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开发与柑桔抗溃疡病基因连锁的由RLK-RGC衍生的分子标记(英文)
被引量:
5
1
作者
向旭
郑启发
+3 位作者
黄舒
陈存贤
Frederick G.GmitterJr
邓占鳌
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005年第6期821-828,共8页
本文是在先期研究工作的基础上,利用从柑桔与枳属间杂种的基因组DNA所获得的类受体激酶(RLK)的候选抗病基因序列,重新设计引物,对柑桔抗溃疡病材料和感病材料开展以PCR扩增为基础的对比分析,其中一对引物‘19h16/DdeI’的扩增产物经限...
本文是在先期研究工作的基础上,利用从柑桔与枳属间杂种的基因组DNA所获得的类受体激酶(RLK)的候选抗病基因序列,重新设计引物,对柑桔抗溃疡病材料和感病材料开展以PCR扩增为基础的对比分析,其中一对引物‘19h16/DdeI’的扩增产物经限制性内切酶DdeI酶切,揭示了抗性材料(IchangPape-da,Meiwakumquat,MaruhikumquatandNagamikumquat)和感病材料(FlyingDragon,ValenciaorangeandPalestinesweetlime)之间的多态性差异,同时,在C.Ichangensis的自交F1代和Palestinesweetlime×IchangPapeda的杂交F1代群体中也见明显的多态性差异;对这些F1代个体进行溃疡病病原[Xanthomonasax-onopodispv.Citri(Xac)]接种作抗病性表型鉴定,结果表明,该分子标记‘19h16/DdeI’与柑桔溃疡病抗性密切相关;经纯化测序的结果进一步证明,抗性材料PCR扩增产物具有完全一致的序列和DdeI酶切位点,但感病材料缺少这一DdeI酶切位点;染色体步行(primerwalking)在BAC文库的对应单克隆中获得了一个完整的抗病基因序列,与以前获得的2个抗病基因序列‘17o6RLKP’和‘26m19RLKP’相比,‘19h16RLKP’也具有Xa21抗病基因蛋白的所有特征,包括含有一个信号肽、同样数目的亮氨酸重复序列、跨膜域和激酶域等。基于该序列的开放读码框,发展了特异性更强可靠性更高的另一分子标记,在今后的研究工作中具有较大的应用潜力。
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关键词
柑桔
溃疡病
抗性基因
类受体激酶
分子标记
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职称材料
柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进(英文)
被引量:
2
2
作者
向旭
邓占鳌
+2 位作者
郑启发
陈存贤
Frederick G.Gmitter Jr
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2009年第3期497-504,共8页
本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插...
本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插入序列设计引物,对柑桔抗线虫材料和感线虫材料开展以PCR扩增为基础的集群分离分析,发现一部分克隆序列与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1紧密连锁;再通过染色体步行测序,分别从3个克隆(7A4,4L17和29F20)获得3个完整的NBS-LRR类候选抗病基因序列。从此类序列开发更高特异性的分子标记,并在利用原有分子标记的基础上,对柑桔线虫抗性杂交后代群体(9145family)构建较高密度的遗传图谱;同时,将新开发的分子标记应用于柑桔衰退病抗性杂交后代群体(9401family),以初步估算柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1与柑桔衰退病抗性基因Ctv的遗传距离。本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插入序列设计引物,对柑桔抗线虫材料和感线虫材料开展以PCR扩增为基础的集群分离分析,发现一部分克隆序列与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1紧密连锁;再通过染色体步行测序,分别从3个克隆(7A4,4L17和29F20)获得3个完整的NBS-LRR类候选抗病基因序列。从此类序列开发更高特异性的分子标记,并在利用原有分子标记的基础上,对柑桔线虫抗性杂交后代群体(9145family)构建较高密度的遗传图谱;同时,将新开发的分子标记应用于柑桔衰退病抗性杂交后代群体(9401family),以初步估算柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1与柑桔衰退病抗性基因Ctv的遗传距离。
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关键词
柑桔
线虫
抗性基因
分子标记
遗传作图
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职称材料
斑点法检测柑桔黄龙病,香蕉束顶病
被引量:
1
3
作者
张陶
周玲红
+2 位作者
胡绪岚
李永川
RichardF.Lee
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
1993年第1期61-65,共5页
用改进的斑点法检测柑桔黄龙病类细菌、香蕉束顶病毒(BBTV),均获满意结果.阳性反应在硝基纤维转移膜上形成深浅不等的褐色斑点.检测健康柑桔、香蕉粗汁液,获阴性结果,在上述固相载体上不形成有色物质.在缓冲液TBS中加入2%TritonX-100和...
用改进的斑点法检测柑桔黄龙病类细菌、香蕉束顶病毒(BBTV),均获满意结果.阳性反应在硝基纤维转移膜上形成深浅不等的褐色斑点.检测健康柑桔、香蕉粗汁液,获阴性结果,在上述固相载体上不形成有色物质.在缓冲液TBS中加入2%TritonX-100和1%国产蛋白片,作为改进后的封闭缓冲液,封闭硝基纤维转移膜上未结合抗原部位,效果较好.斑点法检测活体香蕉束顶病样品及-30℃冷冻保存6个月香蕉束顶病样品,同样获满意结果.斑点法快速、准确、简单、灵敏度高、特异性强,可用于植物检疫,存在于硝基纤维转移膜上的检疫结果可长期保存.
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关键词
柑桔
黄梢病
香焦
束顶病
斑点法
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职称材料
RAPD分析──鉴定柑桔体细胞杂种的快速方法
被引量:
82
4
作者
肖顺元
黄舒
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1995年第4期40-42,共3页
本文利用改进的DNA提取方法,从Volkamer柠檬CitrusvolkamerianaTen.andPasq.)和酸橙(C.aurantiumL.)及其原生质体杂种植株的叶片中抽提总DNA,进行RAPD(Rando...
本文利用改进的DNA提取方法,从Volkamer柠檬CitrusvolkamerianaTen.andPasq.)和酸橙(C.aurantiumL.)及其原生质体杂种植株的叶片中抽提总DNA,进行RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)分析。结果表明:在随机选取的15种引物中,有10种可单独或与其它引物一道鉴定这一组合的体细胞杂种。与形态学性状观察、同工酶及DNA杂交分析等方法比较,RAPD分析是一种可在试管苗期即可直接、准确、快速鉴定柑桔体细胞杂种的方法。
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关键词
柑桔
RAPD
体细胞杂种
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职称材料
海南蒟cDNA文库的构建及评价
被引量:
2
5
作者
范睿
凌鹏
+5 位作者
顾文亮
李付鹏
郝朝运
闫林
黄丽芳
邬华松
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期636-640,共5页
全长cDNA文库构建是改良胡椒性状的分子机理研究基础,有助于重要相关基因的克隆、功能分析、调控及其利用。以性状优良并具代表性的海南蒟(Piper hainanense)为试材,采用优化的In-Fusion SMARTerTMDirectional cDNA Library Construct...
全长cDNA文库构建是改良胡椒性状的分子机理研究基础,有助于重要相关基因的克隆、功能分析、调控及其利用。以性状优良并具代表性的海南蒟(Piper hainanense)为试材,采用优化的In-Fusion SMARTerTMDirectional cDNA Library Construction Kit技术,构建叶片材料的全长cDNA文库。结果表明:文库的滴度为2.0×10^6cfu/mL,文库容量为1.3×10^6cfu。从文库中随机挑取20个克隆进行质粒DNA提取、PCR及酶切鉴定,结果显示:插入片段大小为1.0-2.0 kb,重组率为100%,表明该文库质量较高,可满足后续研究需要。
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关键词
海南蒟
叶片
CDNA文库
构建
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职称材料
题名
开发与柑桔抗溃疡病基因连锁的由RLK-RGC衍生的分子标记(英文)
被引量:
5
1
作者
向旭
郑启发
黄舒
陈存贤
Frederick G.GmitterJr
邓占鳌
机构
广东省农科院果树
研究
所
美国
佛罗里达大学柑桔研究与教育中心
美国
佛罗里达大学
海岸
研究与
教育
中心
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005年第6期821-828,共8页
文摘
本文是在先期研究工作的基础上,利用从柑桔与枳属间杂种的基因组DNA所获得的类受体激酶(RLK)的候选抗病基因序列,重新设计引物,对柑桔抗溃疡病材料和感病材料开展以PCR扩增为基础的对比分析,其中一对引物‘19h16/DdeI’的扩增产物经限制性内切酶DdeI酶切,揭示了抗性材料(IchangPape-da,Meiwakumquat,MaruhikumquatandNagamikumquat)和感病材料(FlyingDragon,ValenciaorangeandPalestinesweetlime)之间的多态性差异,同时,在C.Ichangensis的自交F1代和Palestinesweetlime×IchangPapeda的杂交F1代群体中也见明显的多态性差异;对这些F1代个体进行溃疡病病原[Xanthomonasax-onopodispv.Citri(Xac)]接种作抗病性表型鉴定,结果表明,该分子标记‘19h16/DdeI’与柑桔溃疡病抗性密切相关;经纯化测序的结果进一步证明,抗性材料PCR扩增产物具有完全一致的序列和DdeI酶切位点,但感病材料缺少这一DdeI酶切位点;染色体步行(primerwalking)在BAC文库的对应单克隆中获得了一个完整的抗病基因序列,与以前获得的2个抗病基因序列‘17o6RLKP’和‘26m19RLKP’相比,‘19h16RLKP’也具有Xa21抗病基因蛋白的所有特征,包括含有一个信号肽、同样数目的亮氨酸重复序列、跨膜域和激酶域等。基于该序列的开放读码框,发展了特异性更强可靠性更高的另一分子标记,在今后的研究工作中具有较大的应用潜力。
关键词
柑桔
溃疡病
抗性基因
类受体激酶
分子标记
Keywords
Citrus, Canker disease, Resistant gene, Receptor-like kinase (RLK), Molecular marker
分类号
S436.66 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进(英文)
被引量:
2
2
作者
向旭
邓占鳌
郑启发
陈存贤
Frederick G.Gmitter Jr
机构
广东省农业科学院果树
研究
所
美国
佛罗里达大学
海岸
研究与
教育
中心
美国
佛罗里达大学柑桔研究与教育中心
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2009年第3期497-504,共8页
基金
supported in part by grants from the USDA NRICGP (9201765, 9600748)
USDA/National Citrus Research Council (98012205)
the Florida Citrus Production Research Advisory Council (942-27)
文摘
本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插入序列设计引物,对柑桔抗线虫材料和感线虫材料开展以PCR扩增为基础的集群分离分析,发现一部分克隆序列与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1紧密连锁;再通过染色体步行测序,分别从3个克隆(7A4,4L17和29F20)获得3个完整的NBS-LRR类候选抗病基因序列。从此类序列开发更高特异性的分子标记,并在利用原有分子标记的基础上,对柑桔线虫抗性杂交后代群体(9145family)构建较高密度的遗传图谱;同时,将新开发的分子标记应用于柑桔衰退病抗性杂交后代群体(9401family),以初步估算柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1与柑桔衰退病抗性基因Ctv的遗传距离。本文利用先期从BAC文库获得的NBS-LRR类候选抗病基因克隆序列Pt8a和Pt9a,进一步开发与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1连锁的分子标记。以Pt8a和Pt9a序列作探针,通过高密度克隆印迹杂交,从BAC文库筛选出200个以上的阳性克隆,以阳性克隆插入序列设计引物,对柑桔抗线虫材料和感线虫材料开展以PCR扩增为基础的集群分离分析,发现一部分克隆序列与柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1紧密连锁;再通过染色体步行测序,分别从3个克隆(7A4,4L17和29F20)获得3个完整的NBS-LRR类候选抗病基因序列。从此类序列开发更高特异性的分子标记,并在利用原有分子标记的基础上,对柑桔线虫抗性杂交后代群体(9145family)构建较高密度的遗传图谱;同时,将新开发的分子标记应用于柑桔衰退病抗性杂交后代群体(9401family),以初步估算柑桔线虫抗性主效基因位点Tyr1与柑桔衰退病抗性基因Ctv的遗传距离。
关键词
柑桔
线虫
抗性基因
分子标记
遗传作图
Keywords
Citrus, Nematode, Resistance gene, Molecular marker, Genetic map
分类号
S436.66 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
斑点法检测柑桔黄龙病,香蕉束顶病
被引量:
1
3
作者
张陶
周玲红
胡绪岚
李永川
RichardF.Lee
机构
云南省植保植检站
云南省农业技术推广总站
美国
佛罗里达大学柑桔研究与教育中心
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
1993年第1期61-65,共5页
文摘
用改进的斑点法检测柑桔黄龙病类细菌、香蕉束顶病毒(BBTV),均获满意结果.阳性反应在硝基纤维转移膜上形成深浅不等的褐色斑点.检测健康柑桔、香蕉粗汁液,获阴性结果,在上述固相载体上不形成有色物质.在缓冲液TBS中加入2%TritonX-100和1%国产蛋白片,作为改进后的封闭缓冲液,封闭硝基纤维转移膜上未结合抗原部位,效果较好.斑点法检测活体香蕉束顶病样品及-30℃冷冻保存6个月香蕉束顶病样品,同样获满意结果.斑点法快速、准确、简单、灵敏度高、特异性强,可用于植物检疫,存在于硝基纤维转移膜上的检疫结果可长期保存.
关键词
柑桔
黄梢病
香焦
束顶病
斑点法
Keywords
Dot-immunobinding assay
Detection Citrus yellow shoot disease
Banana bunchy top virus
分类号
S436.6 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
RAPD分析──鉴定柑桔体细胞杂种的快速方法
被引量:
82
4
作者
肖顺元
黄舒
机构
华中农业
大学
园艺系
美国
佛罗里达大学柑桔研究与教育中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1995年第4期40-42,共3页
文摘
本文利用改进的DNA提取方法,从Volkamer柠檬CitrusvolkamerianaTen.andPasq.)和酸橙(C.aurantiumL.)及其原生质体杂种植株的叶片中抽提总DNA,进行RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)分析。结果表明:在随机选取的15种引物中,有10种可单独或与其它引物一道鉴定这一组合的体细胞杂种。与形态学性状观察、同工酶及DNA杂交分析等方法比较,RAPD分析是一种可在试管苗期即可直接、准确、快速鉴定柑桔体细胞杂种的方法。
关键词
柑桔
RAPD
体细胞杂种
分类号
S666.032 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
海南蒟cDNA文库的构建及评价
被引量:
2
5
作者
范睿
凌鹏
顾文亮
李付鹏
郝朝运
闫林
黄丽芳
邬华松
机构
中国热带农业科学院香料饮料
研究
所
农业部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室
海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室
佛罗里达大学柑桔研究与教育中心
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期636-640,共5页
基金
外专局引智项目(No.20124600010)
热带香料饮料种质资源圃(No.12R22-20)
文摘
全长cDNA文库构建是改良胡椒性状的分子机理研究基础,有助于重要相关基因的克隆、功能分析、调控及其利用。以性状优良并具代表性的海南蒟(Piper hainanense)为试材,采用优化的In-Fusion SMARTerTMDirectional cDNA Library Construction Kit技术,构建叶片材料的全长cDNA文库。结果表明:文库的滴度为2.0×10^6cfu/mL,文库容量为1.3×10^6cfu。从文库中随机挑取20个克隆进行质粒DNA提取、PCR及酶切鉴定,结果显示:插入片段大小为1.0-2.0 kb,重组率为100%,表明该文库质量较高,可满足后续研究需要。
关键词
海南蒟
叶片
CDNA文库
构建
Keywords
Piper hainanense
Leaf
CDNA library
Construction
分类号
Q949.732.3 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
开发与柑桔抗溃疡病基因连锁的由RLK-RGC衍生的分子标记(英文)
向旭
郑启发
黄舒
陈存贤
Frederick G.GmitterJr
邓占鳌
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2005
5
下载PDF
职称材料
2
柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进(英文)
向旭
邓占鳌
郑启发
陈存贤
Frederick G.Gmitter Jr
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2009
2
下载PDF
职称材料
3
斑点法检测柑桔黄龙病,香蕉束顶病
张陶
周玲红
胡绪岚
李永川
RichardF.Lee
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
1993
1
下载PDF
职称材料
4
RAPD分析──鉴定柑桔体细胞杂种的快速方法
肖顺元
黄舒
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1995
82
下载PDF
职称材料
5
海南蒟cDNA文库的构建及评价
范睿
凌鹏
顾文亮
李付鹏
郝朝运
闫林
黄丽芳
邬华松
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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