金铁锁转录因子ptMYC2的克隆和生物信息学分析

金铁锁是“云南白药”等多种中成药的重要组成,其有效成分为三萜皂苷, MYC 类转录因子在调节植物三萜类次生代谢积累中有重要作用。为研究 ptMYC2 基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调控机制,该研究基于金铁锁转录组测序数据,克隆得到 ptMYC2 转录因子的两个全长基因;通过生物信息学软件对两条转录因子的同源性、理化性质、疏水性、跨膜结构、亚细胞定位、结构域、靶基因结合位点等进行初步预测分析。结果表明:两条转录因子所编码的蛋白属于亲水性蛋白,不存在跨膜区域,均是非分泌蛋白质,且不存在信号肽;两条转录因子的亚细胞定位于细胞核;结构域分析显示,两个基因都含有bHLH家族结构域;预测得到金铁锁三萜皂苷合成途径中 HMGR 、 FPS、SE、β-AS 等基因的启动子可能存在与 MYC2 结合的 E-box 特异性结合位点。该研究结果将为进一步研究 ptMYC2 基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调节机制奠定基础。