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海量医学数据处理框架及快速体绘制算法
被引量:
7
1
作者
薛健
田捷
+1 位作者
戴亚康
陈健
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第12期3237-3248,共12页
设计并实现了一套针对海量数据的处理和分析算法框架,并将其融入实验室早先开发完成的医学影像算法研发平台MITK(medical imaging toolkit)中,真正建立起一个海量医学影像数据的处理平台,并在此基础上研究了针对海量数据的基于光线投射...
设计并实现了一套针对海量数据的处理和分析算法框架,并将其融入实验室早先开发完成的医学影像算法研发平台MITK(medical imaging toolkit)中,真正建立起一个海量医学影像数据的处理平台,并在此基础上研究了针对海量数据的基于光线投射和三维纹理的快速体绘制算法,提出了一种半自适应分块的方法对原始数据进行分块,在不对分块速度产生太大影响的基础上得到了更好的分块结果,同时使用图形硬件来进一步加速整个算法的绘制流程.实验结果表明了该平台和算法对于海量医学数据处理和可视化的有效性.
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关键词
海量数据处理
医学影像可视化
体绘制
算法研发平台
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职称材料
Monte Carlo方法在扩散光学成像仿真中的应用
被引量:
2
2
作者
刘凯
田捷
+3 位作者
杨薇
秦承虎
徐敏
刘丹
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2009年第5期1216-1225,共10页
综述了描述前向问题的各种模型,包括解析解方法、数值方法和统计方法.特别地,就生物自发光多谱段光源的实例介绍了MonteCarlo方法.在光学成像领域,针对不同的成像模态、对成像质量的要求以及所需要的信息,MC方法有3种主要形式:连续波、...
综述了描述前向问题的各种模型,包括解析解方法、数值方法和统计方法.特别地,就生物自发光多谱段光源的实例介绍了MonteCarlo方法.在光学成像领域,针对不同的成像模态、对成像质量的要求以及所需要的信息,MC方法有3种主要形式:连续波、时域和频域.不仅揭示了每种形式的基本原理,同时也相应地介绍了其在本领域的典型应用及软件.通过这些应用可以看出,MC方法对于扩散光学成像,特别是最近几年的在体无创实时成像的发展发挥着重要作用.
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关键词
蒙特卡洛方法
光学成像
光学分子影像
光子传输
扩散光学成像
连续波
时域
频域
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职称材料
基于局部空间活动模式信息提取脑激活区
被引量:
1
3
作者
甄宗雷
田捷
张慧
《自然科学进展》
北大核心
2007年第9期1189-1196,共8页
伴随着功能磁共振成像(f MRI)实验数据的急剧增长,合理有效的f MRI数据分析技术显得越发重要.当前的f MRI数据分析一般基于一元统计方法,通过孤立分析每个体素的时间序列来决定该体素是否被激活,没有考虑隐含在局部脑区内的脑激活模式信...
伴随着功能磁共振成像(f MRI)实验数据的急剧增长,合理有效的f MRI数据分析技术显得越发重要.当前的f MRI数据分析一般基于一元统计方法,通过孤立分析每个体素的时间序列来决定该体素是否被激活,没有考虑隐含在局部脑区内的脑激活模式信息,无法检测到那些对刺激反应较为微弱的体素.文中针对当前f MRI数据一元分析的不足,提出了一种采用局部脑区活动模式间多元距离(local multivariate distance mapping,LMDM)的方法来对脑激活区进行检测.LMDM使用多元模式来表示不同刺激条件对应的局部脑区活动,并利用不同模式间的多元距离作为统计量来度量脑区活动在不同刺激条件下的区别,从而可以有效利用局部脑区信息来提取脑激活区.文中分别采用一元GLM方法,LMDM方法对仿真数据和真实实验数据进行了分析,并作了定量比较.结果均表明LMDM方法可以比一元GLM方法更完整地检测到脑激活区.
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关键词
fMRI脑功能成像
统计分析
多元距离
局部空间模式
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职称材料
题名
海量医学数据处理框架及快速体绘制算法
被引量:
7
1
作者
薛健
田捷
戴亚康
陈健
机构
中国科学院
研究
生院计算与通信工程
学院
中国科学院自动化研究所复杂系统与智能科学重点实验室医学图像处理研究组
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第12期3237-3248,共12页
基金
国家自然科学基金Nos.60532050,30600151,30500131,30672690
国家重点基础研究发展计划(973)No.2006CB705700
+3 种基金
国家高技术研究发展计划(863)No.2006AA04Z216
中国科学院百人计划
中国科学院科研装备研制项目Nos.YZ0642,YZ200766
北京市自然科学基金Nos.4051002,4071003~~
文摘
设计并实现了一套针对海量数据的处理和分析算法框架,并将其融入实验室早先开发完成的医学影像算法研发平台MITK(medical imaging toolkit)中,真正建立起一个海量医学影像数据的处理平台,并在此基础上研究了针对海量数据的基于光线投射和三维纹理的快速体绘制算法,提出了一种半自适应分块的方法对原始数据进行分块,在不对分块速度产生太大影响的基础上得到了更好的分块结果,同时使用图形硬件来进一步加速整个算法的绘制流程.实验结果表明了该平台和算法对于海量医学数据处理和可视化的有效性.
关键词
海量数据处理
医学影像可视化
体绘制
算法研发平台
Keywords
out-of-core data processing
medical image visualization
volume rendering
algorithm toolkit
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
Monte Carlo方法在扩散光学成像仿真中的应用
被引量:
2
2
作者
刘凯
田捷
杨薇
秦承虎
徐敏
刘丹
机构
中国科学院自动化研究所复杂系统与智能科学重点实验室医学图像处理研究组
中国科学院
研究
生院
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2009年第5期1216-1225,共10页
基金
国家自然科学基金Nos.30672690,30600151,90209008,60532050,60621001,30873462
国家重点基础研究发展计划(973)No.2006CB705700
+4 种基金
长江学者和创新团队发展计划No.IRT0645
中国科学院百人计划
中国科学院科研装备研制项目Nos.YZ0642,YZ200766
海外青年学者合作研究基金No.30528027
北京市自然科学基金No.4071003~~
文摘
综述了描述前向问题的各种模型,包括解析解方法、数值方法和统计方法.特别地,就生物自发光多谱段光源的实例介绍了MonteCarlo方法.在光学成像领域,针对不同的成像模态、对成像质量的要求以及所需要的信息,MC方法有3种主要形式:连续波、时域和频域.不仅揭示了每种形式的基本原理,同时也相应地介绍了其在本领域的典型应用及软件.通过这些应用可以看出,MC方法对于扩散光学成像,特别是最近几年的在体无创实时成像的发展发挥着重要作用.
关键词
蒙特卡洛方法
光学成像
光学分子影像
光子传输
扩散光学成像
连续波
时域
频域
Keywords
Monte Carlo method
optical imaging
optical molecular imaging
photon transport
continuous waves
time-domain
frequency-domain
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
下载PDF
职称材料
题名
基于局部空间活动模式信息提取脑激活区
被引量:
1
3
作者
甄宗雷
田捷
张慧
机构
中国科学院自动化研究所
复杂
系统
与智能科学
重点
实验室
出处
《自然科学进展》
北大核心
2007年第9期1189-1196,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB705700)
海外青年学者合作研究基金(批准号:30528027)
+4 种基金
国家自然科学基金(批准号:30600151
30500131
60532050)
北京市自然科学基金(批准号:4051002
4071003)资助
文摘
伴随着功能磁共振成像(f MRI)实验数据的急剧增长,合理有效的f MRI数据分析技术显得越发重要.当前的f MRI数据分析一般基于一元统计方法,通过孤立分析每个体素的时间序列来决定该体素是否被激活,没有考虑隐含在局部脑区内的脑激活模式信息,无法检测到那些对刺激反应较为微弱的体素.文中针对当前f MRI数据一元分析的不足,提出了一种采用局部脑区活动模式间多元距离(local multivariate distance mapping,LMDM)的方法来对脑激活区进行检测.LMDM使用多元模式来表示不同刺激条件对应的局部脑区活动,并利用不同模式间的多元距离作为统计量来度量脑区活动在不同刺激条件下的区别,从而可以有效利用局部脑区信息来提取脑激活区.文中分别采用一元GLM方法,LMDM方法对仿真数据和真实实验数据进行了分析,并作了定量比较.结果均表明LMDM方法可以比一元GLM方法更完整地检测到脑激活区.
关键词
fMRI脑功能成像
统计分析
多元距离
局部空间模式
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海量医学数据处理框架及快速体绘制算法
薛健
田捷
戴亚康
陈健
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2008
7
下载PDF
职称材料
2
Monte Carlo方法在扩散光学成像仿真中的应用
刘凯
田捷
杨薇
秦承虎
徐敏
刘丹
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2009
2
下载PDF
职称材料
3
基于局部空间活动模式信息提取脑激活区
甄宗雷
田捷
张慧
《自然科学进展》
北大核心
2007
1
下载PDF
职称材料
已选择
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