粗糙脉孢菌U3 snoRNA基因的鉴定及其表达和功能分析

通过对粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)小RNA的cDNA文库筛选及基因组分析,鉴定了3个U3 snoRNA基因,命名为NcU3A、NcU3B和NcU3C,这3个基因表达的U3 snoRNA的大小分别为262,270和275nt.同时,Northern杂交还揭示出不同大小的U3 snoRNA剪切变体,表明U3 snoRNA的表达存在复杂的转录后加工.粗糙脉孢菌U3snoRNA都具有物种间保守的与18S rRNA配对的功能区;NcU3A及其剪切变体还具有一段过去没有报道的与26S rRNA互补的反义序列,这段反义序列并不指导对应的rRNA位点的甲基化修饰,可能具有rRNA分子伴侣的作用.粗糙脉孢菌U3 snoRNA都是独立转录的基因,每个基因中均包含一个小内含子序列,其插入位点与酵母U3相似,表明它们古老的起源.研究结果对阐明U3snoRNA的结构进化及功能多样性具有重要意义.

果蝇3个新的小分子非编码RNA的鉴定

通过比较基因组和分子生物学方法分析了果蝇属中5种果蝇全基因组内含子区域的保守序列，获得了3个新的非编码RNA基因．其中一个为具有典型的box C／D家族保守元件及结构特征的核仁小分子RNA基因，其功能序列可介导28S rRNA的C2673位点的核糖甲基化修饰．另外两个为miRNA基因，其转录序列可形成典型的miRNA前体茎环结构：在果蝇发育的4个时期均可表达产生长度为23个核苷酸的成熟RNA分子．结果还表明，在长度为100—500bp区间的黑腹果蝇基因内含子中存在396个多物种保守序列（MCIS），这些序列除编码小分子RNA外，还可能与影响基因转录或转录后加工的顺式元件有关．

贾第虫4种新的box H/ACA snoRNA的鉴定及其进化意义

通过构建特异性的cDNA文库,发现并鉴定了4种新的贾第虫boxH/ACAsnoRNA,分别命名为GLsR22,GLsR23,GLsR24和GLsR25.生物信息学分析表明,这些snoRNA均可形成典型的boxH/ACAsnoRNA“双茎环”二级结构;GLsR24和GLsR25可能分别指导贾第虫23SrRNA上U1753和U2396的假尿嘧啶化修饰,而GLsR22和GLsR23属于功能未知的“orphan”snoRNA.新鉴定的boxH/ACAsnoRNA均位于蛋白质基因间隔区中,并且都是由单拷贝基因编码的.与古细菌及其他原生生物中已发现的同类分子相比,贾第虫boxH/ACAsnoRNA具有很多独特特征,提示snoRNA在从原核生物向真核生物进化的过程中可能有不同的进化路线.