期,探讨其早期生活史阶段的生长特征。结果显示,采集97尾翘嘴鲌幼鱼,体长范围为40—98 mm。翘嘴鲌幼鱼... 2013年9—10月在三峡库区木洞江段采集翘嘴鲌(Culter alburnus)幼鱼,摘取微耳石进行耳石微结构分析,推算了翘嘴鲌幼鱼的日龄及孵化日期,探讨其早期生活史阶段的生长特征。结果显示,采集97尾翘嘴鲌幼鱼,体长范围为40—98 mm。翘嘴鲌幼鱼的微耳石形状为不规则扁椭球形,耳石横截面磨片上具有一个核和一个原基。耳石原基的直径为11.6—27.8μm,平均值为(18.6±3.8)μm。耳石核中心到第一个生长轮的距离为(13.0±4.7)μm。翘嘴鲌幼鱼的日龄为44—104d,推算其孵化日期为2013年6月9日至8月17日,高峰期为2013年7月9日至7月22日。耳石半径与体长、日龄与体长之间均呈显著的线性关系(P<0.05)。耳石日轮宽度随着日龄的增加不断变化显示,三峡库区翘嘴鲌早期生活史阶段的生长速率不断变化,日平均生长率为0.774 mm/d。 展开更多
关键词 三峡水库 翘嘴鲌 微耳石 日龄 早期生长
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三峡水库产漂流性卵鱼类繁殖现状及水文需求研究 被引量:17
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作者 黎明政 马琴 +1 位作者 陈林 刘焕章 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第S01期84-96,共13页
为了解三峡库区产漂流性卵鱼类的自然繁殖对三峡水库调蓄的响应,研究于2016和2017年5—7月在三峡库区忠县江段进行鱼类早期资源调查。结果表明,三峡库区鱼类早期资源物种多样性较高,共采集到鱼类60种,其中产漂流性卵鱼类30种。鱼卵中贝... 为了解三峡库区产漂流性卵鱼类的自然繁殖对三峡水库调蓄的响应,研究于2016和2017年5—7月在三峡库区忠县江段进行鱼类早期资源调查。结果表明,三峡库区鱼类早期资源物种多样性较高,共采集到鱼类60种,其中产漂流性卵鱼类30种。鱼卵中贝氏䱗Hemiculter bleekeri、银Squalidus argentatus数量占优势,仔鱼中鲌亚科的䱗属和飘鱼属数量占优势。三峡库区鱼类早期资源量丰富,2016年和2017年调查期间流经忠县断面鱼卵的估算总量分别为70.41和34.54亿粒;仔鱼总量为1037.63和344.27亿尾;四大家鱼卵苗总量分别为29.09和21.17亿粒/尾。产漂流性卵鱼类在三峡库区忠县至涪陵江段的繁殖高峰在6月中旬至7月中旬,即三峡水库调蓄至防洪限制水位145 m之后的时段,而在6月上旬之前仅有少量繁殖活动发生;在涪陵以上,尤其是长寿以上江段5月中旬即有较大规模的繁殖。通过对三峡库区忠县至涪陵江段产漂流性卵鱼类繁殖水文需求的分析,表明四大家鱼仅在有持续涨水的条件下繁殖,而贝氏䱗和银对涨水的依赖程度很小。研究表明,三峡水库的鱼类早期资源物种多样、资源丰富,产漂流性卵鱼类在库区涪陵以下江段的繁殖时间主要在6月上旬以后,且产卵规模较小,而库尾及上游江段是三峡库区鱼类早期资源的主要来源地。在金沙江下游梯级开发的形势下,需要加强对三峡库尾及上游江段产漂流性卵鱼类繁殖所需水文条件的维护以及对产卵场的保护。 展开更多
关键词 鱼类早期资源 分类回归树 四大家鱼
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