宫颈癌差异表达基因的生物信息学分析及验证

目的筛选获取宫颈癌与癌旁正常组织之间差异表达的关键基因,分析其在宫颈癌发病中的可能作用。方法从公共基因芯片数据库(GEO)中筛选并下载三组宫颈癌及其癌旁组织基因表达谱芯片数据,运用R软件的Limma、affymetrix以及heatmap等程序包对获取的芯片数据进行分析,获取差异表达显著的基因;随后使用DAVID网站的在线分析工具对差异表达的基因进行功能分析,以获取各基因的功能及其可能参与的信号通路。同时为进一步了解各差异表达基因之间的关联性,使用了String10.0数据库进行蛋白互作(PPI)的分析,应用Cytoscape软件建立PPI模块,进而筛选得到关键基因;最后运用qPCR方法在组织水平验证关键基因的表达情况。结果(1)与癌旁组织相比,共有142个基因在宫颈癌组织中表达有差异,其中表达具有显著差异的为31个,包括24个上调基因和7个下调基因。(2)GO富集结果显示,差异表达基因分别在42条生物过程、15条细胞组成、8条分子功能和6条KEGG通路中富集。宫颈癌中表达上调的基因不仅在细胞生长相关的信号通路如细胞周期、DNA复制、卵母细胞减数分裂等中发挥作用,还在细胞生物学过程相关的信号通路如蛋白质结合、ATP结合、p53信号通路等中发挥作用。(3)基于String数据库型筛选出RRM2、MCM2、ASPM、MCM4和CCNB1等5个degree得分较高的关键基因,Cytoscape软件MCODE插件共筛选出显著模块1个,涉及基因主要富集在DNA复制、细胞周期等信号通路。(4)q PCR结果显示,ASPM在宫颈癌组织中表达高于癌旁组织,与上述分析结果一致。结论宫颈癌发生、发展可能与关键基因RRM2、MCM2、ASPM、MCM4和CCNB1有关。这些基因主要通过参与DNA复制、细胞周期、p53信号通路等在宫颈癌相关的生物过程中发挥作用。

73例HIV/AIDS抗逆转录病毒治疗患者PBMCs中miR-221和miR-29及miR-155水平变化

目的 规律服药人获得性免疫缺陷病毒/艾滋病(HIV/AIDS)患者外周血单个核淋巴细胞(PBMCs)中微小核糖核酸-221(miR-221)、miR-29、miR-155水平与抗逆转录病毒治疗(HAART)疗效的关系。方法 选择杭州市临平区第一人民医院感染科2019年1月-2021年1月接受HAART治疗的HIV/AIDS患者73例为研究组,选择同期体检健康人73名为对照组。对照组于体检当天,研究组HIV/AIDS患者于开始HAART治疗前、HAART治疗3个月、6个月和12个月复查时抽取外周静脉血3份,一份使用荧光定量扩增系统检测外周血RNA中HIV-1病毒载量,另一份采用流式细胞术外周血中CD_(4)^(+)T淋巴细胞细胞计数,第三份采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)检测PBMCs中miR-221、miR-29、miR-155含量。结果 研究组PBMCs中miR-221、miR-29、miR-155高于对照组(P<0.05);研究组不同时间点miR-221、miR-29、miR-155及CD_(4)^(+)T细胞计数和HIV病毒载量差异具有统计学意义(P<0.05),随着治疗时间的延长miR-221、miR-29、miR-155、HIV病毒载量逐渐下降,CD_(4)^(+)T细胞计数逐渐上升(P<0.05);治疗失败组患者PBMCs中miR-221、miR-29、miR-155和HIV病毒载量高于非治疗失败组,CD_(4)^(+)T细胞计数低于非治疗失败组(P<0.05);miR-221、miR-29、miR-155及HIV病毒载量两指标间均成正相关,miR-221、miR-29、miR-155及HIV病毒载量与CD_(4)^(+)T细胞计数均成负相关。结论 miR-221、miR-29、miR-155在一定程度上可反映HAART临床疗效,在临床中可辅助应用。

血清铁蛋白25-羟维生素D及白细胞介素-17水平与儿童非酒精性脂肪肝病发生的相关性及诊断价值

目的 探讨血清铁蛋白(SF)、白细胞介素-17(IL-17)、25-羟维生素D[25-(OH)D]与儿童非酒精性脂肪肝病(NAFLD)发生的相关性以及联合检测以上因子对疾病的诊断价值。方法 选择2018年6月—2020年9月杭州市临平区第一人民医院确诊NAFLD的患儿106例,按照疾病严重程度分为一般NAFLD组57例与严重NAFLD组49例,另选取体检的健康儿童35例作为健康对照组,比较3组儿童血清SF、25-(OH)D及IL-17水平;采用Spearman相关系数分析SF、25-(OH)D、IL-17与NAFLD发生的相关性;绘制受试者工作特征曲线(ROC)比较以上因子联合诊断与单一诊断对NAFLD的诊断价值。结果 与健康对照组比较,一般NAFLD组与严重NAFLD组中SF、25-(OH)D与IL-17水平均显著升高(t=4.624、5.242、4.895,均P<0.05);Spearman相关系数显示25-(OH)D与NAFLD的发生呈负相关,SF与IL-17与疾病发生呈正相关(r=0.712、-0.743、0.740,均P<0.001);ROC曲线显示联合诊断特异度为91.2%,灵敏度为91.6%,且曲线下面积远高于单一诊断(P<0.05)。结论 NAFLD患儿血清中SF、25-(OH)D和IL-17水平均显著高于健康儿童,且疾病程度越严重SF及IL-17水平越高,25-(OH)D水平越低,提早检测儿童血清中SF、IL-17及25-(OH)D水平有利于尽早发现NAFLD并采取治疗措施,具有临床推广价值。

人体刚地弓形虫感染对血脂水平的影响

目的分析人体刚地弓形虫感染对血脂水平的影响。方法以2017年1月至2019年12月某三级医院1000例体检健康者作为研究对象,根据酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)是否检出血清抗弓形虫抗体分为感染组和对照组,检测并比较两组研究对象血清总胆固醇(total cholesterol,TC)、高密度脂蛋白(high-density lipoprotein,HDL)、低密度脂蛋白(low-density lipoprotein,LDL)和甘油三酯(triglyceride,TG)水平。结果1000例研究对象血清抗弓形虫抗体阳性率为8.40%,感染组和对照组研究对象性别(χ^(2)=1.29,P>0.05)和年龄构成(χ^(2)=1.41,P>0.05)差异均无统计学意义。感染组研究对象血清LDL和TC均值显著高于对照组(t=3.89、3.81,P均<0.05),但两组研究对象血清TG和HDL差异均无统计学意义(t=0.97、0.75,P均>0.05);感染组研究对象LDL和TC值不正常比例均显著高于对照组(χ^(2)=9.69、10.39,P均<0.01),但两组研究对象TG和HDL值不正常比例差异均无统计学意义(χ^(2)=0.02、0.11,P均>0.05)。结论人体刚地弓形虫感染影响血脂水平变化,血清抗弓形虫抗体阳性者平均LDL和TC值及TC和LDL值不正常比例均显著高于抗体阴性者。

多潘立酮联合枸橼酸莫沙必利片治疗HP感染的功能性消化不良围绝经期女性的效果及对胃肠动力的影响

目的研究联合使用多潘立酮与枸橼酸莫沙必利片治疗幽门螺杆菌(HP)感染的功能性消化不良围绝经期女性对胃肠动力的影响。方法选取杭州市临平区第一人民医院在2021年12月—2022年12月收治的HP感染的围绝经期女性患者86例随机分为研究组43例,多潘立酮组43例。多潘立酮组单用多潘立酮治疗,研究组实施多潘立酮联合枸橼酸莫沙必利片治疗,对比两组患者体内的HP、GAS、MTL、胃酸分泌量、胃液胆酸含量、胃肠动力水平、各项FSSG评分、DeMeester评分及生活质量评分。结果研究组治疗总有效率88.37%明显高于多潘立酮组总有效率69.77%,差异有统计学意义(P<0.05)。研究组患者治疗后HP阳性率为11.63%显著低于多潘立酮组的32.56%,差异有统计学意义(P<0.05)。研究组血清GAS为(61.68±18.22)ng/L明显高于多潘立酮组(54.66±18.11)ng/L,差异有统计学意义(P<0.05);研究组MTL为(162.32±40.12)ng/L明显高于多潘立酮组(129.34±33.54)ng/L,胃酸分泌量(1.22±0.31)mmol/L明显低于多潘立酮组(2.98±0.54)mmol/L,胃液胆酸含量(85.32±51.62)mg/ml明显低于多潘立酮组(146.13±87.14)mg/ml,差异均有统计学意义(P<0.05)。研究组患者的胃排空率(67.68±6.22)%、小肠推进率(79.32±6.12)%均高于多潘立酮组胃排空率(60.66±5.11)%、小肠推进率(74.34±5.54),差异有统计学意义(P<0.05)。多潘立酮组治疗后的各项FSSG评分(FSSG-RS值为8.48±1.11,FSSG-DS值为11.34±2.24)和DeMeester评分(9.76±2.23)均明显高于研究组(FSSG-RS:7.14±0.84,FSSG-DS:9.12±1.01,DeMeester:8.54±1.56),差异有统计学意义(P<0.05)。研究组的生活质量优于多潘立酮组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论多潘立酮联合枸橼酸莫沙必利片有效调节围绝经期女性患者的GAS、MTL、HP水平表达情况,降低胃酸分泌量及胃液胆酸含量,提高患者的胃肠动力指标,有效改善患者因HP感染的功能性消化不良。

血清可溶性髓样细胞触发受体-1和CXC趋化因子16对支原体肺炎患儿的诊断效能及预后评估价值研究

目的 探讨可溶性髓样细胞触发受体-1(sTREM-1)、CXC趋化因子16(CXCL-16)对支原体肺炎(MPP)患儿的诊断效能及预后评估价值。方法 选取2022年7月—2023年7月杭州市临平区第一人民医院收治的150例MPP患儿为MPP组,100例健康体检儿童为健康对照组。比较两组CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA水平,并绘制受试者工作特性曲线(ROC),评估各指标对MPP的诊断效能。根据MPP患儿病情程度分为轻症组和重症组,比较轻症MPP和重症MPP患儿的CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA水平。采用Spearman检验分析CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA与预后的相关性,并绘制ROC曲线分析各指标对MPP患儿预后的评估价值。结果 MPP组患儿CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA的表达水平均显著高于健康对照组,且重症MPP患儿各指标均高于轻症MPP患儿,差异均有统计学意义(均P<0.05)。ROC曲线分析显示,CXCL-16(AUC=0.822,95%CI:0.757~0.877)、sTREM-1(AUC=0.900,95%CI:0.845~0.954)、CXCL-16 mRNA(AUC=0.939,95%CI:0.899~0.978)对MPP患儿均具有显著的诊断价值(AUC>0.7,P<0.001)。不同预后MPP患儿CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA比较,差异有统计学意义(P<0.05);Spearman检验分析显示,CXCL-16(r=0.497)、sTREM-1(r=0.703)及CXCL-16 mRNA(r=0.845)与MPP患儿预后呈正相关性(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,CXCL-16(AUC=0.707,95%CI:0.628~0.786)、sTREM-1(AUC=0.794,95%CI:0.722~0.866)、CXCL-16 mRNA(AUC=0.842,95%CI:0.779~0.906)对MPP患儿预后均具有显著的评估价值(AUC>0.7,P<0.001)。结论 CXCL-16、sTREM-1及CXCL-16 mRNA对MPP具有显著的诊断价值,而且可作为病情及预后评估的有效参考指标。

三叶青提取物TH-w3对金黄色葡萄球菌生物膜的抑制和清除作用

目的探讨三叶青提取物TH-w3对金黄色葡萄球菌生物膜形成的抑制和清除作用。方法TH-w3是用80%的乙醇提取后的三叶青干燥块根水煮后减压回收蒸干产品;实验菌株为本实验室临床分离培养并保存的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)各30株;菌落计数法绘制金黄色葡萄球菌生物膜形成曲线;二倍稀释法肉眼观察+酶标仪比浊法测定最小抑菌浓度(MIC);结晶紫法检测TH-w3对金黄色葡萄球菌生物膜的抑制及清除作用。结果对各30株MRSA和MSSA的成膜能力进行比较,MRSA菌株成膜阳性22株(73.3%),MSSA成膜阳性菌株3株(10.0%),成膜阳性率MRSA菌株与MSSA菌株比较差异有统计学意义(χ^(2)=43.35,P<0.01);TH-w3对“MRSA(+)组”和“MSSA(+)组”菌株的MIC均为8.00μg/ml;TH-w3对“MRSA(+)组”和“MSSA(+)组”菌株生物膜的抑制和清除作用均具有浓度依赖性,在1个MIC浓度下抑制率和清除率最高,可达68%以上。相同MIC的TH-w3对金黄色葡萄球菌生物膜的抑制和清除作用随培养时间延长明显升高,至48 h后提升渐缓。在1/4 MIC浓度下,诱导24 h后MSSA(+)的抑制率高于MRSA(+)(P<0.05)。在1/4和1/2 MIC浓度下,诱导24 h后MSSA(+)的清除率高于MRSA(+)(P<0.01)。结论三叶青提取物TH-w3对金黄色葡萄球菌生物膜有明显抑制和清除作用,具有临床转化价值。