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无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析
被引量:
11
1
作者
孔令芳
张吉宇
+1 位作者
刘志鹏
王彦荣
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第1期268-275,共8页
以无芒隐子草干旱诱导的cDNA文库中获得的一个与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性较高的EST序列为基础,采用RT-PCR技术克隆该基因全长序列(命名为CsSAMS1),该序列全长1 399bp,编码397个氨基酸,具有SAMS基因的典型结构特征。无芒隐...
以无芒隐子草干旱诱导的cDNA文库中获得的一个与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性较高的EST序列为基础,采用RT-PCR技术克隆该基因全长序列(命名为CsSAMS1),该序列全长1 399bp,编码397个氨基酸,具有SAMS基因的典型结构特征。无芒隐子草SAMS1蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构域,其空间结构主要由α-螺旋和无规则卷曲结构构成。与近缘植物SAMS的氨基酸序列多重比较分析表明,不同植物的SAMS的氨基酸相似程度非常高(92%~100%),其中无芒隐子草与水稻的相似性最高(99%),说明SAMS基因在植物进化中非常保守。CsSAMS1基因在无芒隐子草幼苗干旱过程中的半定量和实时定量RT-PCR表达模式分析均表明,干旱胁迫诱导该基因在根中大量表达,叶中表达量变化不明显。CsSAMS1基因受干旱胁迫的诱导表达,为进一步探讨其应用于草类作物抗旱性的遗传改良奠定了基础。
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关键词
无芒隐子草
SAMS
基因克隆
定量分析
生物信息学
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职称材料
题名
无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析
被引量:
11
1
作者
孔令芳
张吉宇
刘志鹏
王彦荣
机构
兰州大学草地农业科技学院草地农业生态系统国家重点实验室农业部草地农业生态系统学重点开放实验室
出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第1期268-275,共8页
基金
国家"973"(2007CB108904)
科技部国际科技合作重点项目(2004DFA02000)
+3 种基金
国家科技支撑计划项目(2008BADB3B03)
甘肃省基金(1010RJZA105)
国家自然科学基金(31072072
30800593和31101759)资助
文摘
以无芒隐子草干旱诱导的cDNA文库中获得的一个与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性较高的EST序列为基础,采用RT-PCR技术克隆该基因全长序列(命名为CsSAMS1),该序列全长1 399bp,编码397个氨基酸,具有SAMS基因的典型结构特征。无芒隐子草SAMS1蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构域,其空间结构主要由α-螺旋和无规则卷曲结构构成。与近缘植物SAMS的氨基酸序列多重比较分析表明,不同植物的SAMS的氨基酸相似程度非常高(92%~100%),其中无芒隐子草与水稻的相似性最高(99%),说明SAMS基因在植物进化中非常保守。CsSAMS1基因在无芒隐子草幼苗干旱过程中的半定量和实时定量RT-PCR表达模式分析均表明,干旱胁迫诱导该基因在根中大量表达,叶中表达量变化不明显。CsSAMS1基因受干旱胁迫的诱导表达,为进一步探讨其应用于草类作物抗旱性的遗传改良奠定了基础。
关键词
无芒隐子草
SAMS
基因克隆
定量分析
生物信息学
Keywords
Cleistogenes songorica
SAMS
gene clone
quantitative analysis
bioinformatics
分类号
S688.4 [农业科学—观赏园艺]
S543.9 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析
孔令芳
张吉宇
刘志鹏
王彦荣
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013
11
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参考文献
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