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阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)幼虫低温胁迫转录组分析
被引量:
2
1
作者
孙涛
张示渊
+1 位作者
张婷婷
王岩
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1113-1125,共13页
【目的】本研究旨在通过转录组测序技术分析低温胁迫引起的阿尔泰蝠蛾Hepialus altaicola Wang幼虫基因转录差异及上调表达基因的主要功能类群和参与的主要代谢通路。【方法】采用Illumina HiSeqTM 2500测序平台对阿尔泰蝠蛾幼虫进行转...
【目的】本研究旨在通过转录组测序技术分析低温胁迫引起的阿尔泰蝠蛾Hepialus altaicola Wang幼虫基因转录差异及上调表达基因的主要功能类群和参与的主要代谢通路。【方法】采用Illumina HiSeqTM 2500测序平台对阿尔泰蝠蛾幼虫进行转录组测序、组装,利用Blast软件进行数据库比对和基因功能注释,用DEGSeqR软件包分析4℃低温处理与室内适温饲养试虫的差异表达基因,并对上调表达基因进行GO和KEGG代谢途径富集分析。【结果】经序列拼接后共获得100300个unigenes,总长度81600309 bp,平均长度813 bp,N50长度1719 bp。与7大数据库同源比对,共获得34691(34.59%)条unigenes。低温胁迫转录组分析得到11569个差异表达基因(DEGs),7158条基因上调,4411条基因下调。富集到47个GO类群,217个KEGG途径。其中代谢过程、催化、结合活性类群占有重要比例,核糖体、碳代谢、剪接体等途径显著富集。另外,热激蛋白、昆虫表皮蛋白、海藻糖酶、超氧化物歧化酶等非生物胁迫相关基因显著上调表达。【结论】阿尔泰蝠蛾幼虫低温胁迫转录组分析揭示,代谢过程、细胞过程、生物调节、对刺激的反应等生物学过程相关基因和部分非生物胁迫响应基因显著上调表达,提示蝠蛾幼虫可能从抗氧化防御、分子伴侣、体温调节和维持细胞的渗透平衡等多方面应对低温胁迫。
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关键词
阿尔泰蝠蛾
转录组
基因注释
低温胁迫
差异表达基因
原文传递
题名
阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)幼虫低温胁迫转录组分析
被引量:
2
1
作者
孙涛
张示渊
张婷婷
王岩
机构
石河子大学
医学院
八
师
石河子市
总
医院
(
石河子大学
第三
附属
医院
石河子大学
动物科技学院
石河子大学
畜牧学博士后流动站
出处
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1113-1125,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32060125,81560614)
中国博士后科学基金资助项目(2016M602907)。
文摘
【目的】本研究旨在通过转录组测序技术分析低温胁迫引起的阿尔泰蝠蛾Hepialus altaicola Wang幼虫基因转录差异及上调表达基因的主要功能类群和参与的主要代谢通路。【方法】采用Illumina HiSeqTM 2500测序平台对阿尔泰蝠蛾幼虫进行转录组测序、组装,利用Blast软件进行数据库比对和基因功能注释,用DEGSeqR软件包分析4℃低温处理与室内适温饲养试虫的差异表达基因,并对上调表达基因进行GO和KEGG代谢途径富集分析。【结果】经序列拼接后共获得100300个unigenes,总长度81600309 bp,平均长度813 bp,N50长度1719 bp。与7大数据库同源比对,共获得34691(34.59%)条unigenes。低温胁迫转录组分析得到11569个差异表达基因(DEGs),7158条基因上调,4411条基因下调。富集到47个GO类群,217个KEGG途径。其中代谢过程、催化、结合活性类群占有重要比例,核糖体、碳代谢、剪接体等途径显著富集。另外,热激蛋白、昆虫表皮蛋白、海藻糖酶、超氧化物歧化酶等非生物胁迫相关基因显著上调表达。【结论】阿尔泰蝠蛾幼虫低温胁迫转录组分析揭示,代谢过程、细胞过程、生物调节、对刺激的反应等生物学过程相关基因和部分非生物胁迫响应基因显著上调表达,提示蝠蛾幼虫可能从抗氧化防御、分子伴侣、体温调节和维持细胞的渗透平衡等多方面应对低温胁迫。
关键词
阿尔泰蝠蛾
转录组
基因注释
低温胁迫
差异表达基因
Keywords
Hepialus altaicola
transcriptome
gene annotation
low temperature stress
differential expressed genes
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)幼虫低温胁迫转录组分析
孙涛
张示渊
张婷婷
王岩
《应用昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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