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应用基因芯片技术筛选大肠腺瘤-癌序列相关基因的初步研究
被引量:
8
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作者
唐慧
邹云莲
+7 位作者
朱军
严颜
寿涛
左赞
何旭
杨昆宪
严新民
郭强
《中华消化内镜杂志》
北大核心
2009年第10期527-532,共6页
目的筛选贯穿于大肠癌发生、发展全过程的基因,探讨大肠腺瘤一癌序列发生的分子机制。方法Trizol法分别提取正常大肠黏膜,大肠腺瘤,DukesA、DukesB和DukesC—D大肠腺癌组织的总RNA,分离纯化mRNA,逆转录得双链cDNA,生物素标记cRNA...
目的筛选贯穿于大肠癌发生、发展全过程的基因,探讨大肠腺瘤一癌序列发生的分子机制。方法Trizol法分别提取正常大肠黏膜,大肠腺瘤,DukesA、DukesB和DukesC—D大肠腺癌组织的总RNA,分离纯化mRNA,逆转录得双链cDNA,生物素标记cRNA探针,与Affymetrix U133 PLAS2.0基因芯片(涵盖18400个转录本,代表14500个功能已知的基因)杂交,Gene Scanner3000激光系统扫描,GCOS1.2分析软件读取处理杂交信号。计算机分析,比较5种组织基因表达谱差异。结果分别以大肠腺瘤,Dukes A、Dukes B和DukesC—D大肠腺癌组织与正常大肠黏膜组织的基因表达谱相比后发现在4个组中存在共同表达差异的基因253个,其中表达持续上调基因34个(已知基因29个,未知功能基因5个),表达持续下调基因219个(已知基因196个,未知功能基因23个)。结论大肠癌的发生发展是一个多基因参与的复杂演变过程。这些基因在大肠癌前病变一大肠腺瘤阶段就已经有异常表达,说明正常大肠黏膜细胞恶性转变的潜能在癌前病变阶段就已经存在,并且其作用持续贯穿于大肠癌发生发展的整个过程。因此,对这些基因的进一步研究有助于全面了解大肠腺瘤一癌序列的分子机制,并对大肠癌的早期诊断和及时干预治疗具有指导意义。
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关键词
腺瘤息肉病
结肠
腺癌
基因表达芯片
基因表达谱
原文传递
题名
应用基因芯片技术筛选大肠腺瘤-癌序列相关基因的初步研究
被引量:
8
1
作者
唐慧
邹云莲
朱军
严颜
寿涛
左赞
何旭
杨昆宪
严新民
郭强
机构
云南省第一人民医院
(
昆明
医学院
附属
昆华
医院
)省重点实验室
云南省第一人民医院
(
昆明
医学院
附属
昆华
医院
)
普
外
二
科
云南省第一人民医院
(
昆明
医学院
附属
昆华
医院
)消化内
科
云南省第一人民医院
(
昆明
医学院
附属
昆华
医院
)肿瘤
科
中国药
科
大学药
学院
出处
《中华消化内镜杂志》
北大核心
2009年第10期527-532,共6页
基金
云南省科技厅社会发展(基础研究)项目资助(2008CD203)
云南省社会发展科技计划-社会事业发展专项项目资助(2009CA09)
文摘
目的筛选贯穿于大肠癌发生、发展全过程的基因,探讨大肠腺瘤一癌序列发生的分子机制。方法Trizol法分别提取正常大肠黏膜,大肠腺瘤,DukesA、DukesB和DukesC—D大肠腺癌组织的总RNA,分离纯化mRNA,逆转录得双链cDNA,生物素标记cRNA探针,与Affymetrix U133 PLAS2.0基因芯片(涵盖18400个转录本,代表14500个功能已知的基因)杂交,Gene Scanner3000激光系统扫描,GCOS1.2分析软件读取处理杂交信号。计算机分析,比较5种组织基因表达谱差异。结果分别以大肠腺瘤,Dukes A、Dukes B和DukesC—D大肠腺癌组织与正常大肠黏膜组织的基因表达谱相比后发现在4个组中存在共同表达差异的基因253个,其中表达持续上调基因34个(已知基因29个,未知功能基因5个),表达持续下调基因219个(已知基因196个,未知功能基因23个)。结论大肠癌的发生发展是一个多基因参与的复杂演变过程。这些基因在大肠癌前病变一大肠腺瘤阶段就已经有异常表达,说明正常大肠黏膜细胞恶性转变的潜能在癌前病变阶段就已经存在,并且其作用持续贯穿于大肠癌发生发展的整个过程。因此,对这些基因的进一步研究有助于全面了解大肠腺瘤一癌序列的分子机制,并对大肠癌的早期诊断和及时干预治疗具有指导意义。
关键词
腺瘤息肉病
结肠
腺癌
基因表达芯片
基因表达谱
Keywords
Adenomatous polyposis coli
Adenocarcinoma
Gene expression chips
Gene expression profiling
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
应用基因芯片技术筛选大肠腺瘤-癌序列相关基因的初步研究
唐慧
邹云莲
朱军
严颜
寿涛
左赞
何旭
杨昆宪
严新民
郭强
《中华消化内镜杂志》
北大核心
2009
8
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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