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基于孟德尔随机化的肠道菌群与耳鸣之间的因果关系
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作者 梁茵菲 周靖诗 +6 位作者 张姝琪 李凌伟 顾晶 温志阳 吴冬雪 黎志成 曾祥丽 《广西医科大学学报》 CAS 2024年第10期1390-1397,共8页
目的:基于孟德尔随机化(MR)研究方法探索肠道菌群与耳鸣之间的因果关系。方法:使用MiBioGen联盟开展的全基因组关联研究(GWAS)(n=18340)个体中肠道微生物群的数据,与耳鸣的汇总统计数据——来自英国生物样本数据库发布的数据进行两样本M... 目的:基于孟德尔随机化(MR)研究方法探索肠道菌群与耳鸣之间的因果关系。方法:使用MiBioGen联盟开展的全基因组关联研究(GWAS)(n=18340)个体中肠道微生物群的数据,与耳鸣的汇总统计数据——来自英国生物样本数据库发布的数据进行两样本MR研究。使用统计模型逆方差加权(IVW)为主要结果,简单模式法(simple mode)、模型选择法(MR_Egger)、加权中位数法(weighted median)和加权模型(weighted mode)作为补充检验,分析肠道微生物群与耳鸣之间的因果关系,Cochran的Q检验和MR-Egger回归法验证结果的稳定性和异质性。结果:IVW分析显示,梭菌纲(class.Clostridia)(OR=0.9682,95%CI:0.9414~0.9958,P=0.0242)、瘤胃球菌属(genus.Ruminococcus1)(OR=0.9594,95%CI:0.9284~0.9916,P=0.0141)和梭菌目(order.Clostridiales)(OR=0.9683,95%CI:0.9413~0.9958,P=0.0243)菌群丰度升高可能会降低耳鸣发病风险;柔壁菌门(phylum.Tenericutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、柔膜菌纲(class.Mollicutes)(OR=1.0221,95%CI:1.0012~1.0434,P=0.0379)、脱硫弧菌属(genus.Desulfovibrio)(OR=1.0314,95%CI:1.0039~1.0596,P=0.0247)和未命名属(genus.unknowngenus)(OR=1.0345,95%CI:1.0144~1.0550,P=0.0007)菌群丰度升高可能会增加耳鸣发病的风险。工具变量未发现水平多效性及异质性。结论:梭菌纲、瘤胃球菌属和梭菌目可能是耳鸣的潜在保护菌群,柔壁菌门、柔膜菌纲、脱硫弧菌属和未命名属可能是耳鸣的潜在危害因素。 展开更多
关键词 耳鸣 肠道菌群 孟德尔随机化 因果推断
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主观性耳鸣患者外周血非编码RNA高通量测序初析
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作者 周靖诗 梁茵菲 +4 位作者 方必兴 刘子锋 王心怡 曾祥丽 黎志成 《广西医科大学学报》 CAS 2024年第10期1384-1389,共6页
目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circ... 目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和mRNA,并通过公共数据库匹配ncRNA-miRNA-mRNA的调控路径。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对另外10例耳鸣组和10例健康对照组外周血样本进行检测,以验证筛选出的ncRNA和mRNA的差异表达是否具有普遍性。结果:在耳鸣组外周血中发现了13个lncRNA、596个circRNA和38个mRNA存在显著差异表达。13个差异表达的lncRNA均未能匹配到相应的miRNA,未行后续的mRNA匹配分析。596个差异表达的circRNA成功匹配到58个miRNA和595个mRNA,其中有1个mRNA(TOMM7)显示出差异表达,其对应的circRNA和miRNA分别为circ_0051120和miR-615。qPCR结果显示,circ_0051120的表达量在两组间存在显著差异(P<0.05),而TOMM7表达无统计学差异(P>0.05)。结论:circ_0051120可能通过调节TOMM7的表达水平,进而影响线粒体自噬过程,并过度激活NF-κB信号通路以及影响神经网络稳定性,从而在主观性耳鸣的发生和维持过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 非编码RNA 主观性耳鸣 高通量测序 TOMM7
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