基因表达水平与同义密码子使用关系的初步研究

提出一个预测基因表达水平和同义密码子使用的自洽信息聚类方法。将同义密码子分成最适密码子、非最适密码子和稀有密码子，认为三者的使用频率是调控基因表达水平的主要因素。基于这一观点，对Ｅｃｏｌｉ（１２１个基因）和Ｙｅａｓｔ（１０７个基因）两类生物的基因表达水平和密码子的使用，用自洽信息聚类方法进行了预测。发现高低表达基因明显分开，基因表达水平被分为四级：甚高表达基因（ＶＨ）、高表达基因（Ｈ）、较低表达基因（ＬＭ）和低表达基因（ＬＬ）；预测结果与现有的结论和实验结果保持了很好的一致性。

用信息论方法研究几类核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系

研究了Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉ，Ｂａｃｉｌｌｕｓｓｕｂｔｉｌｉｓ和ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓＹｅａｓｔ三类核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系，依照每一基因中最适密码子、非最适密码子和稀有密码子出现的概率，计算其信息熵Ｅ。首先，发现Ｅ与ＣＡＩ值保持了很好的线性关系，且三类序列的线性拟合方程非常接近，因此，用信息熵Ｅ作为描述基因表达水平的物理量是合适的；其次，三类序列的Ｅ─Ｐ（Ｒ）（稀有密码子概率）曲线都接近对数关系，说明稀有密码子在抑制基因表达水平方面，起着很重要的作用；第三，由各种关系曲线的相似性，可以推测，Ｅ．ｃｏｌｉ等原核生物与真核生物Ｙｅａｓｔ在密码子使用与基因表达水平的关系方面，其机理是相似的。

遗传信息从核酸到蛋白质构象的传输效率

从密码学的观点研究了遗传信息从核酸流向氨基酸和从蛋白质一级结构流向三级结构的信息传输问题。引入了信息传输效率的概念，其对数负正比于系统的抗干扰能力，导出了信息传输效率与序列长度的关系。发现了信息从核酸流向氨基酸（第一遗传密码）的传输效率和从氨基酸序列流向蛋白质三级结构（第二遗传密码）的传输效率大体相等，这说明了遗传信息的传输效率和抗干扰能力在以上两步传输过程中的匹配性。

拓扑量子跃迁和DNA解旋

拓扑量子跃迁和ＤＮＡ解旋罗辽复（内蒙古大学理论物理学和理论生物学研究室）关键词拓扑跃迁，ＤＮＡ，ＤＮＡ解旋中图资料分类号Ｑ６１ＱｕａｎｔｕｍＴｒａｎｓｉｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎＴｏｐｏｌｏｇｉｃａｌＳｔａｔｅｓａｎｄＤＮＡＵｎｗｉｎｄｉｎｇＬｕｏＬｉａ...