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斯氏副柔线虫线粒体CO1基因的克隆与序列分析
被引量:
2
1
作者
李文生
杨莲茹
+4 位作者
杨晓野
赵治国
赵晓慧
李鑫
王瑞
《畜牧与兽医》
北大核心
2011年第5期25-30,共6页
为研究斯氏副柔线虫(Parabronema skrjabini)种间遗传标记特点,从内蒙古地区骆驼皱胃中采集斯氏副柔线虫成虫,提取虫体DNA,利用线虫通用引物扩增细胞色素氧化酶1(CO1)基因,将其克隆到pMD19-T载体后,用PCR技术鉴定阳性菌落并进行测序,运...
为研究斯氏副柔线虫(Parabronema skrjabini)种间遗传标记特点,从内蒙古地区骆驼皱胃中采集斯氏副柔线虫成虫,提取虫体DNA,利用线虫通用引物扩增细胞色素氧化酶1(CO1)基因,将其克隆到pMD19-T载体后,用PCR技术鉴定阳性菌落并进行测序,运用DNAStar 5.0和MEGA 4.0软件将测序结果与GenBank公布的相关线虫CO1序列进行比对分析。结果显示:斯氏副柔线虫DNA扩增出的CO1基因序列片段长度为689 bp。同其他相关属线虫CO1基因序列比对,斯氏副柔线虫与小口柔线虫(Habronema microstoma)、蝇柔线虫(Habronema muscae)的同源性最高,为86.7%,遗传距离为0.143;与加利西亚光丝虫(Litomosoides galizai)的同源性最低,为80.1%,遗传距离为0.229。通过两种不同方法建立的系统发育树比较,证实斯氏副柔线虫与柔线属线虫均位于同一分支,自展值都在47%以上。表明CO1基因不仅可以作为斯氏副柔线虫理想的种间遗传标记,也可为该线虫进一步的分子分类学研究提供重要基础。
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关键词
斯氏副柔线虫
CO1基因
克隆
序列分析
原文传递
捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量:
1
2
作者
刘鑫远
杨晓野
+4 位作者
王瑞
杨莲茹
罗晓平
阿拉腾宝力格
贺志雄
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期672-676,共5页
为了解P-糖蛋白基因在捻转血矛线虫伊维菌素耐药株和敏感株间的差异,进一步弄清该基因与伊维菌素耐药性产生的关系,用PCR-RFLP方法分析了捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因hcpgp-1的多态性,并对所得序列进行测序。结果表明:捻转...
为了解P-糖蛋白基因在捻转血矛线虫伊维菌素耐药株和敏感株间的差异,进一步弄清该基因与伊维菌素耐药性产生的关系,用PCR-RFLP方法分析了捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因hcpgp-1的多态性,并对所得序列进行测序。结果表明:捻转血矛线虫伊维菌素敏感株虫体的PCR产物不能被内切酶KpnⅠ切开,而伊维菌素耐药株虫体的PCR产物可被内切酶切开;酶切后统计数据显示,10条敏感虫株全部为敏感纯合子(BB);在所检测的20条伊维菌素耐药性虫株中,抗性纯合子(AA)6个(30%),杂合子(AB)13个(65%),敏感性纯合子(BB)1个(5%)。其中,AB基因型频率最大,为优势基因型,其次为AA型,BB型比例最低。抗性等位基因A为优势基因,其频率为62.5%,敏感等位基因B的频率为37.5%。同源性分析发现,具有抗性的糖蛋白基因hcpgp-1与敏感株的同源性较低,在80.2%~89.3%之间。且发现伊维菌素耐药株hcpgp-1基因序列中,有多处碱基发生了突变。本研究结果为进一步了解P-糖蛋白在捻转血矛线虫伊维菌素耐药性产生中的作用,提供了参考数据。
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关键词
捻转血矛线虫
耐药性
伊维菌素
P-糖蛋白
PCR-RFLP
原文传递
题名
斯氏副柔线虫线粒体CO1基因的克隆与序列分析
被引量:
2
1
作者
李文生
杨莲茹
杨晓野
赵治国
赵晓慧
李鑫
王瑞
机构
内蒙
古农业大学
兽医
学院
内蒙
古出入境检验检疫局
内蒙古巴彦淖尔市乌拉特后旗潮格尔镇兽医工作站
出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2011年第5期25-30,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30660124)
内蒙古自治区自然科学基金项目(200607010401)
文摘
为研究斯氏副柔线虫(Parabronema skrjabini)种间遗传标记特点,从内蒙古地区骆驼皱胃中采集斯氏副柔线虫成虫,提取虫体DNA,利用线虫通用引物扩增细胞色素氧化酶1(CO1)基因,将其克隆到pMD19-T载体后,用PCR技术鉴定阳性菌落并进行测序,运用DNAStar 5.0和MEGA 4.0软件将测序结果与GenBank公布的相关线虫CO1序列进行比对分析。结果显示:斯氏副柔线虫DNA扩增出的CO1基因序列片段长度为689 bp。同其他相关属线虫CO1基因序列比对,斯氏副柔线虫与小口柔线虫(Habronema microstoma)、蝇柔线虫(Habronema muscae)的同源性最高,为86.7%,遗传距离为0.143;与加利西亚光丝虫(Litomosoides galizai)的同源性最低,为80.1%,遗传距离为0.229。通过两种不同方法建立的系统发育树比较,证实斯氏副柔线虫与柔线属线虫均位于同一分支,自展值都在47%以上。表明CO1基因不仅可以作为斯氏副柔线虫理想的种间遗传标记,也可为该线虫进一步的分子分类学研究提供重要基础。
关键词
斯氏副柔线虫
CO1基因
克隆
序列分析
Keywords
Parabronema skrjabini
CO1 gene
cloning
sequence analysis
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量:
1
2
作者
刘鑫远
杨晓野
王瑞
杨莲茹
罗晓平
阿拉腾宝力格
贺志雄
机构
农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室/
内蒙
古农业大学
兽医
学院
内蒙古巴彦淖尔市乌拉特后旗潮格尔镇兽医工作站
内蒙
古呼和浩特
市
回民区农牧林业水利局动物卫生监督所
出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期672-676,共5页
基金
内蒙古自然科学基金资助项目(2010BS0401)
内蒙古农业大学博士基金资助项目(BJ08-4)
内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY12082)
文摘
为了解P-糖蛋白基因在捻转血矛线虫伊维菌素耐药株和敏感株间的差异,进一步弄清该基因与伊维菌素耐药性产生的关系,用PCR-RFLP方法分析了捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因hcpgp-1的多态性,并对所得序列进行测序。结果表明:捻转血矛线虫伊维菌素敏感株虫体的PCR产物不能被内切酶KpnⅠ切开,而伊维菌素耐药株虫体的PCR产物可被内切酶切开;酶切后统计数据显示,10条敏感虫株全部为敏感纯合子(BB);在所检测的20条伊维菌素耐药性虫株中,抗性纯合子(AA)6个(30%),杂合子(AB)13个(65%),敏感性纯合子(BB)1个(5%)。其中,AB基因型频率最大,为优势基因型,其次为AA型,BB型比例最低。抗性等位基因A为优势基因,其频率为62.5%,敏感等位基因B的频率为37.5%。同源性分析发现,具有抗性的糖蛋白基因hcpgp-1与敏感株的同源性较低,在80.2%~89.3%之间。且发现伊维菌素耐药株hcpgp-1基因序列中,有多处碱基发生了突变。本研究结果为进一步了解P-糖蛋白在捻转血矛线虫伊维菌素耐药性产生中的作用,提供了参考数据。
关键词
捻转血矛线虫
耐药性
伊维菌素
P-糖蛋白
PCR-RFLP
Keywords
Haemonchus contortus
drug resistance
ivermectin
P-glycoprotein
PCR-RFLP
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斯氏副柔线虫线粒体CO1基因的克隆与序列分析
李文生
杨莲茹
杨晓野
赵治国
赵晓慧
李鑫
王瑞
《畜牧与兽医》
北大核心
2011
2
原文传递
2
捻转血矛线虫伊维菌素耐药株P-糖蛋白基因多态性的PCR-RFLP分析
刘鑫远
杨晓野
王瑞
杨莲茹
罗晓平
阿拉腾宝力格
贺志雄
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
原文传递
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