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保山猪精子获能相关基因ABHD2的分子特征及转录调控研究
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作者 张霞 袁清婷 +4 位作者 赵加鼎 龚绍荣 富国文 霍金龙 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期155-162,共8页
本文旨在研究保山猪2-酰基甘油脂肪酶(Abhydrolase Domain-Containing Protein 2,ABHD2)在精子获能过程中的转录调控特征及生物学功能。对12月龄保山猪的睾丸进行转录组测序;利用转录组测序数据构建ABHD2的ceRNA调控网络分析图;分析ABHD... 本文旨在研究保山猪2-酰基甘油脂肪酶(Abhydrolase Domain-Containing Protein 2,ABHD2)在精子获能过程中的转录调控特征及生物学功能。对12月龄保山猪的睾丸进行转录组测序;利用转录组测序数据构建ABHD2的ceRNA调控网络分析图;分析ABHD2的氨基酸序列在多个物种间的同源性和蛋白质功能特性,并构建多物种蛋白质进化树和互作网络。结果表明,ABHD2基因的CDS长度为1 278 bp,编码425个氨基酸,定位在7号染色体,含有11个外显子。疏水性分析结果发现ABHD2蛋白质N端和C端均亲水,其二级结构中α螺旋的占比最大,所占比例达到44.47%。系统进化分析表明ABHD2的氨基酸序列在多物种中相似度高达98%,较为保守。对ABHD2及其邻近基因分析发现其邻近基因在各物种中以高度保守的形式分布。蛋白互作网络分析结果中发现了多个与ABHD2互作的蛋白,互作强度从高到低依次为SPA17、ZPBP、PRKAR2A、CATSPER1、ABHD16A、ABHD4,这些蛋白主要参与精子获能、顶体反应、阳离子通道络合物、精子鞭毛、细胞识别、羧酸酯水解酶活性、钙调蛋白结合、钙活化阳离子通道活性等相关通路。ceRNA调控网络揭示ABHD2基因受ssc-miR-151-3p调控,ABHD2可与2个lncRNA竞争ssc-miR-151-3p。本研究从多个角度分析了ABHD2的分子特征和转录调控功能,为进一步研究ABHD2基因在保山猪睾丸精子获能中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 保山猪 ABHD2基因 精子获能 顶体反应 转录调控
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保山猪BMP7基因的SNP筛选及生物信息学分析
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作者 杨世婷 李文君 +6 位作者 龚绍荣 赵加鼎 周戚斌 吴玲想 刘珈纶 李献君 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期91-96,共6页
试验旨在探究BMP7基因在保山猪上的分子遗传特性。以保山猪为研究对象,采用直接测序法对其BMP7基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件对保山猪BMP7基因编码蛋白结构及理化性质进行分析与预测。结果表明:保山猪BMP7基因外显子上共出现... 试验旨在探究BMP7基因在保山猪上的分子遗传特性。以保山猪为研究对象,采用直接测序法对其BMP7基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件对保山猪BMP7基因编码蛋白结构及理化性质进行分析与预测。结果表明:保山猪BMP7基因外显子上共出现5个SNP位点,分别为Exon2(98 T>C、143T>C)、Exon4(91 C>T、94 A>G)、Exon6(26 T>C),均为同义突变。生物信息学分析表明,BMP7基因理论等电点为6.86,分子量为46 714.69;保山猪BMP7基因编码的蛋白为可溶性蛋白,无跨膜结构,有一个膜内蛋白,有信号肽存在,蛋白质三级结构空间构象未发生变化。综上,保山猪BMP7基因在编码区外显子上的5个突变位点均为同义突变,保守程度较高,蛋白质结构和功能并未发生改变,本研究结果可为保山猪的选育工作提供参考。 展开更多
关键词 保山猪 BMP7基因 SNP 生物信息学
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保山猪ESR基因与产仔数的关联分析 被引量:1
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作者 吴正明 龚绍荣 +3 位作者 周戚斌 李文君 赵加鼎 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期207-210,共4页
本研究共采集保山猪耳组织样品180头份,记录、统计、分析保山猪经产母猪共计328窝仔猪的总产仔数和产活仔数2个繁殖性状。通过PCR-RFLP技术对保山猪ESR基因的多态性进行研究,分别计算ESR基因在保山猪群体中的等位基因频率、基因型频率... 本研究共采集保山猪耳组织样品180头份,记录、统计、分析保山猪经产母猪共计328窝仔猪的总产仔数和产活仔数2个繁殖性状。通过PCR-RFLP技术对保山猪ESR基因的多态性进行研究,分别计算ESR基因在保山猪群体中的等位基因频率、基因型频率、多态信息含量、卡方值等遗传信息值,并将ESR基因多态性与保山猪产仔数进行关联分析。结果表明,ESR基因通过PCR-RFLP技术在保山猪群体中检测出多态性;ESR基因Pvu II酶切位点在保山猪群体中检测出AA、AB、BB基因型,其频率分别为:0.205 6、0.472 2、0.322 2。等位基因A、B的频率分别为0.441 7、0.558 3,其中AB基因型为优势基因型,B等位基因为优势等位基因。保山猪ESR基因多态信息含量为0.372 0,属于中度多态,杂合度为0.493 9,遗传变异程度较高,卡方值为0.162 6,处于Hardy-Weinberg动态平衡状态。AB基因型为高产基因型,与AA基因型之间总产仔数和产活仔数差异极显著。本研究结果表明ESR基因可作为影响保山猪母猪产仔数的主效基因或分子标记位点。该结果为后期保山猪繁殖性状的研究提供了重要依据。 展开更多
关键词 保山猪 ESR基因 多态性 产仔数
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保山猪和杜洛克猪IGF-1基因的SNP筛选及生物信息学分析
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作者 李文君 富国文 +5 位作者 龚绍荣 赵加鼎 李再磊 吴正明 周戚斌 赵桂英 《现代畜牧兽医》 2023年第1期26-32,共7页
试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响。试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构。结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白... 试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响。试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构。结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白的外显子上共筛选出1个SNP位点(Exon4-G189A),该突变属于同义突变,引起密码子改变,但所编码的氨基酸未改变。生物信息学分析结果显示,保山猪IGF-1基因CDS区编码164个氨基酸,分子式为C782H1265N247O239S11,相对分子质量为18303.82,理论等电点为9.89,不稳定性指数为73.25,整体表现为亲水性,不具有跨膜结构,含有信号肽序列;蛋白质二级结构只含有无规则卷曲和α-螺旋,分别占60.37%、39.63%,三级结构预测模型与保山猪IGF-1基因的蛋白结构匹配度为-1.15,具有较好的一致性。研究表明,IGF-1基因在物种进化过程中高度保守,使其编码保山猪和杜洛克猪的氨基酸序列相同,蛋白质结构和功能差异很小或不存在差异,能否作为调控保山猪瘦肉少、脂肪多、生长慢的候选基因还需进行关联性的研究。 展开更多
关键词 保山猪 杜洛克猪 IGF-1 SNP 生物信息学
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保山猪IGF2基因相对表达量与肉质性能的关联分析 被引量:2
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作者 吴正明 龚绍荣 +6 位作者 赵加鼎 邱丙姗 李再磊 程娜 李文君 李云祥 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第S01期132-135,共4页
本研究旨在探究IGF2基因在保山猪3个组织中的相对表达量对其肉质性能的影响。利用荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测IGF2基因在保山猪背最长肌、背脂、肝脏3个不同组织中的相对表达量,并与保山猪肉质性状进行关联分析。结果表明:IGF2基因在... 本研究旨在探究IGF2基因在保山猪3个组织中的相对表达量对其肉质性能的影响。利用荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测IGF2基因在保山猪背最长肌、背脂、肝脏3个不同组织中的相对表达量,并与保山猪肉质性状进行关联分析。结果表明:IGF2基因在3个组织中的表达量为肝脏>背脂>背最长肌;IGF2基因在保山猪背最长肌中的相对表达量与肌肉化学成分中的粗灰分呈显著负相关,与肌纤维密度呈显著正相关;在背部脂肪中的相对表达量与保山猪熟肉率成显著正相关,与肌肉pH1h和pH24h均呈显著负相关;在肝脏中的相对表达量与保山猪肌肉中的色差a(红度)呈显著负相关。研究表明IGF2基因相对表达量与保山猪肉质性状存在相关关系,但能否作为调控保山猪肉质性能的关键基因还需要进一步深入研究。 展开更多
关键词 保山猪 IGF2基因 相对表达量 肉质性能
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保山猪LPL基因表达量与生长及胴体性能的关联分析
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作者 李文君 程娜 +6 位作者 龚绍荣 赵加鼎 邱丙姗 吴正明 李再磊 周戚斌 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第8期205-209,共5页
为探究保山猪LPL基因相对表达量对生长性能、胴体性能的影响,本实验采用实时荧光定量PCR技术测定LPL基因在保山猪背最长肌、背脂和肝脏3个组织中的相对表达量,并分析LPL基因表达量与保山猪生长性能、胴体性能的关联性。结果显示,LPL基因... 为探究保山猪LPL基因相对表达量对生长性能、胴体性能的影响,本实验采用实时荧光定量PCR技术测定LPL基因在保山猪背最长肌、背脂和肝脏3个组织中的相对表达量,并分析LPL基因表达量与保山猪生长性能、胴体性能的关联性。结果显示,LPL基因在3个组织中的相对表达量从高到低依次为:背脂、背最长肌、肝脏;LPL基因在保山猪背最长肌中的相对表达量与皮比率呈极显著负相关;在背脂中的相对表达量与眼肌面积呈显著负相关,与脂比率呈显著正相关;在肝脏中的相对表达量与生长及胴体性能无显著相关性。研究说明LPL基因对保山猪的生长及胴体性能有一定影响,对保山猪的脂肪沉积有调控作用,可作为调控保山猪脂肪沉积的候选基因。 展开更多
关键词 保山猪 LPL基因 基因表达量 生长性能 胴体性能
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FASN基因在保山猪3个组织中的表达量与背肌营养物质含量的关联分析
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作者 吴正明 龚绍荣 +6 位作者 赵加鼎 邱丙姗 李再磊 程娜 李文君 周戚斌 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第8期229-234,共6页
为了探索FASN基因在保山猪肝脏、背肌及背脂中的表达量与背肌营养物质含量的相关性,实验采用实时荧光定量PCR技术检测FASN基因在保山猪背肌、背脂、肝脏中的相对表达量,并与保山猪背肌营养物质含量进行关联分析。结果表明,FASN基因在保... 为了探索FASN基因在保山猪肝脏、背肌及背脂中的表达量与背肌营养物质含量的相关性,实验采用实时荧光定量PCR技术检测FASN基因在保山猪背肌、背脂、肝脏中的相对表达量,并与保山猪背肌营养物质含量进行关联分析。结果表明,FASN基因在保山猪3个组织中的表达趋势为:背脂>肝脏>背肌,各组织间的表达量均呈差异极显著;保山猪3个组织中FASN基因的表达量与背肌中氨基酸含量均呈不显著相关。保山猪在肝脏中FASN基因表达量与背肌中饱和脂肪酸含量呈极显著负相关,与不饱和脂肪酸含量呈极显著正相关,与棕榈酸呈显著负相关,与二十碳三烯酸、花生四烯酸和二十四烷酸均呈显著正相关。保山猪FASN基因的表达量对保山猪氨基酸含量的形成没有调控作用,对不饱和脂肪酸含量的形成具有调控作用,可作为影响保山猪不饱和脂肪酸含量的候选基因。 展开更多
关键词 FASN基因 保山猪 相对表达量 营养物质含量
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云南施甸县猪病病原调查情况
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作者 王雅 赵加鼎 +3 位作者 张海彪 杨忠刚 富国文 李朝震 《畜牧兽医科技信息》 2024年第6期169-172,共4页
为了解云南施甸地区猪病情况,该研究采集全县9个乡镇、56家猪场提供的1717个样品,利用qPCR方法检测猪病。结果显示,施甸地区病毒性疾病蓝耳、猪瘟、伪狂犬、圆环2型、圆环3型、流行性腹泻、轮状病毒、传染性胃肠炎病毒、细小、乙脑检出... 为了解云南施甸地区猪病情况,该研究采集全县9个乡镇、56家猪场提供的1717个样品,利用qPCR方法检测猪病。结果显示,施甸地区病毒性疾病蓝耳、猪瘟、伪狂犬、圆环2型、圆环3型、流行性腹泻、轮状病毒、传染性胃肠炎病毒、细小、乙脑检出率分别为25.93%、1.41%、3.59%、15.49%、14.02%、7.68%、8.71%、5.25%、0.06%、0.51%;细菌性疾病和支原体方面、大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、2型链球菌、巴氏杆菌、放线杆菌、产气荚膜梭菌、丹毒杆菌、沙门氏菌检出率分别为37.35%、4.32%、8.02%、26.54%、8.64%、12.04%、0.62%、0.62%、1.85%。 展开更多
关键词 猪病 病原 检测
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无抗条件下从肠道健康方面控制断奶仔猪腹泻的策略 被引量:5
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作者 龚绍荣 赵加鼎 于治晓 《中国饲料》 北大核心 2019年第18期17-21,共5页
在过去的几十年里,抗菌化合物已被用于预防亚临床和临床疾病,促进断奶仔猪生长等方面。但人们越来越关注细菌耐药性、耐药菌株及其相关基因对人类健康的潜在影响。欧盟从2006年1月1日起禁止在猪和家禽生产中使用抗生素作为生长促进剂。... 在过去的几十年里,抗菌化合物已被用于预防亚临床和临床疾病,促进断奶仔猪生长等方面。但人们越来越关注细菌耐药性、耐药菌株及其相关基因对人类健康的潜在影响。欧盟从2006年1月1日起禁止在猪和家禽生产中使用抗生素作为生长促进剂。此外,高锌和高铜等矿物质也具有促生长作用,但饲料中添加高锌、高铜会严重污染环境。因此,在不使用抗生素的条件下,有必要制定相应的营养和饲喂策略,以便控制与断奶过渡有关的问题。本文综述改善胃肠道结构、功能,促进断奶后仔猪生长的营养策略,重点介绍益生菌、益生元、有机酸、微量元素来源及水平。 展开更多
关键词 抗生素 肠道健康 断奶仔猪 腹泻
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云南省地方猪种精液的冷冻保存 被引量:1
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作者 李春平 赵加鼎 +2 位作者 叶吉荣 任文辉 赵家才 《养殖与饲料》 2022年第4期10-12,共3页
云南地方猪种资源丰富,品质优良,为了加强云南地方优良猪种资源的保护和可持续利用,对云南不同猪种精液进行冷冻保存。采用人工徒手法,采集撒坝猪、大河猪、滇南小耳猪和保山猪的精液,分别测定种公猪精液的采精量、精子密度和原精活力等... 云南地方猪种资源丰富,品质优良,为了加强云南地方优良猪种资源的保护和可持续利用,对云南不同猪种精液进行冷冻保存。采用人工徒手法,采集撒坝猪、大河猪、滇南小耳猪和保山猪的精液,分别测定种公猪精液的采精量、精子密度和原精活力等,并进行猪种间的比较。试验结果显示:保山猪精液质量优于滇南小耳猪、大河猪和撒坝猪,不同猪种间采精量、原精活力、精子密度、冷冻精液解冻活力差异均不显著。只要保存精液条件适宜,在40 h内精液品质下降不明显,可用于制作冷冻精液。 展开更多
关键词 地方猪种 徒手采精 离心 冷冻精液
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保山猪和杜×保仔猪MC1R基因型鉴定与分析 被引量:1
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作者 孔彩华 刘克娜 +2 位作者 王钦 隋世燕 龚绍荣 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第15期7-11,16,150,共7页
为了解释保山猪和杜洛克猪杂交后代出现毛色分离的原因,寻找判定保山猪纯种与否的分子标记,试验采用PCR扩增、分子克隆与多重序列比对技术,对保山猪MC1R基因编码区序列及杜×保仔猪(S1~S6窝)MC1R基因型进行分析。结果表明:保山猪MC1... 为了解释保山猪和杜洛克猪杂交后代出现毛色分离的原因,寻找判定保山猪纯种与否的分子标记,试验采用PCR扩增、分子克隆与多重序列比对技术,对保山猪MC1R基因编码区序列及杜×保仔猪(S1~S6窝)MC1R基因型进行分析。结果表明:保山猪MC1R基因编码区序列长度为963 bp,共编码321个氨基酸。以野猪MC1R基因编码区序列为参考,保山猪存在5个SNP位点,在翻译水平上发生2个错义突变及3个同义突变,2个错义突变为第283位碱基由G>A、第305位碱基由T>C,3个同义突变为第51位碱基由G>A,第363位碱基由T>C,第729位碱基由G>A,证实调控保山猪黑毛色的等位基因为E^(D1)。S1~S4窝为纯种的杜×保仔猪,仔猪均为全黑色,在碱基491C>T、727G>A、729C>A处均存在突变,这3个SNP位点处图谱均为双峰,基因型为E^(D1)/e;S5窝为杂种的杜×保仔猪,为黑毛、黄毛仔猪,黑毛仔猪基因型为E^(D1)/e,黄毛仔猪基因型为e/e;S6窝为杂种的杜×保仔猪,为黑毛及黑黄纵纹仔猪,其基因型均为E^(D1)/e。说明MC1R基因可以作为解释保山猪毛色分离和判断纯种与否的分子标记。 展开更多
关键词 保山猪 杜×保仔猪 MC1R基因 多重序列比对 基因型鉴定 基因型分析
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一例猫恶性鳞状上皮细胞癌伴发阴沟肠杆菌病例
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作者 龚绍荣 王韬 +1 位作者 富国文 樊月圆 《畜牧兽医科学(电子版)》 2022年第23期1-2,13,共3页
该文以临床实际接诊耳部患病猫为例,分析临床表现为暴躁、食欲不佳、有时呕吐、间歇性出现右侧耳部溃烂、恶臭,伴有血和黄色液体渗出。采取血液进行血常规检测;切取增生组织进行细胞学和病理组织学检查;收集脓液进行微生物鉴定及药敏试... 该文以临床实际接诊耳部患病猫为例,分析临床表现为暴躁、食欲不佳、有时呕吐、间歇性出现右侧耳部溃烂、恶臭,伴有血和黄色液体渗出。采取血液进行血常规检测;切取增生组织进行细胞学和病理组织学检查;收集脓液进行微生物鉴定及药敏试验。血常规结果显示白细胞升高;细胞学检查可见大量炎性细胞渗出;病理组织学检查可见组织增生,在增生组织内见到明显的角化珠和癌细胞巢,淋巴结伴有肿瘤细胞侵润,异步分化的癌巢;微生物学检查发现阴沟肠杆菌,该菌对庆大霉素敏感。检查结果表明,该猫患有中等分化恶性鳞状上皮细胞癌伴发阴沟肠杆菌感染。进行手术治疗,患猫于1月后死亡。 展开更多
关键词 鳞状上皮细胞癌 阴沟肠杆菌
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