基因测序技术在发现昆虫体内噬菌体中的应用

采用系统综述评价利用基因测序技术发现昆虫体内噬菌体的可行性。以“宏基因组”“扩增”“昆虫”“肠道微生物”“噬菌体”“metagenomics”“amplification”“insects”“gut microbes”“phage”为关键词,通过PubMed、中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据库及维普数据库对2000年1月至2022年6月发表的相关文献进行检索。按照纳入、排除标准筛选文献并对纳入文献进行定性分析。结果表明,根据纳入、排除标准,从227篇文献中筛选出合格的文献8篇,其中1篇为利用宏基因组测序技术从昆虫体内分离出噬菌体,其余7篇文章均为通过基因扩增测序技术发现昆虫体内存在WO噬菌体相关序列。宏基因组测序技术及基因扩增后测序均可发现昆虫体内是否存在噬菌体。宏基因组测序技术与PCR扩增测序技术结合可了解昆虫肠道内微生物的丰度及功能,以及噬菌体侵染情况和种类分布情况。

野生型鼠疫噬菌体YP060的分离和生物学特性鉴定

目的从鼠疫疫源地鼠巢中分离1株野生型鼠疫噬菌体（YP060）并分析其生物学特性。方法采用双层琼脂平皿法从云南省鼠疫疫源地鼠巢中分离鼠疫噬菌体；描述其形态特征；了解裂解能力、宿主谱、最佳感染复数、一步生长特性；分析不同温度和pH值、紫外线、氯仿对噬菌体的敏感性。结果YP060形态呈蝌蚪形，头部为正多面体结构，带有一伸缩的尾鞘；对鼠疫疫苗株EV76的最佳感染复数为0．1；潜伏期为50min，暴发期为80min；宿主谱评价显永，YP060仅裂解鼠疫疫苗株；YP060在30～50℃具有较强的热稳定性；pH值5～10范同内均有较强的裂解活性；对紫外线比较敏感；对氯仿不敏感，5％浓度的氯仿对其活性基本没有影响。结论本研究为国内首次从鼠疫疫源地鼠巢中分离到鼠疫噬菌体YP060，该噬菌体具有窄宿主谱和较强的生物学裂解特性。