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EGLN3在肺腺癌中表达的Meta分析
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作者 杨硕 马洪明 +1 位作者 关晓婷 陈正贤 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2023年第1期31-38,共8页
目的 分析EGLN3在肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)中的作用。方法 (1)通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库下载535例肺腺癌样本和59例正常样本,分析EGLN3在肺腺癌和正常肺组织中的表达差异;(2)使用R语言分析EG... 目的 分析EGLN3在肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)中的作用。方法 (1)通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库下载535例肺腺癌样本和59例正常样本,分析EGLN3在肺腺癌和正常肺组织中的表达差异;(2)使用R语言分析EGLN3的表达水平及其在肺腺癌中的临床意义;(3)通过Kaplan-Meier方法、单因素和多因素COX回归分析和生存预测列线图确定EGLN3的表达水平与肺腺癌预后的关系;(4)通过基因集富集分析(GSEA)筛选EGLN3相关的生物学途径;(5)细胞实验:通过蛋白质印迹法(WB)验证EGLN3在肺腺癌细胞中是否存在差异表达;对EGLN3基因进行过表达和干扰表达,采用CCK-8增殖实验、划痕实验和Transwell侵袭实验,明确表达水平对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。结果 (1)EGLN3在肺腺癌组织中表达水平高于正常肺组织细胞;(2)EGLN3表达水平与肺腺癌病理分期相关,病理分期越高,对应EGLN3表达水平越高;(3)EGLN3表达水平与肺腺癌总生存期(OS)独立预后相关,EGLN3高表达肺腺癌较EGLN3低表达肺腺癌OS、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔(PFI)差;(4)基因集富集分析预测EGLN3可能参与的信号通路包括激活MYC基因、上皮细胞-间充质转化(EMT)、DNA复制、细胞周期、mTORC1通路、G2/M检查点、E2F转录过程、P53信号通路等;(5)细胞实验:EGLN3在肺腺癌细胞中表达水平高于人支气管上皮样细胞;CCK-8增殖实验、划痕实验和Transwell侵袭实验显示,EGLN3过表达促进肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移,EGLN3干扰表达抑制肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移。结论 EGLN3在肺腺癌细胞中存在高表达,提示肺腺癌预后不良,可作为肺腺癌预后的预测因素。EGLN3表达可促进肺腺癌细胞增殖、侵袭和迁移。 展开更多
关键词 EGLN3 肺腺癌 生物信息学 META分析
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