对羟基苯甲酸乙酯暴露于雌性斑马鱼对子代胚胎发育的毒性效应

目的:探讨对羟基苯甲酸乙酯(EtP)暴露对子一代(F1)斑马鱼胚胎发育毒性的影响及其相关分子机制。方法:将四月龄的雌性斑马鱼持续暴露于文献报道相关浓度0.5 mg/L和2 mg/L中28 d,染毒结束后,将已暴露EtP的雌性斑马鱼与同周龄的雄性斑马鱼交配,观察F1代胚胎发育情况,采用转录组测序技术(RNA-seq),进一步阐释EtP暴露对F1代毒性效应的分子机制。结果:与对照组比较,EtP组F1代96 hpf孵化率明显降低;死亡率和畸形率明显增加(P<0.05),96 hpf卵黄囊面积和心率增加,24 hpf自发卷尾运动明显增加(P<0.05);96 hpf眼面积明显减小(P<0.05)。EtP组F1代144 hpf幼鱼运动距离和游泳速度均明显降低(P<0.05)。F1代96 hpf幼鱼RNA-seq测序结果表明,DEGs与神经系统发育调节、眼睛的视网膜发育有关,且RT-qPCR与RNA-seq结果一致。结论:EtP母源性暴露可导致无EtP直接暴露的F1代斑马鱼胚胎发育异常,特别是神经系统发育和视网膜发育。

基于16S rDNA基因测序技术分析不同体长斑马鱼的肠道菌群结构差异

目的:分析探究同亲代不同体长斑马鱼肠道菌群组成和丰度差异。方法:将同一亲代的3月和6月龄子代斑马鱼,按性别及体长进行分组,采用16S rDNA序列分析技术检测斑马鱼肠道菌群构成,比较不同性别及体长的斑马鱼肠道菌群多样性和丰度差异。结果:Alpha多样性分析结果显示,3月龄斑马鱼同一性别体长与体短组间菌群丰度和多样性存在明显差异,生长至6月龄时,这一差异则无统计学意义。Beta多样性分析结果显示不同体长组肠道菌群具有明显的分群;6月龄优势菌门中,前6种优势菌门在雄性长组与短组组间差异无统计学意义;变形杆菌门和梭杆菌门在雌性长组与短组组间差异显著。线性判别分析结果显示,不同月龄体长长组与短组分别富集7个和3个菌门群落;不同月龄长组与短组分别富集13个和7个菌属群落。结论:斑马鱼体长与肠道菌群多样性密切相关,调节肠道菌群的结构及丰度可能是促进骨骼生长的有效途径。

基于机器学习探究临床联合增强CT影像组学特征对肺结节良恶性的鉴别诊断价值

目的:通过机器学习方式对肺结节的增强CT特征提取影像组学和临床特征分析对其定性诊断的价值。方法:回顾性分析本院2018年6月至2022年7月有明确手术标本病理证实的89例肺结节患者,其中良性结节患者37例,恶性结节患者52例,按照8∶2比例将其分为训练集和测试集,逐层提取患者平扫期、动脉期、静脉期病灶区域的感兴趣区(ROI),采用软件提取影像组学纹理特征,使用单因素分析、多因素分析和最小绝对收缩和选择算子进行特征筛选,并采用多种机器学习的方法建立预测其良恶性的模型,基于特征权重建立SHAP值图,最后使用DCA曲线分析患者获益程度。结果:训练集72例,测试集17例,共提取了影像组学特征和临床特征数量分别为2800和31个。经特征筛选,共保留13个影像特征和4个临床特征。临床特征中既往肺部基础疾病史、细胞角蛋白19的可溶性片段(CYFRA21-1)及影像特征中的毛刺征、分叶征在良恶性组中差异有统计学意义(P<0.05),采用了多种机器学习算法,其中效能最高的是XGBoost算法,DCA结果表明患者可获得良好收益。结论:基于增强CT及肿瘤标志物等建立的XGBoost模型对鉴别肺结节的性质具有重要价值。

[C_(4)mim]Cl亲代暴露对F1代斑马鱼胚胎-幼体发育毒性的影响

目的探究1-丁基-3-甲基咪唑氯盐([C_(4)mim]Cl)亲代暴露对子一代(F1)斑马鱼胚胎发育毒性的影响及相关分子机制。方法将亲代斑马鱼置于不同浓度(12.5、25、50、75 mg/L)[C_(4)mim]Cl的水环境中暴露7 d后配对产卵,观察其F1代胚胎死亡、孵化及发育等情况,采用转录组测序(RNA-seq)技术,筛选差异表达基因(DEGs)并进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路、GO功能富集分析及蛋白质相互作用网络(PPI)分析。结果受精后时间(hpf)为12 h(12 hpf)的对照组死亡率为4.70%,12.5、25、50和75 mg/L暴露组12 hpf死亡率分别为12.11%、15.68%、20.35%和22.93%,呈浓度依赖性增加,差异有统计学意义(P<0.05)。36和48 hpf对照组孵化率分别为8.12%和79.13%,均高于暴露组,差异均有统计学意义(P均<0.05),其中,48 hpf中25、50和75 mg/L暴露组的孵化率分别为55.09%、48.83%和34.82%,呈剂量依赖式递减(P<0.05)。96 hpf对照组畸形率为0.28%,25、50和75 mg/L暴露组畸形率分别为4.07%、4.67%和7.01%,呈剂量依赖关系,与对照组相比差异均有统计学意义(P均<0.05)。畸形类型主要包括尾巴弯曲、脊柱畸形、静脉窦出血、心包积液和卵黄囊水肿。96 hpf幼鱼RNA-seq测序结果表明,4个暴露组共有562个DEGs。KEGG通路富集分析表示DEGs主要富集于三羧酸循环、糖酵解/糖异生和cAMP/PKA信号转导通路,结合PPI筛选出蛋白互作联系较强的DEGs有pdha1b、aco2、gapdh、pck1、pdha1b和cnga1。GO功能注释富集分析结果表示DEGs主要富集于生物学过程中的细胞过程、生物调控和代谢过程,结合PPI筛选出蛋白互作联系较强的DEGs有pde6h、pde6a、cnga1、arr3a、opn4.1和LOC562466。结论[C_(4)mim]Cl亲代暴露可导致F1代斑马鱼代谢异常,对胚胎-幼鱼具有代际发育毒性效应。