宏基因组学在未培养微生物研究中的应用

自然环境中约99%的微生物不能用传统的分离培养方法获得其纯培养。随着宏基因组技术的出现,人们可以对这一庞大的未知世界进行多方面的研究,包括微生物的生理、生态及其基因功能等。利用这一技术,研究者已经对地球上的许多生境进行了研究,并取得了很多新的成就。简要概述这一技术在研究未培养微生物方面的应用。

RNA二级结构在微生物系统发育分析上的应用

RNA二级结构用于微生物分类和系统发育分析在近年来逐渐受到注意并发展起来。文章就此方面的发展做了简要综述,其中对在系统发育分析上的应用部分作了较重点介绍。

微生物在中药现代化中的应用

中药行业是我国最有发展前景的传统行业之一,中药现代化是其发展的必然要求。在中药研究中应用现代化科学技术成果,特别是应用生命科学的新技术、新理论是中药现代化研究的重要内容,是促进中药发展的最重要手段之一。对中药微生物的深入研究,是认识微生物相关中药的形成机制、开发珍贵中药的替代资源、对中药进行二次开发、寻找新的中药资源,甚至是研究一些中药药理的重要途径。同时,微生物学在为中药现代化作贡献的过程中,也为微生物学的发展找到其独特的发展空间,形成具有中国特色的中药微生物学研究体系。概述微生物与中药的多方面关系并提出了一些看法。可以预见,充分利用微生物学的研究成果必将为中药发展带来新的局面。

发现微生物药物的新途径:从基因到新化合物

本文介绍一种基于基因组扫描(鸟枪法)和生物信息学相结合的寻找微生物新化合物的平台。基因组扫描发现新的合成基因,通过对新的次生代谢产物合成途径基因的分析,预测化合物的结构、物理化学性质参数,指导该化合物的分离与纯化。

微生物源新药筛选中几项重要新技术

简要介绍微生物源新药发现过程中的高通量样品制备技术 。

治疗胃肠疾病的微生物源及植物源天然产物

人们使用具有生物活性的天然产物来预防和治疗各种疾病,包括胃肠疾病,已经有很长的历史。简要介绍了目前一些治疗胃肠疾病的微生物源及植物源的生物活性天然产物。

新疆青海中度嗜盐放线菌生物多样性初步研究

从我国新疆、青海等地采集数份盐碱土样或泥样 ,采用淀粉 -酪素琼脂培养基、甘油天门冬酰胺琼脂培养基、土壤浸汁琼脂培养基分别从中分离到 8株、32株中度嗜盐放线菌菌株。经形态、生理学特性与全细胞壁氨基酸组分分析结果比较 ,选取其中的 1 4株进行 1 6SrDNA序列分析。就物种多样性而言 ,新疆、青海分离到中度嗜盐放线菌分布至少有 3个科 ,5个属。其中有拟诺卡氏菌科 (Nocardiopsaceae)的拟诺卡氏菌属 (Nocardiopsis)和链单孢菌属 (Streptomonospora) ;假诺卡氏菌科 (Pseudonocardiaceae)的普氏菌属 (Prauserella)和糖单孢菌属 (Saccharomonospora) ;链霉菌科 (Streptomycetaceae)的链霉菌属 (Streptomyces)。就地区分布来讲 。

开展中药生物转化研究意义深远

综合国内外文献 ,结合笔者开展中药生物转化研究的体会 ,介绍了国内外中药生物转化的研究现状以及在中药现代化研究中的意义 ,提出了开展中药全成分转化的思路并分析了进行中药全成分转化研究的可行性及一般方法 ,并就开展中药全成分转化研究存在的问题和今后需要加强的工作等进行了讨论。认为开展中药全成分生物转化研究对充分发挥中药的潜在价值和我国的中药资源优势开发、形成具有中国特色的生物转化研究体系、开发具有自主知识产权的新药具有重要意义。

碱性环境中的放线菌的生物学研究

碱性环境中存在有一些嗜碱放线菌 (Alkalophilicactinomycetes) ,这些放线菌具有特殊的生理特征及代谢途径 ,可产生多种碱性酶及生物活性物质。综述了近 2 0年来嗜碱放线菌的分类学研究 ,嗜碱菌的嗜碱机理 ,应用方面的研究进展 。

云南腾冲热海两热泉菌藻席细菌多样性的研究

应用显微形态观察和变性梯度凝胶电泳 (DGGE)对云南腾冲热海两热泉菌藻席的细菌多样性进行了比较分析。直接从环境样品中提取总DNA ,用两套细菌通用引物进行PCR扩增 ,得到包含V8和V9高变区的 1 6SrDNA片段 ,进行DGGE分析 ,结合形态观察 ,结果显示 ,热泉菌藻席中存在丰富的细菌多样性 。

云南腾冲热海三热泉细菌多样性的研究

应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)对云南腾冲热海 3个高温热泉中菌藻席和泉底沉积物的细菌多样性进行了初步研究。直接从环境样品中提取总DNA ,用两套细菌通用引物进行PCR扩增 ,分别得到包含V8和V9高变区的 1 6SrDNA片段 ,进行DGGE分析。结果表明 :菌藻席和泉底沉积物中不仅物种组成差异较大 ,而且都存在丰富的细菌多样性 ;一些关键的生态因子 ,如氧气、温度等会对群落中微生物的物种组成有很大影响。

云南玉溪烤烟土壤真菌的初步研究

对玉溪烤烟连作田和轮作田土壤中的真菌进行分离 ,其真菌数量为 (1.35～ 4.5 6 )× 10 5/ g干土。分离得到的真菌经分类鉴定到属 ,有 4个目 ,7个科 ,45个属 ,优势属为青霉属 (Penicillium)和盾壳霉属 (Coniothyrium) ,其次为芽枝霉属 (Cladosporium)、头孢霉属 (Cephalosporium)、镰孢霉属 (Fusarium)、轮枝孢属 (Verticillium)、柱孢属 (Cylindrocarpon)。

利用rep-PCR研究云南尼泊尔桤木根瘤内Frankia基因多样性

利用rep-PCR指纹技术对云南5个地区的尼泊尔桤木根瘤内Frankia菌基因多样性进行研究,实验发现Frankia菌呈现丰富的基因多样性.所有71个样品被分为11种不同的基因类型.除高黎贡山外,不同地域都有某种基因型占优势,显示Frankia菌基因型与地域有紧密关系.所观察的5个地区中,高黎贡山Frankia菌基因型种类最多,多样性指数最高,基因多样性最为丰富.结合高黎贡山地理资料及其它生物多样性相关研究,推测与高黎贡山尼泊尔桤木共生的Frankia可能作为种储备库,为其它地区的寄主植物提供了祖先菌株.

3种仙人掌植物内生真菌抑菌活性的研究

目的从墨西哥仙人掌、元江仙人掌、绿仙人掌的肉质茎中分离内生真菌,并进行初步鉴定及活性筛选。方法选择30种病原微生物作为指示菌进行抑菌试验。结果从3种仙人掌的茎中分离出111株内生真菌,其中49株内生真菌对一种或多种病原微生物有抑制作用,来自墨西哥仙人掌、元江仙人掌、绿仙人掌的抗菌活性菌株比例分别为48.4%、42.9%及42.3%,其中平板抑菌直径大于15mm的高抗菌株有20株。抗菌活性菌株主要分布于青霉属、曲霉属等19个属中。结论首次从仙人掌中分离和鉴定出111株内生真菌,仙人掌内生真菌中广泛分布着活性菌株。

产生芳香环聚酮类天然产物放线菌的分子筛选研究

目的建立一套简便、快速、高效的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系,为聚酮类药物筛选搭建一个新的技术平台;认识PKS-II基因在不同环境放线菌群中的分布规律,为新药筛选中微生物资源的定向分离提供依据。方法通过对芳香环聚酮类化合物生物合成途径所用的II型聚酮合酶氨基酸和核苷酸序列的同源性比较分析,设计一对简并引物且以微波炉法提取的基因组DNA为模板扩增KS/CLF功能域约0.8kb目的基因片段,依据放线菌基因组中II型PKS合酶基因的存在与否标定可能的芳香环聚酮类天然产物产生菌。结果利用建立的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系对99株嗜碱放线菌、100株链霉菌、47株嗜盐放线菌和776株一般放线菌进行了筛选,研究表明链霉菌、嗜碱放线菌、嗜盐放线菌和一般放线菌II型聚酮合酶基因的阳性率分别为54%、29.3%、25.5%和24.1%。结论组合放线菌基因组DNA快速提取技术和PKSII基因简并引物PCR扩增技术建立了快速、简便、高效的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系并对不同环境条件的放线菌菌群的PKSII基因分布进行了研究。结果表明放线菌PKSII聚酮合酶分布具有广泛性;而且同时表明链霉菌是芳香环聚酮类化合物的最丰富来源;在极端环境放线菌中,嗜盐放线菌的PKSII基因在中度嗜盐放线菌分布的频率远高?

嗜碱放线菌生理学特性的初步研究

对从新疆、青海采集的盐碱土样中分离获得的 2 9株嗜碱放线菌 (alkaliphilicactino mycetes)及 1株模式菌株Nocardiopsisprasina的pH实验 ,不同碱性物质KOH、K2 CO3、NaOH、Na2 CO3对生长的影响 ,及对NaCl、KCl耐受性进行了研究。结果发现 ,少数嗜碱放线菌对Na+ 有一定的依赖性 ,对K+ 碱性物质敏感 ;一些嗜碱放线菌对CO32 敏感 ,NaCl、KCl对一些嗜碱放线菌的生长有抑制作用 ;4种碱性物质对Nocardiopsis菌株生长无影响 ,且它们可耐受高浓度NaCl、KCl。因此提出高碱性环境中是否存在K+ 、CO32 专一性依赖的嗜碱放线菌的推测。

紫牡丹的化学成分研究

目的研究紫牡丹Paeonia delavayi的化学成分.方法利用反复硅胶柱色谱进行分离纯化,通过理化性质和光谱数据分析鉴定化合物结构.结果分离得到11个化合物,分别鉴定为paeonisuffral(Ⅰ)、芍药苷元(paeoniflorigenone,Ⅱ)、palbinone(Ⅲ)、常春藤皂苷元(hederagenin,Ⅳ)、槲皮素-3,7-二甲氧基(quercitrin-3,7-dimethoxy,Ⅴ)、紫云英苷(astragalin,Ⅵ)、单棕榈酸甘油酯(glyceryl monopalmitate,Ⅶ)、1-亚油酸-3-棕榈酸-甘油酯(1-linoloyl-3-palmitoylglycerol,Ⅷ)、没食子酸甲酯(methyl gallate,Ⅸ)、香草酸甲酯(methyl vanillate,Ⅹ)、丁香酸甲酯(methyl syringate,Ⅺ).结论化合物Ⅰ,Ⅲ,Ⅴ～Ⅺ为首次从该植物中分离得到.

云南菌种资源信息系统的开发与应用

应用程序设计语言与数据库引擎 ,开发了“云南菌种资源信息系统”。信息系统包含了云南大学微生物所菌种资源库保藏的 1万余株菌种的信息及相关资料 ,系统的开发不仅为菌种资源库的管理提供了方便 ,还能为有关科研工作及应用开发提供科学准确的资料。

放线菌活性产物对烟草赤星病抑制作用的初步筛选研究

通过孢子萌发法从278份放线菌发酵液提取物中筛选出对烟草赤星病菌[Akemaria altemate（Fr．）Keissler]孢子萌发抑制率在50．00％～100．00％的有34份，占总发酵液提取物的12．23％；离体叶片悬滴法测定了孢子萌发抑制率70％以上的发酵液提取物对赤星病的防治作用，防治效果在50％以上的有17份；并进一步在温室盆栽植株上对防治效果进行了验证试验。