miR-182作为胃癌潜在生物学标志物的Meta分析及生物信息学分析

目的研究miR-182在胃癌中的表达,分析其作为胃癌生物学标志物的诊断价值及相关的分子机制。方法从GEO、TCGA及数据库获取miR-182的表达数据,使用Stata14.0软件分别对胃癌患者组织和血液/血清中miR-182的表达进行Meta分析和诊断性Meta分析。运用5个预测数据库预测miR-182的靶基因,通过GO、KEGG富集分析及蛋白质相互作用(PPI)网络分析探索miR-182在胃癌中的生物学功能和关键基因(Hub基因)。结果共纳入20个研究,包括13个胃癌组织研究和7个血液/血清研究。通过随机效应模型(SMD=1.09,95%CI:0.26~1.92)发现miR-182在胃癌组织中显著增加(I 2=96.3%,P=0.000)。此外,SROC曲线下面积、特异性和敏感度分别为0.76、0.75和0.65。在胃癌患者的血液/血清中,miR-182同样显著上调(SMD=3.37,95%CI:2.15~4.59,I 2=97.8%,P=0.000)。SROC曲线下面积、特异性和敏感度分别为0.90、0.72和0.90。GO和KEGG富集分析表明,miR-182的靶基因与多种重要通路有关。最后,通过PPI分析筛选出4个Hub基因(NRAS、CREB1、FBXW7和SOX2)。结论miR-182在胃癌样本中上调,可能通过靶向其靶基因在胃癌中发挥重要作用,其可能是胃癌诊断的潜在生物学标志物。

基于GEO数据库构建肝细胞癌预后模型

目的基于基因表达数据库(GEO)筛选肝细胞癌(HCC)差异表达基因,探索HCC发生、发展的通路及分子机制,构建肝细胞癌预后模型。方法筛选GEO数据库中的HCC基因表达芯片“GSE76427”,利用R语言的“limma”“clusterprofiler”包筛选HCC差异基因并行京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,用“survival”包行单因素COX分析并用“glmnet”包构建最小绝对收缩和选择算法(LASSO)惩罚的回归模型建立预后模型;用“survival”“survminer”“timeROC”包构建风险评分的受试者工作特征曲线(ROC);用“RMS”包绘制预后相关列线图;用癌症基因组图谱(TCGA)数据库相关数据验证。结果得到425个HCC差异基因及15个HCC预后相关基因(P<0.05)。KEGG分析发现,差异基因主要富集在化学致癌、色氨酸代谢、脂肪酸降解等通路。LASSO回归得到8个关键基因,并建立预后模型。低风险组总体生存(OS)显著高于高风险组(P=0.00097);TCGA验证队列结果显示,低风险组OS显著高于高风险组(P=0.021)。结论本研究建立8个关键基因的预后模型可有效预测HCC患者预后风险,为HCC患者的临床决策和个性化治疗提供理论基础。

内镜下套扎术在食管静脉曲张中应用及其术后再出血高危因素研究

1内镜下套扎术在食管静脉曲张中的应用肝硬化的病死率呈逐年上升趋势,肝硬化患者后期多器官受累,主要表现为肝功能损伤与门脉高压。当中心静脉与门静脉之间的压力差超过12 mmH g(1 mmH g=0.133 kPa)时,极易发生食管静脉曲张(esophageal varices,EV)破裂出血,给患者带来致死性伤害[1-3]。约有一半的肝硬化患者会出现EV症状,其中约有30%患者会出现EV破裂出血,病情发展迅速,每次出血的短期病死率高达20%[4-5]。