中国CDC传染病所生物信息疾控应用交流会成功举办

随着测序技术和实验技术的不断发展进步．基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据快速膨胀；尤其是高通量测序技术的发展，使得每次测序最多可同时获得500～600G的数据量。积累的海量数据蕴含着无数潜在发现和突破的可能．使得科学家的研究重点从获取数据逐步向解释数据转变。生物学家急需存储和获取数据的平台．以及一系列的算法和计算工具对各种组学的海量生物数据进行研究、分析和挖掘，找出其科学意义。

2008国际新发传染病学术交流大会

由世界卫生组织（WHO）、美国微生物学会（ASM）、公共卫生实验联合会（APHL）以及美国CDC等五家机构联合组织的“2008国际新发传染病学术交流大会”于3月16-19日在美国亚特兰大胜利召开。本次大会的宗旨是加强全球国际化合作。共同应对新发及再发传染病的威胁。来自世界各地的专家，学者会聚一堂，就21世纪全球公共卫生健康安全、

2008国际新发传染病学术交流大会

由世界卫生组织（WHO）、美国微生物学会（ASM）、公共卫生实验联合会（APHL）以及美国CDC等五家机构联合组织的“2008国际新发传染病学术交流大会”于3月16—19日在美国亚特兰大胜利召开。本次大会的宗旨是加强全球国际化合作，共同应对新发及再发传染病的威胁。来自世界各地的专家，学者会聚一堂，

杭州市26株单增李斯特菌脉冲场凝胶电泳分型

目的:为了解杭州市各类食品中分离到的单核细胞增生李斯特菌各菌株之间的遗传相关性及流行病学的意义。方法:对所分离到的LM菌株进行传统生化检测和脉冲场凝胶电泳分型。结果:所分离到的26株LM菌株传统生化反应没有区别,PFGE分成14个图谱类型,各型之间不紧密相关。结论:杭州市食品中LM的污染来源于不同的克隆株,菌型分散,未发现单个基因型菌株流行的迹象。

大肠杆菌O150 O-抗原基因簇的破译和dTDP-鼠李糖合成酶基因的鉴定

利用鸟枪法对大肠杆菌O1 5 0O_抗原基因簇进行测序 ,序列全长 1 35 5 1bp ,用生物信息学的方法进行序列分析 ,共发现 1 1个基因 ,分别为鼠李糖合成酶基因 (rmlB、rmlD、rmlA、rmlC)糖基转移酶基因 (3个 )、O_抗原转运酶基因 (wzx)和O_抗原聚合酶基因 (wzy) ,另外还有两个基因功能未知。用PCR的方法筛选出了针对大肠杆菌O1 5 0的特异基因 ,可以用于基因芯片或PCR方法对大肠杆菌O1 5 0的快速检测。另外 ,通过进化分析发现大肠杆菌O1 5 0的O_抗原基因簇中携带有典型的大肠杆菌鼠李糖合成酶基因 。

嗜吞噬细胞无形体的致病机制的研究进展

嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum,APH)是重要人兽共患病——人粒细胞无形体病(HGA)的病原体。APH专性侵染哺乳动物中性粒细胞,入侵后在细胞内形成包涵体逃逸溶酶体酶的杀伤,APH同时破坏宿主细胞的凋亡和自噬,并抑制宿主细胞的氧化反应等杀菌活性。APH通过一系列毒力分子表达影响宿主细胞,使其在宿主细胞内有效生存和繁殖,最终导致机体感染的发生。

徐州地区急性呼吸道感染患者中人偏肺病毒的检测

目的在本实验室建立一种敏感有效的人偏肺病毒(hMPV)的检测方法、了解徐州地区急性呼吸道患者中人偏肺病毒hMPV的感染情况,分析徐州地区hMPV感染人群的流行病学特点及hMPV感染的临床特征,为hMPV的研究提供一些依据。方法在医院呼吸科门诊就诊的急性呼吸道疾病患者(RTI)中采集咽拭标本,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测hMPV的核蛋白N基因,并对扩增产物进行基因序列的测定后将之与GemBank的hMPV的全序列进行比对。结果2005年1月至2005年3月的75份标本用RT-PCR的方法检测后,确定有12份标本为N基因阳性,检出率为16.0%,扩增产物均经基因序列分析比对。结论徐州地区的急性呼吸系统疾病中存在hMPV感染,且在徐州地区急性呼吸系统疾病中约有16.0%的患者是由hMPV感染引起,其中6岁以下儿童占50%,这些hMPV感染患者的临床症状主要表现为:高烧、咳嗽。

应用直接免疫荧光抗体法(DFA)对媒介蜱、动物伯氏疏螺旋体的检测

目的:通过对媒介蜱、野鼠、家犬伯氏疏螺旋体感染率的调查,了解吉林及东北地区动物伯氏疏螺旋体感染情况。方法:使用直接荧光抗体染色法(DFA)检测,对吉林省9个地区35个市县、55个乡镇进行了媒介蜱带菌率、野鼠、家犬莱姆病感染率调查。结果:蜱标本1349份,带菌率为32.25%(435/1349),其中全沟硬蜱带菌率为:35.84%(444/1239);嗜群血蜱带菌率为:8.18%(9/110)。检测野鼠、家犬1091份,感染率为15.22%(166/1091),其中检测野鼠819份,感染率为17.46%(143/819)。检测狗肾272份,感染率为8.46%(23/272)。结论:吉林省9个地区野生动物、家养动物莱姆病感染较高,加强莱姆病的防控工作势在必行。

22株脑膜炎奈瑟菌对治疗和预防用抗菌药的体外敏感性

目的了解22株脑膜炎奈瑟菌对常用的治疗和预防用抗菌药的体外敏感性。方法采用2005年美国CLSI推荐的琼脂稀释法测试12种抗菌药物对22株脑膜炎柰瑟球菌的MIC。结果22株脑膜炎奈瑟菌对青霉素、氨苄西林、美罗培南、头孢曲松、头孢噻肟和氯霉素的敏感率均为100%;对米诺环素、阿奇霉素和利福平敏感率也为100%;对环丙沙星和左氧氟沙星的敏感率仅为27.3%;对复方磺胺甲噁唑无敏感菌株。结论可以首选窄谱的抗菌药青霉素或氨苄西林治疗脑膜炎奈瑟菌感染;利福平可以作为密切接触人群预防用药。而环丙沙星、左氧氟沙星、复方磺胺甲噁唑有较高的耐药率,建议不作为当前流行菌株的预防用药。

安徽省结核病结核杆菌耐药状况的调查

目的为了解安徽省新发涂阳肺结核病人的耐药状况。方法随机选择安徽皖南、皖中和皖北的6个县结核病项目门诊,收集项目门诊的初治涂阳病人的结核杆菌;采用WHO/IUATLD推荐的比例法,对异烟肼(H)、链霉素(S)、利福平(R)、乙胺丁醇(E)等4种抗结核药敏试验。结果449株结核分枝杆菌中对4种抗结核药物全部敏感者248例,占55.23%;201例耐药,总原发耐药率为44.77%,以耐S为最高,占31.4%。结论安徽省结核病耐药水平是较严重省份,对结核病控制工作将是一个大的挑战,耐药结核杆菌的控制将是下一步结核病控制重点之一。

实验用犬发生布病疫情的研究与分析

在实验动物中发生布病报道较少．作者就一实验动物场的多重感染布病疫情进行了较全面的研究。 某实验动物养殖场．存栏比格犬68只。比格犬嗅觉好，灵敏度高，性格活泼而温和，与人的亲和性强．容易配合进行医学实验．具有良好的均一性、重复性，是国际公认的实验用犬。2004年4月在开展常规检疫中，从5份犬血样中检出3份布氏菌抗体阳性反应．对此我们开展了流行病学调查和相应实验研究。

从蟑螂体内检出O1群霍乱弧菌

霍乱弧菌可引起霍乱的发生,是国家法定的甲类传染病,多检出于水体,海产品和水产品中;而从蟑螂体内检出霍乱弧菌尚未有报道。笔者于2010年12月份从蟑螂体内检出一株O1群霍乱弧菌,稻叶血清型。现将结果报道如下。

第五届国际立克次体学术交流大会

为期三年一届的第五届国际立克次体学术交流大会于2008年5月17-20日在法国马赛国际会议中心召开。来自世界各地40个国家336位专家与代表参加了此次会议。大会分为讲座、口头发言及论文展板等形式对近年立克次体及立克次体病研究进展进行了广泛的学术交流。其中较为突出的是利用现代各种生物技术发现新的立克次体病原体，同时利用立克次体基因组及蛋白组等生物信息理论建立更有效、

热烈祝贺全国无形体及立克次体病实验室质量控制评估会及流行病学现场培训班圆满成功

为在我国省级CDC水平快速建立立克次体实验室检测技术，进一步推动全国立克次体病监测工作系统及全面开展，在中美新发及再发传染病项目的支持下，2008年6月21-26日，中国疾病预防控制中心传染病所立克次体研究室作为国家参考实验室，在吉林省延吉市及珲春市分别举办了首期10省、市立克次体实验室质量控制评估会及现场流行病学培训班。

热烈祝贺全国无形体及立克次体病实验室质量控制评估会及流行病学现场培训班圆满成功

为在我国省级CDC水平快速建立立克次体实验室检测技术，进一步推动全国立克次体病监测工作系统及全面开展，在中美新发及再发传染病项目的支持下，2008年6月21—26日，中国疾病预防控制中心传染病所立克次体研究室作为国家参考实验室，在吉林省延吉市及珲春市分别举办了首期10省、市立克次体实验室质量控制评估会及现场流行病学培训班。

2007年中国14个城市异质性万古霉素中介耐药的金黄色葡萄球菌分子特征

目的研究我国异质性万古霉素中介的金黄色葡萄球菌（hVISA）的分子特征，比较hVISA和万古霉素敏感的金黄色葡萄球菌（VSSA）在分子特征方面的差别。方法收集2007年来自全国14个城市分离的非重复甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌（MRSA）315株，采用PAP—AUC（菌群谱型分析-曲线下面积法）确定hVISA。通过多重PCR对315株MRSA进行SCCmec分型及agr（accessory gene regulator）分型，对PCR产物进行测序确定spa分型，同时检测pvl基因。结果在315株MRSA中共检测出30株hVISA，发生率为9．5％。315株MRSA以SCCmecm为主，占74．3％，其次为SCCmec Ⅱ，占17．8％。在hVISA中SCCmecⅡ的比例明显高于VSSA组（46．7％比14．7％，X^2=18．93，P〈0．001）。所有MRSA的agr分型以agr1为主，占73．6％，其次为agr2，占18．7％，agr3和agrd型MRSA在临床分离株中少见。agr分型在hVISA和VSSA之间有明显的不同，hVISA中agr2的比例显著高于VSSA（53．4％比15．1％,Xz=26．08，P〈0．001）。30株hVISA中有4种spa克隆型，包括t002（i3株）、t037（9株）、t030（6株）和t548（2株）。315株MRSA中pvl基因的携带率非常低，占1．6％。结论hVISA的发生率较高。与VSSA相比，hVISA主要以agr2型为主，与VSSA明显不同。通过spa分型发现hVISA呈多克隆型。

青海省海东地区小型兽空间生态位分析

采用Shannon-Wiener生态位宽度指数和Pianka生态位重叠指数对青海省海东地区不同生境的小型兽类群落进行研究。结果发现,捕获的18种小型兽中,柴达木根田鼠(Microtus limnophilus)的生态位宽度值最大(0.940),洮州绒(Caryomys eva)、黑线姬鼠(Apodemus agrarius)、褐家鼠(Rattusnorvegicus)、黄胸鼠(R.tanezumi)、社鼠(Niviventer confucianus)、花鼠(Tamias sibiricus)、小飞鼠(Pteromysvolans)、中国蹶鼠(Sicista concolor)、中鼩鼱(Sorex caecutiens)生态位宽度值最小(近似值为0)。18种小型兽的空间生态位重叠指数最大为1,最小为0。生态位完全重叠的物种具有较为相似的生物学特性和生态适应性,当资源丰富时,共同利用资源,在资源短缺时则发生竞争。生态位完全不重叠的种类,说明它们对自然资源利用存在明显的差异,生态位分化显著,不存在资源利用竞争。

导读

加强与“一带一路”国家传染病防治领域的交流合作,不仅是打造“健康丝绸之路”和构建“健康命运共同体”的重要内容,也是共建“一带一路”的重要保障。截至2021年1月30日,我国已与171个国家和国际组织签署了205份共建“一带一路”合作文件。“一带一路”国家和地区重要传染病传播风险和监测预警技术研究旨在针对非洲、东亚和东盟、南亚、俄罗斯、中亚和西亚的重点国家和地区开展重要传染病流行病学研究,评估重要传染病传入我国并引发本地传播的风险,探索输入传染病监测预警技术,提升我国输入传染病的防控能力,为“一带一路”倡议实施提供卫生安全保障。

对犬免疫兽用狂犬病疫苗效果的评价

为了预防和控制狂犬病发生,对2种兽用狂犬病(ERA株)活疫苗和3种进口兽用狂犬病灭活疫苗进行了免疫效果和安全性实验。本项试验采用小鼠中和试验和RFFIT试验方法,分别对63只注射了狂犬病(ERA株)活疫苗的健康成年家犬和102只注射了狂犬病灭活疫苗的健康成年家犬进行了免疫抗体监测(按OIE标准,血清抗体滴度≥0.5IU/ml为免疫保护标准);采用ELISA方法监测试验犬唾液中的狂犬病毒抗原并且PCR扩增定性。结果:狂犬病灭活疫苗比兽用狂犬病(ERA株)活疫苗免疫后的血清抗体滴度高、持久性好、安全;注射狂犬病灭活疫苗后,随着血清抗体滴度的升高能有效降低外观健康隐性带毒犬唾液中的病毒量。家养动物定期免疫注射兽用狂犬病灭活疫苗、逐步淘汰狂犬病毒阳性犬是我国控制和消灭狂犬病的重要途径。

全国无形体及立克次体实验室检测技术第2期培训班成功举办

近年来，新发及再发传染病不断出现，对人类生命健康构成严重威胁。为及时应对各种传染病疫情，提高实验室应急技术储备能力，普及推广无形体及立克次体实验室检测技术，中国疾病预防控制中心传染病预防控制所于2010年10月11—15日在北京成功举办了第二期培训班。