男女泌尿生殖道微生物菌群结构分析

目的探讨男女泌尿生殖道中菌群结构差异,为临床男女泌尿生殖系统疾病研究提供可靠的病原学依据。方法运用高通量二代测序技术检测30名健康正常成年男性泌尿生殖道分泌物、29名无性生活史女性阴道分泌物和20名妊娠妇女阴道分泌物中微生物,使用生物信息学软件对三组标本进行OTU丰度分析、UPGMA聚类分析、Heatmap聚类分析、Alpha多样性分析和样品组间显著性差异分析。结果 16S r RNA基因OTU共注释出36个门、23个纲、36个目、73个科、108个属和61个物种,ITS序列OTU共注释出4个门、12个纲、23个目、28个科、43个属和52个物种。Alpha多样性分析Sobs指数、Chao指数、Ace指数、Shannon指数、Simpson指数和Coverage指数显示,各组间物种多样性差异有统计学意义(P<0.05)。男性尿道分泌物与女性阴道分泌物菌群结构存在显著性差异,无性生活史女性和妊娠妇女阴道分泌物菌群结构部分相似,男性尿道分泌物与无性生活史女性阴道分泌物之间菌群组成及丰度相似的前5名物种分别为乳杆菌属、链球菌属、棒状杆菌属、葡萄球菌属和普雷沃菌属。三组之间菌群结构整体上差异显著,但仍有40种菌完全相同,均以乳杆菌属为优势菌,其次是链球菌属、假单胞菌属、加德纳菌属、芽孢杆菌属、葡萄球菌属、棒状杆菌属、普雷沃菌属、苍白杆菌属、拟杆菌属和不动杆菌属。结论乳杆菌属菌群结构改变可能会引起男女泌尿生殖系统疾病;妊娠可能改变菌群结构,性生活可能在调节男女泌尿生殖道菌群结构方面起到重要作用。

高通量二代测序技术在泌尿生殖道无乳链球菌筛查中的应用

目的探讨高通量二代测序技术(NGS)在泌尿生殖道无乳链球菌(GBS)筛查中的应用价值。方法运用高通量二代测序技术检测58份男性尿道分泌物、30份处女和20份孕妇阴道分泌物中的微生物,同时进行GBS荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)和传统细菌培养鉴定。结果GBS在NGS中的检出率为18.5%(20/108),在FQ-PCR中的检出率为20.4%(22/108),在传统细菌培养鉴定中检出率为4.6%(5/108)。NGS与FQ-PCR两种分子生物学方法在男性尿道分泌物、处女和孕妇阴道分泌物GBS筛查鉴定中符合率为100%、30%和0%。男性尿道分泌物中的菌群数量最多,孕妇阴道分泌物中的菌群数量最少。男女泌尿生殖道均有瑞士乳酸杆菌、惰性乳酸杆菌、copri普雷沃菌、无乳链球菌、婴儿链球菌等相同菌群存在。结论高通量二代测序技术具有高通量、高准确度和高灵敏度的特点,适合微生物菌群及物种的筛选,男、女泌尿生殖道均有无乳链球菌定植,且菌群结构部分相同。