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网络药理学、分子动力学和实验验证探究秦艽环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎关键成分和作用机制
1
作者
孙建国
李慧娟
+6 位作者
宝文萍
卿越雷
蒋玲雪
刘德敏
李东云
潘正
魏丹霞
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第17期5853-5866,共14页
目的通过网络药理学、分子对接及实验验证探究秦艽Gentiana straminea中环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的主要成分和作用机制。方法通过文献报道和TCMSP数据收集并通过SwissADME数据库筛选环烯醚萜苷类成分,Pharm...
目的通过网络药理学、分子对接及实验验证探究秦艽Gentiana straminea中环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的主要成分和作用机制。方法通过文献报道和TCMSP数据收集并通过SwissADME数据库筛选环烯醚萜苷类成分,Pharmmaper数据库预测药物靶点;通过OMIM、GeneCards和TTD等数据库收集RA相关靶点,并通过Venn分析筛选出环烯醚萜苷抗RA的潜在作用靶点,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选环烯醚萜苷抗RA的核心靶点,通过基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析预测环烯醚萜苷抗RA的作用机制。以核心靶点为受体进行分子对接和分子动力学模拟筛选出环烯醚萜苷的关键成分,通过人风湿关节炎成纤维滑膜细胞(human fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis,HFLS-RA)进行体外实验验证。结果共收集获得18个具有类药性的环烯醚萜苷类成分、300个药物相关靶点和1641个RA相关靶点;Venn分析筛选出103个环烯醚萜苷抗RA的潜在作用靶点;PPI网络分析发现原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase-1,MAPK1)、非受体酪氨酸激酶淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(non-receptor tyrosine kinase lymphocyte cell-specific protein-tyrosine kinase,LCK)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)和Ras同源基因家族成员A(Ras homolog gene family member A,RhoA)等可能是环烯醚萜苷抗RA的核心靶点;GO和KEGG富集分析结果显示磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)通路与环烯醚萜苷抗RA密切相关,环烯醚萜苷还参与调控中性粒细胞活化和脱颗粒等多种生物过程,进而调控机体免疫反应发挥抗RA的作用。分子对接确定了SRC为其中最核心的靶点,龙胆苦苷可能是环烯醚萜苷中的关键成分;分子动力学模拟显示龙胆苦苷与SRC靶点结合紧密,表明其具有通过靶向作用SRC对RA起治疗作用的可能性。体外实验结果证实龙胆苦苷可显著抑制HFLS-RA增殖(P<0.01、0.001),降低上清液中炎症因子水平(P<0.001),抑制PI3K/Akt和核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路的激活(P<0.05、0.01、0.001)。结论环烯醚萜苷是秦艽发挥药理作用的主要成分,其中龙胆苦苷为环烯醚萜苷抗RA的关键成分,可以通过抑制HFLS-RA增殖,降低炎症反应,调控PI3K/Akt和NF-κB信号通路进而发挥抗RA作用。
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关键词
秦艽
环烯醚萜苷
类风湿关节炎
网络药理学
分子对接
PI3K/Akt信号通路
NF-κB信号通路
人风湿关节炎成纤维滑膜细胞
龙胆苦苷
原文传递
题名
网络药理学、分子动力学和实验验证探究秦艽环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎关键成分和作用机制
1
作者
孙建国
李慧娟
宝文萍
卿越雷
蒋玲雪
刘德敏
李东云
潘正
魏丹霞
机构
云南中医药大学第三附属医院风湿病科
云南
中医药大学
中药学院
重庆医
科
大学
中医药
学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第17期5853-5866,共14页
基金
国家自然科学基金资助项目(81973567)
云南省万人计划基金资助项目(YNWR/MY/2020/083)
昆明市名中医专家传承工作室基金资助项目(MYGZS/2022/315)。
文摘
目的通过网络药理学、分子对接及实验验证探究秦艽Gentiana straminea中环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的主要成分和作用机制。方法通过文献报道和TCMSP数据收集并通过SwissADME数据库筛选环烯醚萜苷类成分,Pharmmaper数据库预测药物靶点;通过OMIM、GeneCards和TTD等数据库收集RA相关靶点,并通过Venn分析筛选出环烯醚萜苷抗RA的潜在作用靶点,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选环烯醚萜苷抗RA的核心靶点,通过基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析预测环烯醚萜苷抗RA的作用机制。以核心靶点为受体进行分子对接和分子动力学模拟筛选出环烯醚萜苷的关键成分,通过人风湿关节炎成纤维滑膜细胞(human fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis,HFLS-RA)进行体外实验验证。结果共收集获得18个具有类药性的环烯醚萜苷类成分、300个药物相关靶点和1641个RA相关靶点;Venn分析筛选出103个环烯醚萜苷抗RA的潜在作用靶点;PPI网络分析发现原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase-1,MAPK1)、非受体酪氨酸激酶淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(non-receptor tyrosine kinase lymphocyte cell-specific protein-tyrosine kinase,LCK)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)和Ras同源基因家族成员A(Ras homolog gene family member A,RhoA)等可能是环烯醚萜苷抗RA的核心靶点;GO和KEGG富集分析结果显示磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)通路与环烯醚萜苷抗RA密切相关,环烯醚萜苷还参与调控中性粒细胞活化和脱颗粒等多种生物过程,进而调控机体免疫反应发挥抗RA的作用。分子对接确定了SRC为其中最核心的靶点,龙胆苦苷可能是环烯醚萜苷中的关键成分;分子动力学模拟显示龙胆苦苷与SRC靶点结合紧密,表明其具有通过靶向作用SRC对RA起治疗作用的可能性。体外实验结果证实龙胆苦苷可显著抑制HFLS-RA增殖(P<0.01、0.001),降低上清液中炎症因子水平(P<0.001),抑制PI3K/Akt和核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路的激活(P<0.05、0.01、0.001)。结论环烯醚萜苷是秦艽发挥药理作用的主要成分,其中龙胆苦苷为环烯醚萜苷抗RA的关键成分,可以通过抑制HFLS-RA增殖,降低炎症反应,调控PI3K/Akt和NF-κB信号通路进而发挥抗RA作用。
关键词
秦艽
环烯醚萜苷
类风湿关节炎
网络药理学
分子对接
PI3K/Akt信号通路
NF-κB信号通路
人风湿关节炎成纤维滑膜细胞
龙胆苦苷
Keywords
Gentiana straminea Maxim.
iridoid glycosides
rheumatoid arthritis
network pharmacology
molecular docking
PI3K/Akt signaling pathway
NF-κB signaling pathway
human fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis
gentianoside
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
网络药理学、分子动力学和实验验证探究秦艽环烯醚萜苷抗类风湿性关节炎关键成分和作用机制
孙建国
李慧娟
宝文萍
卿越雷
蒋玲雪
刘德敏
李东云
潘正
魏丹霞
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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已选择
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