一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征分析

目的分析一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征。方法肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy分离自我院血液科一位患者的粪便标本,使用仪器BD Phenix-M50鉴定菌株并测定最小抑菌浓度;酶联免疫层析试验和PCR方法检测碳青霉烯酶基因型;接合试验检测相关质粒的转移性;PacBio和Illumina平台对菌株全基因组测序,并在BacWGSTdb数据库中检索菌株MLST分型、耐药基因和质粒类型,使用软件Easyfig_2.2.3比对基因组和开放读码框序列,BRIG v0.95生成可视化质粒圈图。结果肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy对碳青霉烯类抗生素耐药,MLST分型为ST11型,bla_(KPC-2)和blaNDM-5碳青霉烯酶基因阳性;接合子bla_(KPC-2)基因阳性,blaNDM-5阴性;全基因组测序显示菌株含有1个染色体和3个质粒;肺炎克雷伯菌KP69和KP19-2029等与本研究菌株染色体基因组相似性大于99.9%,且其各自携带的不同种类的质粒上含有相似的IncR和IncFⅠ耐药基因融合区,bla_(KPC-2)基因位于此融合区中一个由Tn3-△Tn4401-Tn1721/Tn1722序列演化而来的两端插入IS26转座酶基因的结构中;blaNDM-5基因位于一种含有噬菌体插入片段特殊质粒的Ⅰ型转座子上,两端也插入了IS26转座酶基因。结论ST11型肺炎克雷伯菌携带bla_(KPC-2)的IncR和IncFⅡ耐药基因融合区与染色体基因组可能一起广泛存在,特殊质粒携带的blaNDM-5基因可能是通过IS26转座元件介导的基因重组方式偶然获得;携带bla_(KPC-2)基因的ST11型肺炎克雷伯菌在中国广泛传播并能通过IS26转座元件获得其他碳青霉烯酶基因的能力应引起重视。