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马铃薯A病毒在云南省的发生及其P3蛋白序列分析
被引量:
2
1
作者
杜霞
吴阔
+6 位作者
苏晓霞
张丽珍
刘霞
高玉林
张仲凯
杨艳丽
董家红
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期516-523,共8页
【目的】了解马铃薯A病毒在云南省的发生分布情况,明确云南省分离物变异情况。【方法】用DAS-ELSIA的方法,检测云南省19个种植马铃薯县(市)的389个样品;对5个地区的阳性样品用RT-PCR扩增马铃薯A病毒P3蛋白基因,克隆测序,使用DNAMAN及DNA...
【目的】了解马铃薯A病毒在云南省的发生分布情况,明确云南省分离物变异情况。【方法】用DAS-ELSIA的方法,检测云南省19个种植马铃薯县(市)的389个样品;对5个地区的阳性样品用RT-PCR扩增马铃薯A病毒P3蛋白基因,克隆测序,使用DNAMAN及DNAStar等软件分析序列,采用MEGA 6.0邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统进化树。【结果】DAS-ELISA检测389个样品,PVA的检出率为20.82%。用P3蛋白基因特异性引物从云南5个不同地区的PVA阳性样品中扩增得到1041bp的目的片段;比较分析了云南省5个地区马铃薯A病毒分离物之间,及与国内外13个分离物的P3蛋白和PIPO蛋白同源性,发现云南省5个地区PVA分离物之间P3蛋白和PIPO蛋白氨基酸序列同源性分别为98.8%~99.7%和97.6%~100.0%;与国内外13个分离物P3蛋白和PIPO蛋白的氨基酸序列同源性分别为90.8%~99.1%和90.5%~100.0%。系统进化树显示,云南省5个分离物与湖南省分离物(KF977085)亲缘关系最近;PVA马铃薯分离物和新西兰树番茄分离物之间亲缘关系较远。【结论】PVA在云南省发生普遍;云南省马铃薯A病毒存在一定程度的变异;PVA存在一定的寄主适应性。
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关键词
马铃薯A病毒
云南省
马铃薯
P3
序列分析
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职称材料
题名
马铃薯A病毒在云南省的发生及其P3蛋白序列分析
被引量:
2
1
作者
杜霞
吴阔
苏晓霞
张丽珍
刘霞
高玉林
张仲凯
杨艳丽
董家红
机构
云南农业大学云南省植物病理重点实验室/云南农业大学植物保护学院
云南省
农业
科
学院
生物技术与种质资源研究所/
云南省
农业
生物技术
重点
实验室
/
农业
农村部西南作物基因资源与种质创制
重点
实验室
中国
农业
科
学院
植物保护
研究所
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期516-523,共8页
基金
云南省现代农业马铃薯产业技术体系建设(2018KJTX003)
国家重点研发计划子课题(2018YFD0200808)。
文摘
【目的】了解马铃薯A病毒在云南省的发生分布情况,明确云南省分离物变异情况。【方法】用DAS-ELSIA的方法,检测云南省19个种植马铃薯县(市)的389个样品;对5个地区的阳性样品用RT-PCR扩增马铃薯A病毒P3蛋白基因,克隆测序,使用DNAMAN及DNAStar等软件分析序列,采用MEGA 6.0邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统进化树。【结果】DAS-ELISA检测389个样品,PVA的检出率为20.82%。用P3蛋白基因特异性引物从云南5个不同地区的PVA阳性样品中扩增得到1041bp的目的片段;比较分析了云南省5个地区马铃薯A病毒分离物之间,及与国内外13个分离物的P3蛋白和PIPO蛋白同源性,发现云南省5个地区PVA分离物之间P3蛋白和PIPO蛋白氨基酸序列同源性分别为98.8%~99.7%和97.6%~100.0%;与国内外13个分离物P3蛋白和PIPO蛋白的氨基酸序列同源性分别为90.8%~99.1%和90.5%~100.0%。系统进化树显示,云南省5个分离物与湖南省分离物(KF977085)亲缘关系最近;PVA马铃薯分离物和新西兰树番茄分离物之间亲缘关系较远。【结论】PVA在云南省发生普遍;云南省马铃薯A病毒存在一定程度的变异;PVA存在一定的寄主适应性。
关键词
马铃薯A病毒
云南省
马铃薯
P3
序列分析
Keywords
Potato virus A
Yunnan
Potato
P3
Sequence analysis
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯A病毒在云南省的发生及其P3蛋白序列分析
杜霞
吴阔
苏晓霞
张丽珍
刘霞
高玉林
张仲凯
杨艳丽
董家红
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020
2
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