基于GEO数据库联合临床检测指标分析生物标志物对冠心病的诊断价值

目的挖掘冠心病(CHD)发展过程中的关键差异表达基因,了解其参与的主要生物过程,结合临床检测指标综合分析,并对核心基因进行蛋白印记实验验证。方法从GEO数据库获得两个CHD基因表达芯片原始数据,通过插件GEO2R对差异表达基因进行筛选,采用生物信息学技术进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析和蛋白质互作网络(PPI)分析,结合常规检测指标综合评价,以CHD大鼠模型心肌组织验证核心基因表达情况。结果两个数据库共筛选出458个共有差异表达基因,主要涉及炎症过程和脂质代谢通路。PPI分析显示Toll样受体4(TLR4)、共济失调毛细血管扩张突变(ATM)和亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)等关键基因参与了CHD中炎症相关通路;临床检测指标中CHD患者总胆固醇、同型半胱氨酸、超敏C反应蛋白等与健康人群比较,差异均有统计学意义(P<0.05);CHD大鼠心肌组织TLR4和ATM蛋白低表达。结论炎症反应和脂质代谢异常在CHD发展中发挥了重要作用,TLR4、ATM基因有望成为诊断CHD的潜在生物标志物。