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基于孟德尔随机化的肠道菌群与耳鸣之间的因果关系
1
作者
梁茵菲
周靖诗
+6 位作者
张姝琪
李凌伟
顾晶
温志阳
吴冬雪
黎志成
曾祥丽
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第10期1390-1397,共8页
目的:基于孟德尔随机化(MR)研究方法探索肠道菌群与耳鸣之间的因果关系。方法:使用MiBioGen联盟开展的全基因组关联研究(GWAS)(n=18340)个体中肠道微生物群的数据,与耳鸣的汇总统计数据——来自英国生物样本数据库发布的数据进行两样本M...
目的:基于孟德尔随机化(MR)研究方法探索肠道菌群与耳鸣之间的因果关系。方法:使用MiBioGen联盟开展的全基因组关联研究(GWAS)(n=18340)个体中肠道微生物群的数据,与耳鸣的汇总统计数据——来自英国生物样本数据库发布的数据进行两样本MR研究。使用统计模型逆方差加权(IVW)为主要结果,简单模式法(simple mode)、模型选择法(MR_Egger)、加权中位数法(weighted median)和加权模型(weighted mode)作为补充检验,分析肠道微生物群与耳鸣之间的因果关系,Cochran的Q检验和MR-Egger回归法验证结果的稳定性和异质性。结果:IVW分析显示,梭菌纲(class.Clostridia)(OR=0.9682,95%CI:0.9414~0.9958,P=0.0242)、瘤胃球菌属(genus.Ruminococcus1)(OR=0.9594,95%CI:0.9284~0.9916,P=0.0141)和梭菌目(order.Clostridiales)(OR=0.9683,95%CI:0.9413~0.9958,P=0.0243)菌群丰度升高可能会降低耳鸣发病风险;柔壁菌门(phylum.Tenericutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、柔膜菌纲(class.Mollicutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、脱硫弧菌属(genus.Desulfovibrio)(OR=1.0314,95%CI:1.0039~1.0596,P=0.0247)和未命名属(genus.unknowngenus)(OR=1.0345,95%CI:1.0144~1.0550,P=0.0007)菌群丰度升高可能会增加耳鸣发病的风险。工具变量未发现水平多效性及异质性。结论:梭菌纲、瘤胃球菌属和梭菌目可能是耳鸣的潜在保护菌群,柔壁菌门、柔膜菌纲、脱硫弧菌属和未命名属可能是耳鸣的潜在危害因素。
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关键词
耳鸣
肠道菌群
孟德尔随机化
因果推断
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职称材料
主观性耳鸣患者外周血非编码RNA高通量测序初析
2
作者
周靖诗
梁茵菲
+4 位作者
方必兴
刘子锋
王心怡
曾祥丽
黎志成
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第10期1384-1389,共6页
目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circ...
目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和mRNA,并通过公共数据库匹配ncRNA-miRNA-mRNA的调控路径。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对另外10例耳鸣组和10例健康对照组外周血样本进行检测,以验证筛选出的ncRNA和mRNA的差异表达是否具有普遍性。结果:在耳鸣组外周血中发现了13个lncRNA、596个circRNA和38个mRNA存在显著差异表达。13个差异表达的lncRNA均未能匹配到相应的miRNA,未行后续的mRNA匹配分析。596个差异表达的circRNA成功匹配到58个miRNA和595个mRNA,其中有1个mRNA(TOMM7)显示出差异表达,其对应的circRNA和miRNA分别为circ_0051120和miR-615。qPCR结果显示,circ_0051120的表达量在两组间存在显著差异(P<0.05),而TOMM7表达无统计学差异(P>0.05)。结论:circ_0051120可能通过调节TOMM7的表达水平,进而影响线粒体自噬过程,并过度激活NF-κB信号通路以及影响神经网络稳定性,从而在主观性耳鸣的发生和维持过程中发挥重要作用。
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关键词
非编码RNA
主观性耳鸣
高通量测序
TOMM7
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职称材料
题名
基于孟德尔随机化的肠道菌群与耳鸣之间的因果关系
1
作者
梁茵菲
周靖诗
张姝琪
李凌伟
顾晶
温志阳
吴冬雪
黎志成
曾祥丽
机构
中山大学附属第三医院耳鼻咽喉—头颈外科
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第10期1390-1397,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82171151)
广州市科技计划产学研协同创新重大专项(No.201704030081)。
文摘
目的:基于孟德尔随机化(MR)研究方法探索肠道菌群与耳鸣之间的因果关系。方法:使用MiBioGen联盟开展的全基因组关联研究(GWAS)(n=18340)个体中肠道微生物群的数据,与耳鸣的汇总统计数据——来自英国生物样本数据库发布的数据进行两样本MR研究。使用统计模型逆方差加权(IVW)为主要结果,简单模式法(simple mode)、模型选择法(MR_Egger)、加权中位数法(weighted median)和加权模型(weighted mode)作为补充检验,分析肠道微生物群与耳鸣之间的因果关系,Cochran的Q检验和MR-Egger回归法验证结果的稳定性和异质性。结果:IVW分析显示,梭菌纲(class.Clostridia)(OR=0.9682,95%CI:0.9414~0.9958,P=0.0242)、瘤胃球菌属(genus.Ruminococcus1)(OR=0.9594,95%CI:0.9284~0.9916,P=0.0141)和梭菌目(order.Clostridiales)(OR=0.9683,95%CI:0.9413~0.9958,P=0.0243)菌群丰度升高可能会降低耳鸣发病风险;柔壁菌门(phylum.Tenericutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、柔膜菌纲(class.Mollicutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、脱硫弧菌属(genus.Desulfovibrio)(OR=1.0314,95%CI:1.0039~1.0596,P=0.0247)和未命名属(genus.unknowngenus)(OR=1.0345,95%CI:1.0144~1.0550,P=0.0007)菌群丰度升高可能会增加耳鸣发病的风险。工具变量未发现水平多效性及异质性。结论:梭菌纲、瘤胃球菌属和梭菌目可能是耳鸣的潜在保护菌群,柔壁菌门、柔膜菌纲、脱硫弧菌属和未命名属可能是耳鸣的潜在危害因素。
关键词
耳鸣
肠道菌群
孟德尔随机化
因果推断
Keywords
tinnitus
gut microbiota
Mendelian randomization
causal inference
分类号
R740 [医药卫生—神经病学与精神病学]
R764.45 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
主观性耳鸣患者外周血非编码RNA高通量测序初析
2
作者
周靖诗
梁茵菲
方必兴
刘子锋
王心怡
曾祥丽
黎志成
机构
中山大学附属第三医院耳鼻咽喉—头颈外科
中山大学附属第三医院
眩晕
耳
鸣诊疗中心
浙江
大学
医学院
附属
第二
医院
耳
鼻
咽喉—
头颈
外科
中山大学附属第三医院
大数据人工智能中心
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第10期1384-1389,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82171151)
广州市科技计划产学研协同创新重大专项(No.201704030081)。
文摘
目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和mRNA,并通过公共数据库匹配ncRNA-miRNA-mRNA的调控路径。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对另外10例耳鸣组和10例健康对照组外周血样本进行检测,以验证筛选出的ncRNA和mRNA的差异表达是否具有普遍性。结果:在耳鸣组外周血中发现了13个lncRNA、596个circRNA和38个mRNA存在显著差异表达。13个差异表达的lncRNA均未能匹配到相应的miRNA,未行后续的mRNA匹配分析。596个差异表达的circRNA成功匹配到58个miRNA和595个mRNA,其中有1个mRNA(TOMM7)显示出差异表达,其对应的circRNA和miRNA分别为circ_0051120和miR-615。qPCR结果显示,circ_0051120的表达量在两组间存在显著差异(P<0.05),而TOMM7表达无统计学差异(P>0.05)。结论:circ_0051120可能通过调节TOMM7的表达水平,进而影响线粒体自噬过程,并过度激活NF-κB信号通路以及影响神经网络稳定性,从而在主观性耳鸣的发生和维持过程中发挥重要作用。
关键词
非编码RNA
主观性耳鸣
高通量测序
TOMM7
Keywords
non-coding RNAs
subject tinnitus
high-throughput sequencing
TOMM7
分类号
R764.45 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
基于孟德尔随机化的肠道菌群与耳鸣之间的因果关系
梁茵菲
周靖诗
张姝琪
李凌伟
顾晶
温志阳
吴冬雪
黎志成
曾祥丽
《广西医科大学学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
主观性耳鸣患者外周血非编码RNA高通量测序初析
周靖诗
梁茵菲
方必兴
刘子锋
王心怡
曾祥丽
黎志成
《广西医科大学学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
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参考文献
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