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云南6地域带绦虫mtCOXⅠ片段序列测定分析
被引量:
1
1
作者
张辉
马顺高
+1 位作者
钟国梁
杨毅梅
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1199-1201,共3页
目的利用mtCOXⅠ片段的PCR和序列测定鉴定云南6地域(怒江、大理、迪庆、西双版纳、临沧、楚雄)带绦虫的虫种,并构建系统发育树。方法从6地域采集带绦虫成虫,抽提DNA,PCR扩增mtCOXⅠ片段,并做序列测定;结合GenBank中已知的猪带绦虫、牛...
目的利用mtCOXⅠ片段的PCR和序列测定鉴定云南6地域(怒江、大理、迪庆、西双版纳、临沧、楚雄)带绦虫的虫种,并构建系统发育树。方法从6地域采集带绦虫成虫,抽提DNA,PCR扩增mtCOXⅠ片段,并做序列测定;结合GenBank中已知的猪带绦虫、牛带绦虫、亚洲带绦虫mtCOXⅠ序列,经DNA MAN软件处理后计算遗传距离并构建系统发育树状图。结果遗传距离矩阵表显示:NJ4、NJ1和DQ2的遗传距离为99.8%,DL4和NJ3的遗传距离为99.5%,NJ2和DQ3的遗传距离为98.8%,DL3与BZ3的遗传距离为98.3%,而与BZ2的遗传距离为96.0%;系统发育树显示:NJ1~4、DL2~3及DQ1~3共10个标本株与BZ3聚为一支.BN1、CX1、LC1与BZ2聚为一支,两支交汇后再与由DL1和BZ1聚合的一支汇合。结论怒江和迪庆各株为亚洲带绦虫,西双版纳、临沧和楚雄株为牛带绦虫,大理株为亚洲带绦虫和猪带绦虫。同虫种不存在地理区域的差异。mtCOXⅠ片段的序列测定可用于带绦虫分类鉴定。
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关键词
带绦虫
鉴定
mtCOXⅠ
序列测定
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职称材料
题名
云南6地域带绦虫mtCOXⅠ片段序列测定分析
被引量:
1
1
作者
张辉
马顺高
钟国梁
杨毅梅
机构
大理
学院基础医学院寄生虫学教研室
云南省大理白族自治州医院检验科
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1199-1201,共3页
基金
国家自然科学基金(No:30860252)资助项目
文摘
目的利用mtCOXⅠ片段的PCR和序列测定鉴定云南6地域(怒江、大理、迪庆、西双版纳、临沧、楚雄)带绦虫的虫种,并构建系统发育树。方法从6地域采集带绦虫成虫,抽提DNA,PCR扩增mtCOXⅠ片段,并做序列测定;结合GenBank中已知的猪带绦虫、牛带绦虫、亚洲带绦虫mtCOXⅠ序列,经DNA MAN软件处理后计算遗传距离并构建系统发育树状图。结果遗传距离矩阵表显示:NJ4、NJ1和DQ2的遗传距离为99.8%,DL4和NJ3的遗传距离为99.5%,NJ2和DQ3的遗传距离为98.8%,DL3与BZ3的遗传距离为98.3%,而与BZ2的遗传距离为96.0%;系统发育树显示:NJ1~4、DL2~3及DQ1~3共10个标本株与BZ3聚为一支.BN1、CX1、LC1与BZ2聚为一支,两支交汇后再与由DL1和BZ1聚合的一支汇合。结论怒江和迪庆各株为亚洲带绦虫,西双版纳、临沧和楚雄株为牛带绦虫,大理株为亚洲带绦虫和猪带绦虫。同虫种不存在地理区域的差异。mtCOXⅠ片段的序列测定可用于带绦虫分类鉴定。
关键词
带绦虫
鉴定
mtCOXⅠ
序列测定
Keywords
Taenia cestodes
identification
mtCOXⅠ
sequencing
分类号
R383.3 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南6地域带绦虫mtCOXⅠ片段序列测定分析
张辉
马顺高
钟国梁
杨毅梅
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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