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云南花椒黄花病相关病原分析
1
作者
余烯宇
吴阔
+6 位作者
张丽珍
郝佳波
呼延丽
杜春花
陆斌
陈永对
董家红
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第11期2410-2418,共9页
【目的】花椒黄花病(flower yellowing disease,FYD)是近年来花椒重要病害之一,可导致感病花椒减产,本研究应用高通量测序技术分析花椒黄花病潜在病原,为该病害病原种类鉴定、病害防治提供理论依据。【方法】取竹叶花椒永青1号的黄花病...
【目的】花椒黄花病(flower yellowing disease,FYD)是近年来花椒重要病害之一,可导致感病花椒减产,本研究应用高通量测序技术分析花椒黄花病潜在病原,为该病害病原种类鉴定、病害防治提供理论依据。【方法】取竹叶花椒永青1号的黄花病植株4份和无症植株2份的花、叶样品进行病毒组测序分析。【结果】测序数据分析发现,6个样品共有484个contigs与病毒序列相似,分别匹配到12个病毒科的15种病毒。6个样品均检测出在九叶青花椒上已报道的4种病毒:四川青花椒线虫多面体病毒(GSP⁃NeV)、四川青花椒悬钩子病毒(GSPIV)、四川青花椒耳突花叶病毒(GSPEV)、四川花椒弹状病毒(GSPNuV)。发现花椒中未报道的2种新病毒,分别命名为永青花椒相关幽影病毒(Yongqing green pepper⁃associated umbravirus)与永青花椒相关负链RNA病毒(Yongqing green pepper⁃associated ssRNA negative⁃strand virus);此外,在感病D⁃2和无症H⁃1样品中发现马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)。从感病样品D⁃2、D⁃3、D⁃4发现乙型线形病毒科(Betaflexiviridae)香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)马铃薯M病毒(Potato virus M,PVM)、马铃薯H病毒(Potato virus H,PVH)和马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS),在D⁃1花椒发现葡萄茎痘相关病毒(Gra⁃pevine rupestris stem pitting⁃associated virus,GRSPAV)。【结论】从永青1号花椒测序样品中均发现已报道的4种病毒以及未报道的2种新病毒,并检测出仅存在于感病组的香石竹潜隐病毒属,推测高表达的香石竹潜隐病毒属病毒或可视为诱发花椒黄花病的因素之一。
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关键词
转录组测序
花椒黄花病
病毒分析
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职称材料
题名
云南花椒黄花病相关病原分析
1
作者
余烯宇
吴阔
张丽珍
郝佳波
呼延丽
杜春花
陆斌
陈永对
董家红
机构
云南中医药大学中药学院/中药材栽培研究所/云南省南药可持续利用重点实验室
云南省
农业科
学院
生物技术与种质资源
研究所
云南省
林业和草原科
学院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第11期2410-2418,共9页
基金
云南省科技计划项目(202102AE090013)
云南中医药大学高层次人才科研项目(2019YZG09)。
文摘
【目的】花椒黄花病(flower yellowing disease,FYD)是近年来花椒重要病害之一,可导致感病花椒减产,本研究应用高通量测序技术分析花椒黄花病潜在病原,为该病害病原种类鉴定、病害防治提供理论依据。【方法】取竹叶花椒永青1号的黄花病植株4份和无症植株2份的花、叶样品进行病毒组测序分析。【结果】测序数据分析发现,6个样品共有484个contigs与病毒序列相似,分别匹配到12个病毒科的15种病毒。6个样品均检测出在九叶青花椒上已报道的4种病毒:四川青花椒线虫多面体病毒(GSP⁃NeV)、四川青花椒悬钩子病毒(GSPIV)、四川青花椒耳突花叶病毒(GSPEV)、四川花椒弹状病毒(GSPNuV)。发现花椒中未报道的2种新病毒,分别命名为永青花椒相关幽影病毒(Yongqing green pepper⁃associated umbravirus)与永青花椒相关负链RNA病毒(Yongqing green pepper⁃associated ssRNA negative⁃strand virus);此外,在感病D⁃2和无症H⁃1样品中发现马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)。从感病样品D⁃2、D⁃3、D⁃4发现乙型线形病毒科(Betaflexiviridae)香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)马铃薯M病毒(Potato virus M,PVM)、马铃薯H病毒(Potato virus H,PVH)和马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS),在D⁃1花椒发现葡萄茎痘相关病毒(Gra⁃pevine rupestris stem pitting⁃associated virus,GRSPAV)。【结论】从永青1号花椒测序样品中均发现已报道的4种病毒以及未报道的2种新病毒,并检测出仅存在于感病组的香石竹潜隐病毒属,推测高表达的香石竹潜隐病毒属病毒或可视为诱发花椒黄花病的因素之一。
关键词
转录组测序
花椒黄花病
病毒分析
Keywords
Transcriptome sequencing
Flower yellowing disease of Zanthoxylum armatum
Pathogen analysis
分类号
S435.73 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
云南花椒黄花病相关病原分析
余烯宇
吴阔
张丽珍
郝佳波
呼延丽
杜春花
陆斌
陈永对
董家红
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
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