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真核生物TATA框的折叠结构特征 被引量:2
1
作者 罗红 刘次全 曹槐 《Zoological Research》 CAS CSCD 1998年第2期131-136,共6页
通过对真核生物142个基因的部分启动子序列的折叠模型进行分析研究,结果表明,这些基因的TATA框在折叠结构模型中所表现的茎环结构特征有利于与反式作用因子和RNA聚合酶的识别及其相互作用。
关键词 TATA框 折叠结构 真核生物
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稳定的RNA发夹结构及其生物学功能 被引量:2
2
作者 潘珉 王传铭 《生物信息学》 2004年第1期35-40,共6页
以UNCG、GNRA、CUUG(N=A、U、C或G,R=G或A)为端环能够形成稳定的、保守的发夹结构。高分辨率的溶液结构、晶体结构和计算机模拟等方法从原子水平上解析了这些发夹特殊的结构特征。在体内,它们发挥着重要的生物学功能:在折叠过程中作为... 以UNCG、GNRA、CUUG(N=A、U、C或G,R=G或A)为端环能够形成稳定的、保守的发夹结构。高分辨率的溶液结构、晶体结构和计算机模拟等方法从原子水平上解析了这些发夹特殊的结构特征。在体内,它们发挥着重要的生物学功能:在折叠过程中作为折叠的起始位置帮助组织RNA分子正确折叠;与核酸受体结合参与三级相互作用;与蛋白质发生相互作用;阻止逆转录酶的延伸等等。另外,由于C(UUCG)G发夹极其稳定的特征,在体外RNA分子的实验测定中它还是稳定核酸结构的理想工具。这些稳定的发夹广泛分布于体内rRNA、催化RNA和非编码mRNA中。但在对人类编码区mRNA结构特征的研究当中,却未发现C(UUCG)G发夹。 展开更多
关键词 热力学稳定 发夹结构 UNCG环 GNRA环
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结构生物学时代已经到来 被引量:3
3
作者 顾宝洪 刘次全 《科学》 1999年第4期21-24,共4页
生物学的研究对象是具有广泛多样性和层次性的生物系统,因此,对生物系统的研究需在多个层次上进行。纵观生物学的发展史,可以看出,生物学研究已经从种群、个体、系统、器官、组织和细胞层次,逐步深入到分子层次,开辟了生物学研究的崭新... 生物学的研究对象是具有广泛多样性和层次性的生物系统,因此,对生物系统的研究需在多个层次上进行。纵观生物学的发展史,可以看出,生物学研究已经从种群、个体、系统、器官、组织和细胞层次,逐步深入到分子层次,开辟了生物学研究的崭新领域——分子生物学,这既是生物学发展的必然趋势。 展开更多
关键词 结构生物学 分子生物学 生物大分子结构 核酸
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大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系 被引量:14
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作者 王侃 刘次全 +1 位作者 曹槐 陈雪峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期895-899,共5页
从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻... 从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱。另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析。 展开更多
关键词 大肠杆菌 密码子偏好性 mRNA编码区 MRNA二级结构 翻译效率
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大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构 被引量:6
5
作者 张静 顾宝洪 +1 位作者 石秀凡 刘次全 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期174-180,共7页
对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明 ,E.c... 对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明 ,E.coli基因中同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。模型对于蛋白质结构预测算法的改进以及基因工程的研究有辅助作用。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 MRNA 密码子 前后碱基 使用偏向 同义密码子 大肠杆菌 基因
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人基因中密码子前后碱基使用与蛋白质结构 被引量:5
6
作者 张静 顾宝洪 +2 位作者 石秀凡 柳树群 刘次全 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期769-774,共6页
对62个人基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现多数密码子前后碱基的使用有一定偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦提示 ,同... 对62个人基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现多数密码子前后碱基的使用有一定偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦提示 ,同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。结果对于蛋白质结构预测算法以及基因工程的研究有辅助作用。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 MRNA 密码子前后碱基使用偏向 同义密码子
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Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号 被引量:3
7
作者 张静 石秀凡 刘次全 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期523-527,共5页
形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷 (poly (A) )作用涉及前体mRNA下游的三个元件 :效率元件(EE)、定位元件 (PE)以及实际的剪切和 poly (A)作用位点 ,实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成 .对 180个Yeast基因下游 (终止密码子后 2... 形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷 (poly (A) )作用涉及前体mRNA下游的三个元件 :效率元件(EE)、定位元件 (PE)以及实际的剪切和 poly (A)作用位点 ,实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成 .对 180个Yeast基因下游 (终止密码子后 2 0 0个碱基 )二级结构进行的详细分析显示 ,约 86 %的EE、 89%的PE与二级结构中碱基非配对的环 (发夹环、膨胀环、内环或多分支环 )区或连接单链区有关 .这个结果提示 ,反式因子对EE和PE的识别和作用在一定程度上有赖于EE和PE的二级结构特征 . 展开更多
关键词 Yeast基因 多聚腺苷作用信号 MRNA二级结构 蛋白质合成
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内含子二级结构与剪接位点 被引量:9
8
作者 张静 刘次全 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第3期477-481,共5页
对67个内含子的二级结构进行分析后,我们发现内含子两末端的碱基G绝大多数是游离的,剪接过程中形成“马套”结构的分枝点A有80%以上位于环区或游离的单链区,内含子5’端的G与分枝点A在空间位置上彼此靠近。
关键词 内含子 二级结构 剪接位点
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微波加热技术在有机合成和材料制备等方面的应用进展 被引量:3
9
作者 毕先钧 谢小光 +2 位作者 王真 洪品杰 戴树珊 《云南化工》 CAS 1998年第2期7-10,共4页
简要介绍了微波加热技术在有机合成、环境污染物的处理和材料制备等方面的应用。
关键词 微波加热 有机合成 污染物处理 材料制备 加热
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三联体密码子在mRNA二级结构中的分布(英文) 被引量:1
10
作者 张静 顾宝洪 +1 位作者 彭守礼 刘次全 《Zoological Research》 CAS CSCD 1998年第5期350-358,共9页
对编码成熟肽的mRNA二级结构的分析显示,每个密码子在mRNA二级结构中的位置有一定的倾向性,这种倾向性似乎与相应氨基酸的构象性质相一致。大多数编码疏水氨基酸的密码子位于mRNA二级结构中较稳定的茎区;反之,大多数编... 对编码成熟肽的mRNA二级结构的分析显示,每个密码子在mRNA二级结构中的位置有一定的倾向性,这种倾向性似乎与相应氨基酸的构象性质相一致。大多数编码疏水氨基酸的密码子位于mRNA二级结构中较稳定的茎区;反之,大多数编码亲水氨基酸的密码子位于柔性的环区。这个结果支持了最近得到的关于mRNA与蛋白质之间存在着三维结构信息传递的结论。 展开更多
关键词 三联体密码子 氨基酸序列 MRNA二级结构 密码子
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P53蛋白质N末端的二级结构预测及其三维构象 被引量:3
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作者 张彦 刘次全 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期743-749,共7页
以编码P53N末端120个残基的mRNA二级结构为基础,结合Chou-Fasman蛋白质二级结构预测原则,预测出P53蛋白质N端的93个残基包含四段α螺旋结构(14-26;38-46;51-56;68-70),没有发... 以编码P53N末端120个残基的mRNA二级结构为基础,结合Chou-Fasman蛋白质二级结构预测原则,预测出P53蛋白质N端的93个残基包含四段α螺旋结构(14-26;38-46;51-56;68-70),没有发现β片层。与四种以多重序列联配为基础的蛋白质二级结构预测方法(准确率均为73.20%左右)相对照,结果十分相近。在SGI工作站上以此为初始结构建立的三维构象提示,P53N末端前80个氨基酸肽段呈弧型板块结构,其转录激活区由两段主要螺旋组成,呈上下构形,占据弧型板块的顶部及底部外侧缘。C端13个富含脯氨酸肽段则呈弯曲松散状。 展开更多
关键词 P53蛋白质 MRNA二级结构 二级结构 三维构象
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灵香草的化学成分 被引量:4
12
作者 段文贵 谢小光 《广西化工》 CAS 1995年第3期13-16,共4页
综述灵香草化学成分的各种研究结果,指出灵香草的化学成分随产地和研究方法不同有很大差异。
关键词 灵香草 化学成分 香料
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mRNA解折叠的链构象与相应新生肽链构象相关性的探索 被引量:3
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作者 刘次全 《自然杂志》 北大核心 2006年第1期31-36,F0003,共7页
在蛋白质翻译过程中,mRNA发夹依次解折叠成具有特定构象的单链,后者在核糖体上通过与A和P位点tRNA相互识别、取向和定位等,影响或决定肽基转移中心的新生肽链的构象。翻译过程是复杂的,但其机理可能是简单的。
关键词 MRNA 新生肽链 构象相关性
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三维遗传信息与第三遗传密码 被引量:3
14
作者 刘次全 《科学文化评论》 2005年第1期94-106,共13页
本文系对生物系统的一个重大科学问题由假说到求证所作的阶段性自主探索的报导和讨论。主要涉及 mRNA 与编码蛋白质之间是否存在三维结构的遗传关系和对破译"第三遗传密码"的探索。事实上,基于实验数据和结构模型,我们已经发... 本文系对生物系统的一个重大科学问题由假说到求证所作的阶段性自主探索的报导和讨论。主要涉及 mRNA 与编码蛋白质之间是否存在三维结构的遗传关系和对破译"第三遗传密码"的探索。事实上,基于实验数据和结构模型,我们已经发现和找到多项证据来证实这种关系的存在,但还缺乏直接的关键生物学实验证据来证明"三维遗传信息"存在的正确性。目前,生物学实验已起步。 展开更多
关键词 MRNA 编码蛋白质 "三维遗传信息" "第三遗传密码"
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严防椰心叶甲和椰棕象虫两大杀手 被引量:5
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作者 刘海桑 《云南农业》 2004年第12期12-13,共2页
关键词 椰心叶甲 椰棕象虫 棕榈植物 形态特征 防治
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棕榈科植物在西南地区园林应用的策略与方法 被引量:6
16
作者 刘海桑 《西南园艺》 2006年第3期45-48,共4页
棕榈科是独特的园林观赏植物。针对棕榈科植物应用的策略与方法,提出全局观、系统观、运动观和辩证观;针对目前应用中存在的问题,介绍了差异化造景策略,配置的原则与技巧,实地实树的引种原则,以及移栽养护技术。
关键词 棕榈科 园林应用 西南地区
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大肠杆菌PRIBOW与起始位点的统计分析
17
作者 罗红 刘次全 曹槐 《Zoological Research》 CAS CSCD 1998年第4期308-313,共6页
通过对大肠杆菌RNA聚合酶识别的44个启动子及其起始位点进行统计分析,估计了PRIBOW的系列范围,计算出它们的信息量。所得结果与真核生物中HUMAN的TATA框进行比较,得到了这两个物种的信息量曲线与不确定值曲线都... 通过对大肠杆菌RNA聚合酶识别的44个启动子及其起始位点进行统计分析,估计了PRIBOW的系列范围,计算出它们的信息量。所得结果与真核生物中HUMAN的TATA框进行比较,得到了这两个物种的信息量曲线与不确定值曲线都具有显著差异,尤其在PRIBOW和TATA框与起始位点的对应关系上得到明显不同的结果。PRIBOW与起始位点有比较明显的关系,而HUMAN的TATA框与起始位点的对应关系则不太明确。 展开更多
关键词 PRIBOW 信息量 TATA框 不确定值 起始位点
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一种新的棕榈科枣椰属的种的检索方法兼评《海枣引种栽培初探》
18
作者 刘海桑 刘次全 《浙江林业科技》 2004年第6期37-40,共4页
指出《海枣引种栽培初探》一文误将枣椰属的3个种当作1个种的3个品系并误用了一些形态学术语,给出了枣椰属的检索表。
关键词 引种栽培 棕榈科 品系 初探 检索表 形态学 学术 检索方法 误用 术语
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动脉粥样硬化病人血清铁高的探讨
19
作者 张晓林 曹槐 +2 位作者 杨丽霞 段玉云 张世坤 《中国临床营养杂志》 1999年第4期155-157,共3页
目的探讨血清铁高与测定方法及与动脉粥样硬化的关系。方法82例动脉粥样硬化病人(AS),47例健康人(CK)血清用消化法(Dig.)和稀释法(Dil.)ICP-AES测定血清铁。结果Dig.测得值显著高于Dil.AS血清总铁显著高于CK,AS血清总铁与... 目的探讨血清铁高与测定方法及与动脉粥样硬化的关系。方法82例动脉粥样硬化病人(AS),47例健康人(CK)血清用消化法(Dig.)和稀释法(Dil.)ICP-AES测定血清铁。结果Dig.测得值显著高于Dil.AS血清总铁显著高于CK,AS血清总铁与血清总胆固醇含量显著正相关,CK血清总铁与血清总胆固醇含量不相关。结论AS与血清总铁高有关。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 血清铁 心血管疾病 稀释法 AS 胆固醇
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稳定的RNA发夹结构在人类88个mRNA编码区中的分布
20
作者 潘珉 王传铭 刘次全 《自然科学进展》 北大核心 2004年第7期749-754,共6页
以UNCG ,GNRA ,CUUG (N =A ,U ,C或G ;R =G或A)为端环能够形成稳定的、保守的发夹结构 .它们具有特殊的结构特征 ,并在体内发挥着重要的生物学功能 .这些稳定的发夹广泛分布于体内rRNA ,催化RNA和非编码mRNA中 .但对人类 88个编码区mRN... 以UNCG ,GNRA ,CUUG (N =A ,U ,C或G ;R =G或A)为端环能够形成稳定的、保守的发夹结构 .它们具有特殊的结构特征 ,并在体内发挥着重要的生物学功能 .这些稳定的发夹广泛分布于体内rRNA ,催化RNA和非编码mRNA中 .但对人类 88个编码区mRNA二级结构的研究当中 ,却没有发现C(UUCG)G发夹 .而且 ,与rRNA不同 ,这些编码区mRNA四环序列的分布没有明显的偏好性 . 展开更多
关键词 热力学稳定 发夹结构 UNCG环 GNRA环RNA结构 MRNA 生物学功能
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