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丹参活性成分靶点分子网络的生物信息学预测
被引量:
5
1
作者
张牧
易朝辉
+4 位作者
杨红梅
宋新强
代二琴
李开鸣
刘迎福
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2019年第6期798-801,共4页
目的:采用整合生物信息学方法预测丹参治疗心血管疾病的潜在机制。方法:从PubChem数据库中搜索丹参靶标蛋白,从NCBI数据库中搜索心血管疾病相关基因,利用IPA比较、分析搜索结果,预测丹参治疗心血管疾病的交互作用分子网络。结果:丹参治...
目的:采用整合生物信息学方法预测丹参治疗心血管疾病的潜在机制。方法:从PubChem数据库中搜索丹参靶标蛋白,从NCBI数据库中搜索心血管疾病相关基因,利用IPA比较、分析搜索结果,预测丹参治疗心血管疾病的交互作用分子网络。结果:丹参治疗心血管疾病的靶标蛋白主要有FASN、PAFAH1B2、PLA2G7、PAFAH1B3和IL-1β,这些蛋白主要涉及LXR/RXR活化、动脉粥样硬化、肝纤维化/肝星形细胞活化、急性反应期信号、FXR/RXR活化等信号传导通路;交互作用分子网络主要涉及细胞运动、免疫细胞运输、血液系统发育,参与DNA的复制、重组和修复等。结论:预测了丹参治疗心血管疾病的几个蛋白质靶点以及参与的信号途径;整合生物信息学方法可以用于分析小分子化学成分的作用机制。
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关键词
丹参
心血管疾病
生物信息学分析
分子网络
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职称材料
题名
丹参活性成分靶点分子网络的生物信息学预测
被引量:
5
1
作者
张牧
易朝辉
杨红梅
宋新强
代二琴
李开鸣
刘迎福
机构
信阳
师范
学院
医院
信阳职业技术学院心理咨询室
北京体育大学学术期刊社
信阳
师范
学院
生命科学
学院
厦门大学医
学院
基础医学系
出处
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2019年第6期798-801,共4页
基金
国家自然科学基金项目(U1804179)
河南省创新型科技团队项目(2017083)
文摘
目的:采用整合生物信息学方法预测丹参治疗心血管疾病的潜在机制。方法:从PubChem数据库中搜索丹参靶标蛋白,从NCBI数据库中搜索心血管疾病相关基因,利用IPA比较、分析搜索结果,预测丹参治疗心血管疾病的交互作用分子网络。结果:丹参治疗心血管疾病的靶标蛋白主要有FASN、PAFAH1B2、PLA2G7、PAFAH1B3和IL-1β,这些蛋白主要涉及LXR/RXR活化、动脉粥样硬化、肝纤维化/肝星形细胞活化、急性反应期信号、FXR/RXR活化等信号传导通路;交互作用分子网络主要涉及细胞运动、免疫细胞运输、血液系统发育,参与DNA的复制、重组和修复等。结论:预测了丹参治疗心血管疾病的几个蛋白质靶点以及参与的信号途径;整合生物信息学方法可以用于分析小分子化学成分的作用机制。
关键词
丹参
心血管疾病
生物信息学分析
分子网络
Keywords
Salvia miltiorrhiza Bunge
cardiovascular disease
bioinformatics analysis
molecular network
分类号
R541 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
丹参活性成分靶点分子网络的生物信息学预测
张牧
易朝辉
杨红梅
宋新强
代二琴
李开鸣
刘迎福
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2019
5
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