紫色番茄SlWD40-like基因克隆与表达分析

WD-重复蛋白(WD-repeat protein)是一类含有WD40基序的蛋白,在植物响应非生物逆境胁迫的过程中具有重要调控作用。为揭示紫色番茄中WD40重复蛋白的功能,从富含花青素紫色番茄品种‘砚紫1号’中克隆 SlWD40-like基因,并对该基因在不同组织部位和不同胁迫条件下的表达模式进行分析。结果表明, SlWD40-like基因编码1个含有460个氨基酸的蛋白质。蛋白序列分析显示,SlWD40-like蛋白含有6个WD40基序,是典型的WD40重复蛋白。预测分析发现,该蛋白为亲水性蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主;该蛋白序列在物种间具有高度的保守性,系统发生进化树分析表明紫番茄SlWD40-like氨基酸序列与潘那利番茄蛋白亲缘关系最近,其次是胡萝卜。应用qRT-PCR分析 SlWD40-like基因组织特异表达发现,该基因在叶和紫色果实中表达量最高。qRT-PCR分析表明, SlWD40-like基因受到盐胁迫、干旱胁迫脱落酸(ABA)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导表达,推测该基因可能参与紫色番茄逆境胁迫应答。该研究为后续进一步分析紫色番茄 SlWD40-like基因功能奠定了基础。

蔗糖：蔗糖1-果糖基转移酶基因Ao1-SST的克隆及表达分析

芦笋根茎间物质转化主要碳水化合物形式是果聚糖,为研究芦笋果聚糖合成相关基因及其表达模式,本研究以四倍体芦笋品种“紫色激情”为供试材料,采用同源克隆结合RT-PCR的方法克隆了蔗糖:蔗糖1-果糖基转移酶基因Ao1-SST,核心编码区长度为1 887 bp,编码一个含有628个氨基酸的蛋白质。蛋白序列分析显示,Ao1-SST蛋白含有糖基水解酶32功能域。预测分析发现,该蛋白为亲水性蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主;该蛋白序列在物种间具有高度的保守性,系统发生进化树分析表明Ao1-SST氨基酸序列与龙舌兰亲缘关系最近。qRT-PCR分析表明,Ao1-SST基因在贮藏根中表达量最高,其次是母茎和吸收根。本研究为后续解析紫色芦笋中Ao1-SST基因在根、茎中以果聚糖为主要贮藏物质的分子机制功能提供了研究依据。

芦笋果聚糖:果聚糖6-果糖基转移酶基因Ao6G-FFT序列特征及表达模式研究

为分析芦笋(Asparagus officinalis)果聚糖合成关键基因功能特征,本研究以二倍体芦笋为供试材料,基于RT-PCR技术克隆果聚糖:果聚糖6-果糖基转移酶基因Ao6G-FFT,并通过生物信息学方法分析基因、启动子和氨基酸序列特征,通过qRT-PCR方法研究芦笋Ao6G-FFT基因在非生物胁迫处理下的表达情况。研究发现,Ao6G-FFT基因的c DNA及其基因组序列全长分别为1812 bp和17351 bp,基因组序列包含6个内含子和7个外显子,编码含有603个氨基酸残基的亲水性蛋白,并含有一个跨膜螺旋区和一个典型的信号肽结构。启动子区域(ATG上游约2 kb)含有TATA-box等保守元件外,还存在大量与非生物胁迫和激素诱导响应的元件。组织特异表达分析表明,该基因在不同组织器官中均有表达,但贮藏根等地下部组织器官中基因表达量显著高于地上部分。qRT-PCR分析表明,Ao6G-FFT基因受到冷胁迫、干旱胁迫、脱落酸和茉莉酸甲酯诱导表达,推测该基因可能参与芦笋逆境胁迫应答。