耐热阿拉伯糖苷酶三维结构模拟和底物对接分析

阿拉伯糖苷酶能催化L-阿拉伯糖和木糖间糖苷键的水解,在半纤维素降解及阿拉伯糖制备过程中有重要作用。源自乙醇热厌氧杆菌Thermoanaerobacter ethanolicus的阿拉伯糖苷酶具有阿拉伯糖苷酶和木糖苷酶的双重活性,且具有高度的热稳定性。为深入研究该酶的催化机理,预测了该酶的空间结构和活性中心关键残基,以便指导进一步的实验研究;使用同源模建的方法,以Thermotoga neapolitanaβ-糖苷酶3b的结构为模版,模建了T.ethanolicus阿拉伯糖苷酶的结构,并使用分子对接的方法,将底物对硝基苯基-L-阿拉伯糖苷(pNPAP)和对硝基苯基-D-木糖苷(pNPX)对接到酶的活性中心;预测的底物-酶复合物结构表明酶活性中心Asn90、Arg164、Lys201、Asp281等残基在底物结合和水解过程中可能发挥有重要的作用。