云南省人群地中海贫血遗传多样性的研究

目的了解云南省人群中地中海贫血的基因突变谱、地理及民族分布规律.方法对地中海贫血筛查阳性患者进行α-和β-地贫基因突变类型检测,根据地贫类型进行民族分布和地理分布统计分析,比较云南省与云南省周围地区地贫突变类型情况.结果在234例经基因诊断确诊的α-地中海贫血患者中,检测到4种常见的α-珠蛋白基因突变基因型,这4种突变基因型分别是:--SEA(62.82%)、-α3.7(19.66%)、αCS(12.39%)、-α4.2(5.13%);在登记了民族籍贯的74例α-地贫患者中,汉族、傣族人数分别为47人、19人;在550例经基因诊断确诊的β-地贫患者中检测出17种β-珠蛋白基因突变基因型,其中按检出率顺位的前7种分别是:βE(CD26,32.00%),CD17(22.18%),CD41-42(18.91%),IVS-Ⅱ-654(16.18%),-28(5.09%),CD71-72(2.00%),CD27-28(0.91%);在登记了民族籍贯的248例β-地贫患者中,汉族、傣族、壮族人数分别为160人、26人、11人;β-地贫在云南东南部地区最常见的类型是CD41-42,云南西南部地区最常见的类型是βE.结论云南人群中,β-地贫最常见类型是βE突变,与国内其它地区明显不同;α-地贫最常见类型是--SEA突变型,与国内其它地区相似.云南人群中地贫的基因突变型多样,突变类型存在地区和民族差异.

中国云南省两个边境地区傣族人群β-地中海贫血基因突变谱分析

目的:探讨云南省两个边境地区傣族人群β-地中海贫血基因突变类型构成。方法:对来源于德宏和西双版纳的傣族人群应用血红蛋白和血常规检测筛查地中海贫血,以YCR-RDB技术(反向点杂交技术)检测β-也中海贫血基因突变,分析比较两地傣族人群β-地中海贫血基因突变类型构成比。结果:确诊186例β-地中海贫血患者的基因突变,共检出10种突变类型,以CD26(62.56%),CD41-42(18.97%),CD17(14.36%),CD71-72(2.05%),IVS-Ⅱ-654(1.54%)5种突变为主。在德宏地区傣族人群中检出4种突变类型,为CD26(80.31%),CD17(11.02%),CD4142(6.30%)和CD71-72(2.36%),在西双版纳地区傣族人群检出6种突变类型,以CD41-42(42.64%),CD26(29.41%),CD17(20.59%)为多见。结论:β-地中海贫血基因突变在云南省傣族人群中存在较大遗传异质性,不同地区的傣族人群有明显差异。

单基因遗传病分子诊断的新策略和新方法

单基因遗传病具有复杂的表型异质性及遗传异质性,基因突变可涉及点突变、片段缺失/重复、整个基因的缺失/重复、以及动态突变等众多类别。分子诊断技术使得单基因遗传病可在分子水平乃至单个碱基发生变异的情况下做出准确诊断,然而其可靠性问题成为备受瞩目的技术难点。针对不同遗传病使用不同的解决方案,是目前单基因遗传病分子诊断的主流思想。基因诊断相关人员不仅要了解遗传疾病致病基因及其突变特点,还要熟知各种检测技术的特点,合理选择。

云南汉族15个短串联重复序列基因座遗传多态性特征及分析

目的：调查云南地区汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15个短串联重复序列（Short tandem repeat,STR）基因座的遗传多态性。方法：收集云南汉族313名无关个体血样,提取DNA,PCR复合扩增并利用ABI-3130型基因分析仪进行毛细管电泳检测每个样本各基因座的等位基因大小,分别统计每个STR基因座各基因型的频率,并进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验。结果：云南汉族这15个STR基因座各基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0.05）,杂合度在0.636～0.901,匹配概率在0.034～0.220,单一STR位点的个体识别率在0.780~0.966、非父排除率在0.336～0.797、多态性信息总量在0.555～0.860,联合使用这15个位点所产生的累积个体识别率大于0.999 999 99,累积非父排除率等于0.999 998 408。与中国其他地区汉族群体这15个STR基因座等位基因频率分布相比有较高的相似性,但也有轻微的地区差异。结论：云南汉族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA这15个STR基因座具有高度的多态性,与中国其他地区汉族群体有较高的相似性,在法医学中的亲子鉴定和个人识别方面具有较高应用价值。

2014-2015年云南省文山州HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的了解2014-2015年云南省文山州免费抗病毒治疗获得性免疫缺陷综合征(简称艾滋病)感染者和艾滋病患者HIV-1基因型耐药发生情况及特点。方法收集文山州2014-2015年接受免费抗病毒治疗的艾滋病患者的临床及实验室资料,对抗病毒治疗持续6个月以上、病毒载量仍大于1 000copies/mL的患者进行基因型耐药检测,分析耐药发生情况及耐药毒株流行特点。结果 2014-2015年共计176例艾滋病患者发生病毒学失败,共检测基因型耐药176人次,获得可用序列137条。该人群中耐药发生率为62.0%(85/137)。在使用过的药物中,对奈韦拉平(NVP)、依非韦仑(EFV)高度耐药的有62(45.3%)、50(36.5%);对拉米夫定(3TC)、替诺福韦(TDF)、司他夫定(D4T)、齐多夫定(AZT)高度耐药的情况分别是31(22.6%)、12(8.8%)、8(5.8%)、2(1.5%),对蛋白酶抑制剂(PI)没有出现高度耐药的情况。耐药突变与PI相关的主要耐药基因突变位点有3例,占2.2%(3/137);M46IM、T74S和L33I各1例。与核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)相关的突变中,突变位点发生频率最高的是M184V/I,为23.4%(32/137)。与非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)的突变中,突变位点发生频率最高的是K103N/S,为27%(34/137)。137条完整基因序列中,主要为CRF08_BC亚型,共67例(48.9%);其次是CRF01_AE亚型,共49例(35.8%);CRF07_BC亚型有6例(4.4%);另外还有15例(10.9%)URFs。结论当前文山州的耐药发生率在增加,毒株正变得复杂化,重组毒株在逐渐增加,应加强监测,防止耐药毒株的传播。

中国云南汉族和傣族育龄人群的地中海贫血基因分析

目的:了解云南汉族和傣族育龄人群地中海贫血(简称地贫)的常见基因突变类型。方法:对血液学筛查阳性的小细胞低色素携带者或贫血患者DNA样本,采用Gap-PCR方法和PCR-寡核苷酸探针反向斑点杂交法检测α-或β-珠蛋白基因常见突变类型;采用DNA直接测序法检测可能存在的未知突变;统计分析云南汉族和傣族人群中珠蛋白突变的类型。结果:在685例受检者中共检出40种基因型,其中α-地贫携带者前3位的基因型分别是--^(SEA)/αα(占49.09%)、-α^(3.7)/αα(36.67%)和α^(CS)α/αα(8.79%);β-地贫携带者前3位的基因型分别是CD26(GAG>AAG)/N(43.78%)、CD41-42(-CTTT)AA(20.1%)和CD17(AAG>TAG)/N(18.9%)。在685例样本中,汉族348例,傣族212例,这2个民族的珠蛋白基因常见突变顺位各有不同,但傣族人群中地中海贫血基因突变类型比较集中。在38例α-地中海贫血复合β-地中海贫血双重杂合子中,傣族就有28例。结论:云南人群中α-和β-珠蛋白基因突变类型的多样性较为丰富,突变谱与国内其他地区的人群不同。

产前诊断对活产婴儿出生缺陷顺位影响的研究

目的分析开展产前筛查、遗传咨询及超声产前检查等产前诊断服务,对确诊异常的部分胎儿进行干预性终止妊娠后,了解活产婴儿出生缺陷发生率及出生缺陷顺位的变化。方法对该院自2004年1月～2008年12月开展产前筛查、遗传咨询及超声产前检查等产前诊断和干预性终止妊娠后的活产婴儿出生缺陷病例进行统计描述和统计分析。结果①该院自2004年1月～2008年12月共出生围产儿16602例,男性8713例,女性7885例,性别不明4例;出生缺陷儿308例,围产期出生缺陷发生率为18.55‰;②产前诊断确诊为严重畸形胎儿97例,终止妊娠后,使出生缺陷率由18.55‰下降为12.71‰,差异有显著性(χ2=18.42,P<0.001);其中,以神经管畸形降幅最为明显,先天性心脏病、唐氏综合征及总唇裂均有所下降,改变了原出生缺陷顺位。严重出生缺陷顺位后移,但干预前后先天性心脏病仍居出生缺陷顺位之首。结论①产前诊断及干预性终止妊娠可降低活产婴儿的出生缺陷发生率,使出生缺陷顺位发生了改变。②产前诊断并干预性终止妊娠对减少社会疾病负担有巨大的贡献。

建立云南地区11～13^(+6)周胎儿颈项透明层厚度正常中位数值的临床意义

1992年Nicolaidis等首次提出胎儿颈项透明层这一概念。随颈项透明层厚度（nuchal translucency thickness，NT）增加，胎儿患唐氏综合征（Down’s syndrome，DS）的风险增加。早孕期血清学产前筛查增加NT测量值联合评估胎儿患DS风险，可在设定假阳性率为5％时，将DS检出率由62％提高到96％，因此NT测量具有重要的临床意义。11—13^＋6周胎儿NT值随孕周稍有增加趋势，不同孕周有不同的正常中位数值。本研究根据我院随访受检孕妇妊娠结局，统计了云南地区11—13^＋6周胎儿NT正常中位数值，分析其临床应用价值。

array-CGH在产前诊断染色体疾病中的应用

微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)结合了比较基因组杂交技术(CGH)、微阵列芯片技术(micro-array)的优势,在分子遗传学中广泛应用于全基因组水平的拷贝数分析。array-CGH在产前诊断染色体疾病中的应用相比于传统的细胞遗传学核型分析技术以及荧光原位杂交技术(FISH)、多重荧光定量PCR(QF-PCR)、多重连接探针扩增技术(MLPA)等分子遗传学技术具有高通量、高分辨、高灵敏度、操作自动化等优势;能够检测出相当一部分常规核型分析技术不易发现的染色体微缺失和微重复综合征,以及亚端粒或者其他不平衡的染色体重排。目前用array-CGH进行全基因组扫描进行产前诊断,判断和评估所检出的拷贝数变异(CNVs)的临床意义有一定难度。对不同位点CNVs出现频率及临床意义研究可能会是近期研究热点之一。

有Duchenne肌营养不良家族史孕妇的产前基因诊断

目的对有Duchenne肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)家族史的孕妇进行产前诊断研究。方法 PCR检测胎儿的性别决定基因(SRY)和DMD基因常见缺失的18个外显子,同时用DMD基因的6个(CA)n重复序列STR位点进行连锁分析,对31例有DMD家族史的孕妇进行产前诊断;随访健康胎儿出生后的发育情况,评估产前诊断方法的可靠性。结果 32例胎儿(1例双胎)中,18例女性胎儿中有6例为DMD基因携带者;14例男性胎儿中4例为DMD患儿。结论对DMD高风险胎儿进行SRY基因检测,联合应用DMD基因的18个外显子检测和连锁分析能够准确、有效地产前诊断DMD。

59例地中海贫血患者的基因诊断研究

目的建立可检测中国南方常见α珠蛋白基因缺失和β珠蛋白基因突变的常规检测技术,探讨该技术的临床应用价值和云南人群中地中海贫血(地贫)的基因突变类型。方法运用多重PCR、PCR-RFLP和PCR-RDB等技术,分别进行α地贫和β地贫的基因诊断。结果从112例疑似地贫患者中检出α珠蛋白基因缺失和突变患者30例,包括4种基因型;检出β珠蛋白基因突变患者29例,包括6种基因型;常见突变病例占52.7%。对其中10对夫妇的地贫高风险胎儿进行产前诊断,检出中间型α地贫HbH-CS病胎儿1例,轻型α地贫胎儿1例,β地贫杂合子胎儿2例。结论多重PCR、PCR-RFLP和PCR-RDB等技术能够快速、准确地进行α地贫和β地贫的基因诊断,但可能漏检部分病例。若在此类病例中与DNA测序配合使用,这些技术有较好的临床应用价值。

双胎妊娠介入性产前诊断临床价值分析

目的探讨双胎妊娠介入性产前诊断临床价值及安全性。方法采用回顾性分析方法,分析存在介入性产前诊断指征的双胎妊娠孕妇临床资料。结果介入性产前诊断双胎妊娠88例,其中,羊膜腔穿刺术87例,脐带血穿刺术1例。实际产前诊断胎儿个数169例,检出胎儿异常19例(11.18%)。其中:(1)产前筛查DS高风险29例、ES高风险1例,DS高风险检出双胎之一DS儿2例,检出双胎均为45,XX,der(13;14)(q10;q10)pat。(2)胎儿超声检查异常11例,检出双胎之一69,XXX 1例;18-三体4例;双胎之一46,XY,t(12;18)(q13;q21)de novo1例。(3)高龄20例,检出双胎之一DS儿2例。(4)高龄+DS高风险15例,检出双胎之一DS儿4例。(5)单基因遗传病产前诊断6例,其中地中海贫血产前诊断4例,双胎均为血红蛋白H病1例、双胎均为重型β-地贫1例选择终止妊娠;双胎均为轻型α-地中海贫血1例。耳聋基因产前诊断2例,其中1例耳聋基因双重杂合突变,1例检出双胎之一耳聋基因异常、之一胎儿结构异常两例均选择终止妊娠。(6)其他7例。术后1个月随访,流产率为0。经遗传咨询4例选择终止妊娠、2例选择减胎术、13例选择期待疗法。结论介入性产前诊断是双胎产前发现胎儿染色体异常及单基因遗传病安全、有效的手段,能有效避免缺陷儿出生,具有极大的临床实用价值。

荧光原位杂交技术在非整倍体快速产前诊断中的临床应用

荧光原位杂交技术（fluorescentinsituhy—bridization，FISH）是20世纪80年代发展起来的一种集分子生物学、细胞遗传学及免疫学为一体的新技术。在基础生物学领域和临床研究如：染色体疾病产前诊断、实体瘤特异性染色体数目异常、

软骨发育不全患者的FGFR3基因诊断

目的建立软骨发育不全(ACH)患者的FGFR3基因检测方法。方法用PCR扩增和测序技术对临床上疑似ACH的14例患者的FGFR3基因突变进行测序。结果 FGFR3基因的外显子10测序结果显示,14例疑似ACH患者中10例检出FGFR3基因1138位G→A突变。对4例未检出突变的样本进行FGFR3基因的全部外显子测序,有2例样本检出FGFR3基因882位T→C杂合突变,最后确定其为已知的单核苷酸多态性(SNP)位点(rs2234909)。对4例样本中的1例进行了后续检查,证实该受检者不是ACH患者。结论 FGFR3基因的突变检测有助于疑似ACH患者的明确诊断,对遗传咨询具有重要意义。

PCR技术在产前诊断常见非整倍体疾病中的临床应用

非整倍体疾病是类因染色体数量异常引起的综合征,目前尚无有效的治疗方法,产前诊断后终止妊娠是预防此类疾病患儿出生的可行措施。染色体核型分析是诊断该类疾病的金标准,但细胞培养耗时较长。近年,PCR技术在非整倍体疾病快速诊断应用中发展迅速,具有试剂成本相对较低、检测批量大和快速的优势。本文分别从定性、半定量、定量不同层次来探讨PCR及相关技术常见非整倍体疾病的产前诊断中的应用。

唐氏综合征快速产前诊断方法的研究

目的:建立快速产前诊断唐氏综合征的方法。方法:以唐氏综合征关键区域内的STR(Short tandem repeat,STR)作为遗传标记,采用荧光定量PCR的方法扩增外周血和胎儿羊水标本STR位点,同时与细胞遗传学分析结果比较,评价荧光定量PCR快速诊断方法的特异性和灵敏度。结果:细胞遗传学分析确诊的68例正常核型和32例唐氏综合征标本中,荧光定量PCR快速诊断结果均与染色体核型分析结果一致。其中正常核型的STR位点杂合体样本扩增产物显示为双峰,各位点的峰面积比值分别是D21S111.1～1.2;D21S14111.3～1.5;D21S20391.0～1.1;STR位点纯合体样本的扩增产物显示为单峰。而唐氏综合征患者的样本STR位点扩增产物可显示为1∶1∶1的三个峰,或者典型的2∶1的双峰,此类双峰的峰面积比值分别为D21S111.4～1.9;D21S14111.5～2.0;D21S20391.3～1.6。正常组和病例组的峰面积比值经秩和检验差异有显著意义(P<0.01)。结论:荧光定量PCR具有快速、特异性高、可标准化操作等优点,适宜于快速诊断唐氏综合征。

母血浆中胎儿游离DNA检测及非侵入性产前诊断的研究进展

通过母血浆中胎儿游离DNA检测获得胎儿信息,成为非侵入性产前诊断的研究热点。随着研究的不断深入,对母血浆中胎儿游离DNA生物学特性的认识日趋丰富。就其来源、片段长度分布及清除机制都有进一步发现,其生物学标记物也呈现多样性。从父源性的Y染色体特异序列的检测到表观遗传学方面的突破,使非侵入性产前诊断技术的应用范围不再局限于男胎也降低了诊断的假阴性率。此外,对其检测技术及方法理论日臻成熟,从传统的PCR实验方法到肽核酸、时间飞行质谱技术、QPCR、数字化PCR、大规模平行基因组测序,都为实现非侵入性产前诊断技术在临床的广泛应用奠定基础。现已利用母血浆中胎儿游离DNA开展研究或进行临床诊断的有胎儿性别鉴定、胎儿Rh基因检测、胎儿非整倍体检测、胎儿染色体片段异常的检测、妊娠相关疾病、单基因病等。本文回顾了母血浆中胎儿游离DNA的应用研究。

云南省部分地区新生儿先天性甲状腺功能减低症筛查结果分析

目的：总结并分析云南省部分州市先天性甲状腺功能减低症（CH）的筛查结果。方法对2012年7月至2014年4月在云南省昭通市、曲靖市、丽江市和迪庆藏族自治州四地出生的活产婴儿236218例进行CH筛查，其中男121463例，女114755例。初筛足跟血促甲状腺激素（TSH）≥8μIU/L者原血片重新复查，复查后仍为阳性者召回进一步测定静脉血TSH和游离甲状腺素（FT4）以明确诊断。结果236218名新生儿中，血片合格率为96.67%，不合格血片补采率为81.75%，初筛阳性召回率为73.02%。确诊CH 66例，其中男性36例，女性30例（P〉0.05）。CH发病率为1：3579，显著低于全国平均发病水平（1/2034，P〈0.01）。患儿出生胎龄多为37-42周，〉42周者只占3%；大部分患儿出生体重在正常范围；出生身长〈50 cm者占32%。结论云南地区CH发病率低于全国平均水平；CH患儿临床特征无特异性；云南地区新生儿疾病筛查工作质量还需要进一步提高。

围孕期选择性TORCH筛查的临床意义

目的:调查围孕期不同人群TORCH感染的发生率,了解育龄人群的TORCH自然免疫情况,探讨围孕期选择性TORCH筛查的临床意义。方法:采用酶联免疫检测(EIA)法,检测4085名孕前咨询者和不同孕周孕妇血清TORCH抗体水平,采用相对数、卡方检验分组统计,比较不同人群血清抗体阳性率。结果:TORCH抗体阳性率在孕前男、女性无明显差别;女性TORCH抗体检测结果,在早孕期组抗体阳性率均较孕前组高,但差异无显著性;没有宠物接触史、感冒、感染症状的孕妇中,TORCH-IgM抗体、TOX-IgG抗体均为阴性;而有宠物接触史、感冒、感染症状的孕妇中,TORCH-IgM抗体阳性率分别是:TOX-IgM42·86%、RUB-IgM1·37%、CMV-IgM6·58%、HSV-IgM77·42%;两组孕妇的RUB、CMV、HSV-IgG抗体阳性率无明显差异。结论:临床上可对孕前育龄妇女、有宠物接触史、感冒、感染症状的孕妇选择性地进行TORCH筛查,以减少胎儿宫内感染的风险。